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名以清修 利以义制 绩以勤勉 汇通天下 新晋商理念 李安平 名以清修 利以义制 绩以勤勉 汇通天下 新晋商理念。从97年开始振东就一直以名以清修、利以义制、绩以勤勉、汇通天下来奋斗。我们要让我们的产品汇通天下。 李安平

生物信息学简介 李云霞

一、生物信息学定义 林博士----------生物信息学之父 物学结合起来的重要意义,开始留意要为这一领域构思一 Bioinformatics 八十年代末期,林华安博士认识到将计算机科学与生 物学结合起来的重要意义,开始留意要为这一领域构思一 个合适的名称CompBio -----bioinformatique----bio-informatics (或bio/informatics)------bioinformatics 林博士----------生物信息学之父

三种的融合

生物信息 广义: 生物体系和生命过程中信 息的存贮、传递和表达 细胞、组织、器官的生理、病理 、药理过程的中各种生物信息 DNA:获取、处理、贮存、传递、分析和解释等 蛋白质:序列、结构、功能等 连锁图、数据库的建立、分析软件的开发及结构、功能模拟与预 测等

生物信息学:将计算机科学和数学应用于生物大分子信息 的获取、 加工、存储、分类、检索与分析,以 达到理解这些生物大分子信息的生物学意义的 狭义: 分子信息的获取、存贮、分析和利用 生物 分子信息 生物学深 层次的认识 生物信息学:将计算机科学和数学应用于生物大分子信息 的获取、 加工、存储、分类、检索与分析,以 达到理解这些生物大分子信息的生物学意义的 交叉学科。

完整定义: 1995年,在美国人类基因组计划(HGP)第一个五年 总结报告中给出了一个较为完整的生物信息学的定义: 生物信息学是包含生物信息的获取、处理、贮存、 分发、分析和解释的所有方面的一门学科,它综合运用数 学、计算机科学和生物学的各种工具进行研究,目的在于 了解大量的生物学意义。

二、生物信息学的发展 生物科学和 技术的 发展 人类基因组 计划的 推动 生物信息学 基本思想的产生 生物信息学 的迅速发展 二十世纪 50年代 二十世纪 80-90年代

20世纪50年代,生物信息学开始孕育 20世纪60年代,生物分子信息在概念上将计算生物学和计算机科 学联系起来 20世纪70年代,生物信息学的真正开端 20世纪70年代到80年代初期 ,出现了一系列著名的序列比较方法 和生物信息分析方法 20世纪80年代以后,出现一批生物信息服务机构和生物信息数据库 20世纪90年代后 ,HGP促进生物信息学的迅速发展 一个基因组,5-10万个基因,美国与1985年提出,旨在发现所有基 因并搞清其在染色体上的位置,破译人类全部遗传信息 。

三、生物信息学研究内容 把基因组DNA序列信息分析作为源头,在获得蛋白质编码区 的信息后进行蛋白质空间结构模拟和预测,然后依据特定蛋白质 的功能进行必要的药物设计。基因组信息学,蛋白质空间结构模 拟以及药物设计构成了生物信息学的3个重要组成部分。 目前的生物信息学基本上只是分子生物学与信息技术(尤其 是因特网技术)的结合体。生物信息学的研究材料和结果就是各 种各样的生物学数据,其研究工具是计算机,研究方法包括对生 物学数据的搜索(收集和筛选)、处理(编辑、整理、管理和显 示)及利用(计算、模拟)。

1、生物分子数据的收集与管理 EMBL; GenBank; 基因组 DDBJ 数据库 北京大学生物信息中心(CBI )成立于1997年,是欧洲分子 生物学网络组织EMBnet的中 国国家节点。 蛋白质 序列 数据库 SWISS-PROT 蛋白质 结构 数据库 PDB

2、数据库搜索及序列比较

多序列比对,可以发现同源序列。

3、 基因组序列分析 遗传图谱,分析编码基因和非编码基因,基因具体 功能,基因调控信息分析等。 4、基因表达数据的分析与处理 根据相关基因分析基因的功能 基因芯片

基因芯片

5、蛋白质结构预测 以此来了解蛋白质的功能 蛋白质折叠 预测,及模拟

四、生物信息学的主要任务 集中在基因组、蛋白质组、蛋白质结构以及与之 相结合的药物设计上 1、新基因的发现 2、非蛋白编码区生物学意义的分析 3、调控网络的分析 4、进化关系

系统发育学

5、制药 为疾病的诊断和治疗提供依据 为设计新药提供依据 例如:OV-gene

五、生物信息学所用得方法和技术 1、数学统计方法 2、动态规划方法 3、机器学习与模式识别技术 4、数据库技术及数据挖掘 5、人工神经网络技术 6、专家系统 7、分子模型化技术 8、量子力学和分子力学计算 9、生物分子的计算机模拟 10、因特网(Internet)技术

六、前景 后基因组时代: 结合生物信息学的新药创新工程即是这一 阶段的典型应用 转录 翻译 DNA RNA 蛋白 质

对,基因的数目也类似。可是鼠和人差异却很大同 样,有的科学家估计不同人种间 基因组的差别仅为 鼠和人的基因组大小相似,都含有约三十亿碱基 对,基因的数目也类似。可是鼠和人差异却很大同 样,有的科学家估计不同人种间 基因组的差别仅为 0.1%;人猿间差别约为1%, 但两者表型间的差异十 分显著。

谢 谢 !