Reaxys Fueling Discovery – Driving Innovation 2019年4月7日星期日 Reaxys Fueling Discovery – Driving Innovation 陳建丞 Trainer, Elsevier Taiwan
大綱 前言 搜尋頁面簡述 物質搜尋 反應搜尋 輸出及繪圖程式 範例說明 2019年4月7日星期日 Slide 2
前言 2019年4月7日星期日 Slide 3
找尋化學相關資訊 搜尋與閱讀 花時間 Time Time 需要找資料 從搜尋結果中再抽取需要的資訊 資料哪裡找 老師出作業 找尋化學相關資訊 搜尋與閱讀 花時間 需要找資料 老師出作業 做實驗前/後 書報討論 寫論文 資料哪裡找 期刊 書籍 專利 網路… 從搜尋結果中再抽取需要的資訊 Time Time 2019年4月7日星期日 Slide 4
較容易的搜尋方式 – Reaxys 流程化的工作方式 快速提供驗證過的詳細實驗步驟及數據 完整列出被測試過的化合物各項性質 減少建構合成流程的時間 直觀的介面 易於使用的網路介面,不必安裝軟體 由化學家所設計 任何時間及任何地點(校內)皆可使用 不受人數限制 2019年4月7日星期日 Slide 5
豐富的內涵 Reaxys Journals Gmelin Beilstein Patents 2019年4月7日星期日 Slide 6
Chemical Spider? Reaction Bioactivity Substance Ecotoxic Product or Reactant? Drug or Poison? Substance Patent/Article Ecotoxic Effect on environment? Application? Identified? Spectroscopy 2019年4月7日星期日 Slide 7
Reaxys 如何建立? – 將 journal articles and patents 抽絲剝繭 Physical Data Physical Data Spectra Spectra Bioactivity Data Bioactivity Data Natural Product Natural Product Reaxys 23 March 2010 ‹6›
發展方向 *紙本的歷史累積 *電子化的開端 *語言與搜尋方 式的改變 *簡易的介面 *資料庫的擴容 *搜尋方式再進化 2019年4月7日星期日 Slide 9
搜尋頁面簡述 2019年4月7日星期日 Slide 10
搜尋頁面可以分為繪圖區、基本條件區、條件限定區等三部分 搜尋頁面介紹 (Reactions) 2 1 搜尋頁面可以分為繪圖區、基本條件區、條件限定區等三部分 3 2019年4月7日星期日 Slide 11
四種文字輸入方式:化學名/InChi-Key/CAS-No/Smiles 兩種輸入方式 四種文字輸入方式:化學名/InChi-Key/CAS-No/Smiles 繪圖程式選擇:MarvinSketch/ChemDraw 2019年4月7日星期日 Slide 12
條件限定 可以利用不同敘述得到更好的搜尋結果 文字清單說明各文章的不同用語 2019年4月7日星期日 Slide 13
搜尋頁面介紹 (Substance and Properties) 2 1 搜尋頁面可以分為繪圖區、基本條件區、條件限定區等三部分 3 2019年4月7日星期日 Slide 14
五大分類:(自訂)/基本資料/物性/光譜/生物活性/環境毒性 條件限定 五大分類:(自訂)/基本資料/物性/光譜/生物活性/環境毒性 2019年4月7日星期日 Slide 15
搜尋頁面介紹 (Text, Authors and more) 在文字搜尋頁面中,另外提供了輸入專利號及專利出處的選項 2019年4月7日星期日 Slide 16
物質搜尋 2019年4月7日星期日 Slide 17
搜尋結果可以三種方式表現:Grid/Table/Citation 3 搜尋結果可以三種方式表現:Grid/Table/Citation 1 2 頁面上方的Breadcrumbs顯示在此次搜尋中所做的每一個動作,點擊一下即可回復至當次動作 2019年4月7日星期日 Slide 18
表格檢視 點擊文字後,內容會以清單方式呈現 2019年4月7日星期日 Slide 19
性質檢視 各項性質皆會以表列的方式呈現 2019年4月7日星期日 Slide 20
反應搜尋 2019年4月7日星期日 Slide 21
