真核细胞RNA提取方法及原理 ---Trizol试剂盒抽提法 邱逸敏 12级生物技术
一、研究背景 二、方法及原理
1、研究背景 1.1 RNA研究的重要性 DNA,RNA和蛋白质是三种重要的生物大分子,是生命现象的分子基础。 DNA的遗传信息决定生命的主要性状,而mRNA在信息传递中起很重要的作用。其它两大类RNA,rRNA和tRNA,同样在蛋白质的生物合成中发挥不可替代的重要功能。因此mRNA、rRNA、tRNA在遗传信息由DNA传递到表现生命性状的蛋白质的过程中举足轻重。
2、方法及原理 2.1 RNA的提取流程 1、样本前处理 2、细胞裂解 3、 RNA的纯化及获得
RNA提取流程-- 样品前处理注意点 选择新鲜的幼嫩组织 选择处于生长旺盛的时期收集细胞 选择新鲜组织,生长旺盛的组织 选择新鲜血液,不得超过4小时 选择新鲜组织,生长旺盛的组织 选择新鲜的幼嫩组织 选择处于生长旺盛的时期收集细胞
可将新鲜血液先进行红细胞裂解,得到的白细胞 然后加入一定量的TRNzol,-70℃保存较长时间 RNA提取流程-- 样品前处理中如何保存样本 可将新鲜血液先进行红细胞裂解,得到的白细胞 然后加入一定量的TRNzol,-70℃保存较长时间 使用专门的RNA样品 储存液进行储存 液氮或加入RNase抑制剂中保存, 避免反复冻融 去掉培养基,加入一定量TRNzol -70 ℃保存较长时间
RNA提取流程--细胞裂解,以释放RNA 异硫氰酸胍/酚-TRNzol总RNA提取试剂 胍盐/β-巯基乙醇—RNAprep系列RNA提取试剂盒 独特配方--RNAplant植物RNA提取试剂
RNA提取流程-- RNA的纯化及获得 1 纯化后不应存在对酶(如逆转录酶)有抑制作用物质 2 排除有机溶剂和金属离子的污染 3 蛋白质、多糖和脂类分子等的污染降低到最低程度 4 排除DNA分子的污染
2.2 RNA提取的注意事项 2.2.1 杜绝外源酶的污染 一:严格戴好口罩,手套。 二:实验所涉及的离心管,Tip 头,移液器杆,电泳槽,实验台面等要彻底处理。 三:实验所涉及的试剂/溶液,尤其是水,必须确保 RNase-Free。
2.2.2 阻止内源酶的活性 一:选择合适的匀浆方法。 二:选择合适的裂解液。 三:控制好样品的起始量。
2.2.3 明确自己的抽提目的 一:任何裂解液系统在接近样品最大起始量时,抽提成功率急剧下降。 二:RNA 抽提成功的唯一经济的标准是后续实验的一次成功,而不是得率。
2.3 Rnase 污染的10大来源 1:手指头 2:枪头 3:水/缓冲液 4:实验台面 5:内源 Rnase 6:RNA 样品7:质粒抽提 8:RNA 保存 9:阳离子 (Ca, Mg) 10:后续实验所用的酶
2.4 几种RNA提取方法 2.4.1 TRIzol法 TRIZOL试剂是直接从细胞或组织中提取总RNA的试剂。它在破碎和溶解细胞时能保持RNA的完整性。加入氯仿后离心,样品分成水样层和有机层。RNA存在于水样层中。收集上面的的水样层后,RNA可以通过异丙醇沉淀来还原。在除去水样层后,样品中的DNA和蛋白也能相继以沉淀的方式还原。乙醇沉淀能析出中间层的DNA,在有机层中加入异丙醇能沉淀出蛋白。共纯化DNA对于样品间标准化RNA的产量十分有用。
实验流程图 选择新鲜的 幼嫩组织 细胞 纯化 氯仿 RNA 水相 离心 基因组DNA 加入裂解液 有机相 (Trizol-A+) pH5.7 细胞选择 贴壁细胞 悬浮细胞 上层水相含有RNA,中间层为基因组DNA,下层有机相含有蛋白,多糖等杂质。这样我们可以通过不同的方法分别提取得到RNA,DNA和蛋白。 过渡词:我们如何来分离纯化上层水相中的RNA呢? 选择新鲜的 幼嫩组织
1 .取新鲜叶片,液氮研磨,每100mg加入 1ml Trizol 充分匀浆,室温静置5-10 min 。 2 .加入 0.2ml 氯仿,振荡 15s ,静置 3min 。 3 . 4 ℃ 离心, 12000rpm × 12min ,取上清。 4 .加入 0.5ml 异丙醇,将管中液体轻轻混匀,室温静置 15-20min 。 5 . 4 ℃ 离心, 12000rpm × 10min ,弃上清。 6 .加入 1ml 75% 乙醇,轻轻洗涤沉淀。 4 ℃ , 12000 rpm× 3min ,弃上清。 7. 室温晾干,加入30-50ul的 DEPC H 2 O 溶解, 检测。
RNA检测方法-紫外分光光度法 纯度( OD260/OD280 ) 紫外分光光度计进行测量(选择正确的稀释倍数,确保OD260 值在0.1~1.0之间) OD260/OD280< 1.7 说明有蛋白的污染 OD260/OD280 > 2.0 说明纯度很好 230nm存在高吸收表明有碳水化合物的干扰。 OD260/OD280 = 2.5 得率 紫外分光光度计进行测量,直接给出浓度
谢谢