基因组、转录组与表观组等不同类型的肿瘤耐药分子标志的 交互验证 负责人:陈燕花 组员:郑智军、朱慧敏、 林云轻、郑宝童 指导老师:郭政、严海丹
一、立项依据 点击添加文本 二、研究内容 点击添加文本 三、技术路线 绪论 点击添加文本 四、预期成果 点击添加文本
立项依据 点击添加文本 对癌症病人进行化疗是当前治疗癌症的一个重要手段,但是肿瘤细胞对化疗药物产生耐药常常是影响肿瘤化疗效果的一个瓶颈。 因此,亟需识别肿瘤耐药基因及药效预测标志来判断患者对某特定治疗方案是否响应,从而改善患者的预后并减轻患者的负担。 点击添加文本 点击添加文本 点击添加文本
立项依据 mRNA miRNA 点击添加文本 耐药标志 点击添加文本 拷贝数变异 DNA甲 基化 点击添加文本 点击添加文本 基因 突变
某种癌症耐药的数据集很少,且大部分都是mRNA数据。那么如何充分应用已有的数据集来验证识别出的标志稳健性就是一个重要的问题。 存在的关键问题 某种癌症耐药的数据集很少,且大部分都是mRNA数据。那么如何充分应用已有的数据集来验证识别出的标志稳健性就是一个重要的问题。
项目背景 立项依据 TCGA数据样本治疗方案混杂,预后信息的意义模糊 点击添加文本 点击添加文本 点击添加文本 点击添加文本
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研究方法 基因组 转录组 交叉 验证 表观组
技术路线 耐药 标志 GEO独立数据 TCGA多维组学数据 CNV methylation CNV CNV 评估不同标志分类的耐药和敏感亚型的一致性 methylation mRNA miRNA mRNA 耐药 标志 miRNANA 交叉 验证 methylation 应用网络分析不同组学耐药标志的相关性
技术路线 研究内容 应用网络来整合不同组学数据找到的标志,系统的分析这些不同组学相关的标志是否倾向于行使相似功能来参与耐药过程,从而分析引起耐药的原因。
项目创新点 研究内容
预期成果 1、提出一种交互验证策略来寻找耐药分子标志。 2、预期成功确定癌症的不同类型的分子标志使其具有跨平台、跨实验室的可重复性。 3、发现基因组、转录组与表观组等不同类型的肿瘤耐药分子标志间的功能相关性。