在限制條件裡,Product name提供更完整的名稱輸入功能 反應搜尋舉例 在限制條件裡,Product name提供更完整的名稱輸入功能 在繪圖程式裡,可以任意設定取代基,依照想法建立搜尋方程式 2019年4月7日星期日 Slide 22
左側篩選工具會顯示各種不同性質所包含的文章數 實驗詳細步驟可直接顯示於下方 搜尋結果 功能列 2 1 3 反應列 左側篩選工具會顯示各種不同性質所包含的文章數 實驗詳細步驟可直接顯示於下方 4 2019年4月7日星期日 Slide 23
功能列簡介 挑選有興趣的反應放在一起比較 選擇輸出數據及輸出格式 選擇不同排序方式 放大縮小圖形 2019年4月7日星期日 Slide 24
點擊分子或圖示可看詳細內容及專利宣告相關結構 反應功能簡介 Reaxys對此反應的編號 可查詢原料廠商及價格 可以立體顯示分子 可連結合成規畫工具 點擊分子或圖示可看詳細內容及專利宣告相關結構 2019年4月7日星期日 Slide 25
以最清楚的方式表現合成圖,並在下方列出所有反應提供選擇 合成規畫工具(1) 1 以最清楚的方式表現合成圖,並在下方列出所有反應提供選擇 2 2019年4月7日星期日 Slide 26
利用左側的篩選工具可更快速找到符合自己的實驗步驟 合成規畫工具(2) 按下Add可將此反應加入合成圖中 利用左側的篩選工具可更快速找到符合自己的實驗步驟 2019年4月7日星期日 Slide 27
輸出及繪圖程式 2019年4月7日星期日 Slide 28
檔案輸出 1 2 3 2019年4月7日星期日 Slide 29
改變分子繪圖程式 2019年4月7日星期日 Slide 30
自訂帳號 設定帳號後: 可自訂預設繪圖程式 可留下搜尋歷史紀錄 可設定新知通報 *帳號只在同一所校內有效 2019年4月7日星期日 Slide 31
範例說明 2019年4月7日星期日 Slide 32
研究人員可以利用 Reaxys 來進行研究,以下將以Grubbs‘ Catalysts 來示範搜尋。 April 7, 2019 Grubbs‘ Catalysts Grubbs‘ Catalysts 是相當知名的催化劑,尤其是在烯烴複分解反應中(olefin metathesis)。 其優點是可以適用於更多不同的烯取代基及溶劑。 因為如此,Grubbs‘ Catalysts 的使用範圍就更加廣泛。 通常 Grubbs’ catalysts 被區分成兩代。都可用於有機合成反應,但第二代的 Grubbs’ catalysts 具有較高的活性。 研究人員可以利用 Reaxys 來進行研究,以下將以Grubbs‘ Catalysts 來示範搜尋。 April 7, 2019 Slide 33
分子建構 當點選Atom list時可選擇多種原子 因為是要找尋各種相關的Grubbs‘ Catalysts,所以在建構分子時以設定群組的方式而不直接指定取代基。 點選左側的功能鍵,設定可參與的原子。 在鍵結上按右鍵,選擇鍵結種類。 在多取代的原子上設定 ”.s6” ,以找尋各種不同的取代。 當點選Atom list時可選擇多種原子 April 7, 2019 Slide 34
搜尋設定 搜尋時指定搜尋主題為催化劑。 在下方的Substance Data中設定主題。 當搜尋催化劑時,鍵入catalyst反而會減少搜尋結果,此時,利用 “ * ”可以幫助搜尋,catalys*表示不論是名詞、動詞、複數形等等都可以一併搜尋。 April 7, 2019 Slide 35
Hit Data 此時的搜尋結果如右圖,不論是第一代或第二代的Grubbs‘ Catalysts 都會包含在結果中。 除此之外,還可以找到相關的分子,如Hoveyda - Grubbs catalyst (由第二代修飾得到)。 April 7, 2019 Slide 36
Synthesis Plan 點擊分子下方的”synthesize” 可以建立出自己的合成流程,下方會提供多個方式可供選擇。 完成後可得右圖,上半部是合成圖,下半部顯示各步驟的反應條件。 April 7, 2019 Slide 37
taiwan.elsevier.com ,台灣官網:Reaxys 資訊下載 2019年4月7日星期日 Slide 38
www.facebook.com/reaxysclub ,FB粉絲團:最新消息與討論 2019年4月7日星期日 Slide 39
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