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真核表达系统 酵母 丝状真菌 昆虫 哺乳动物细胞 转基因动物 植物反应器
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酵母表达系统的优缺点 遗传背景清楚(基因组是大肠杆菌的3.5倍) 增殖快(90min/代),培养容易,产量较高
易于研究突变与基因功能,如构建酵母人工染色体等 可以进行转录和翻译后修饰加工 提纯工艺复杂,成本高,制品纯度达不到要求,制品免疫原性差,接种剂量大
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酵母载体的基本结构 DNA复制起始区:2μ质粒和自主复制序列 选择标记:营养缺陷型和显性选择(抗药)
整合介导区:同源重组,决定整合位置和拷贝数 有丝分裂稳定区:帮助载体平均分配 表达盒 转录启动子 终止子 分泌信号序列
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酵母表达系统中载体的种类 按载体在酵母中的复制形式分为: YIp:酵母整合型载体 YRp:酵母自主复制型载体 YCp:酵母含着丝粒片段载体
YEp:酵母附加体型载体 YAC:酵母人工染色体
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昆虫表达系统 杆状病毒基因组:闭环双链DNA,88-166kb 启动子:杆状病毒科核多角体病毒的多角蛋白强启动子 表达系统
杆状病毒表达系统(BEVS) 家蚕核型多角体病毒-家蚕表达系统 宿主:鳞翅目、膜翅目、双翅目、鞘翅目、直翅目、脉翅目、毛翅目的600多种昆虫 克隆基因方法:转移载体→共转染→同源重组→空斑筛选→纯化→重组病毒
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杆状病毒表达系统优点 容量大:能插入12kb的外源基因 高表达:polh基因启动子是目前所知的最强的真核启动子;产物对宿主影响小;产物可结晶
高效:可同时表达多个基因 安全:杆状病毒对脊椎动物无病原性 具加工修饰功能:昆虫细胞较高等 家蚕易饲养
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常用宿主细胞 哺乳动物细胞常用载体 真核细胞表达元件 哺乳动物基因转移的遗传标记 基因表达的检测方法
哺乳动物细胞表达表达系统 常用宿主细胞 哺乳动物细胞常用载体 真核细胞表达元件 哺乳动物基因转移的遗传标记 基因表达的检测方法
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哺乳动物细胞表达的优点 重组DNA易转染,遗传稳定,可重复 识别和去除内含子 进行翻译后修饰
磷酸化、糖基化、二硫键、寡聚体等的形成、高级结构的正确折叠 产品的构型正确率高,可被改造成类人体源性,免疫源性好 可分泌至培养基,提纯工艺简单,成本低 可用于基因治疗
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常用宿主细胞 细胞名称 来源 已投放产品 BHK-21 地鼠幼鼠肾 凝血Ⅷ因子 CHO-K1 中国仓鼠卵巢
tPA,Ⅷ因子,EPO,G-CSF等 C127 小鼠乳腺肿瘤 GH MDCK 长耳狗肾脏 兽用疫苗 Namalwa Burkitt淋巴瘤病人的类淋巴母细胞 EPO,LT,tPA,IFN Vero 成年非洲绿猴肾 HBsAg,GH 鼠骨髓瘤细胞 骨髓瘤 tPA,抗体 COS SV40转化的绿猴肾细胞 CD34,CD69,TGF
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真核细胞表达元件 原核DNA序列 启动子 增强子 拼接信号 终止子和多聚腺苷化信号 筛选标记 动物病毒基因序列
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原核DNA序列 原核复制子 抗生素抗性基因 多克隆位点
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启动子 真核启动子:RNA聚合酶(Ⅱ)结合并起动转录的DNA序列
一般包括转录起始点及其上游约 bp序列,包含有若干具有独立功能的DNA序列元件,每个元件约长7-30bp 核心启动子元件:RNA聚合酶起始转录所必需的最小DNA序列,包括转录起始点及其上游-25/-30bp处的TATA盒。单独起作用时只能确定转录起始位点和产生基础水平的转录 上游启动子元件包括通常位于-70bp附近的CAAT盒和GC盒、以及距转录起始点更远的上游元件。与相应的蛋白因子结合改变转录效率。不同基因具有不同的上游启动子元件组成,其位置也不相同,即不同的基因表达分别有不同的调控
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哺乳类RNA聚合酶Ⅱ启动子 中常见的元件 元件名称 共同序列 结合的蛋白因子 名称 分子量 结合DNA长度 TATA box TATAAAA
TBP 30,000 ~ 10bp GC box GGGCGG SP-1 105,000 ~ 20bp CAAT box GGCCAATCT CTF/NF1 60,000 ~ 22bp Octamer ATTTGCAT Oct-1 76,000 ~ 20bp Oct-2 53,000 ~ 23bp k B GGGACTTTCC NFk B 44,000 ~ 10bp ATF GTGACGT AFT ? 20bp
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常用启动子 Rous肉瘤启动子(RSV) 巨细胞病毒启动子(CMV) SV40启动子
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增强子 增强子:是一种能够提高转录效率的顺式调控元件,最早是在SV40病毒中发现长约200bp的一段DNA,可使旁侧的基因转录提高100倍,其后在多种真核生物、甚至在原核生物中都发现了增强子 增强子通常占 bp长度,也和启动子一样由若干组件构成,其基本核心组件常为8-12bp,可以单拷贝或多拷贝串连形式存在
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增强子的作用特点 提高同一链上基因转录效率,可远距离起作用,通常距离1-4kb、但远至30kb仍能发挥作用,在基因的上游或下游都能起作用
与其序列的正反方向无关 要有启动子才能发挥作用。但增强子对启动子没有严格的专一性,同一增强子可以影响不同类型启动子的转录 增强子的作用机理虽然还不明确,但与其他顺式调控元件一样,必须与特定的蛋白质因子结合后才能发挥增强转录的作用 增强子一般具有组织或细胞特异性,许多增强子只在某些细胞或组织中表现活性,是由这些细胞或组织中具有特异性蛋白质因子所决定的
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常用增强子 LTR:Rous肉瘤病毒基因长末端重复序列 人类巨细胞病毒增强子 SV40病毒增强子
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终止信号和poly A信号 真核基因转录的终止信号与机制还不明确 poly A增加mRNA的的稳定性 多聚腺苷化所需的两种序列
位于poly A下游GU丰富区或U丰富区 位于poly A上游11-30bp处的5`-AAUAAA SV40 poly A信号
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遗传性标记 胸苷激酶基因(tk)选择系统 二氢叶酸还原酶基因(dhfr)选择系统 新霉素抗性基因(neo)选择系统
氯霉素乙酰转移酶基因(cat)选择系统
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胸苷激酶(TK)基因选择系统 TK是核苷酸补救合成途径的一个关键酶 内源性缺陷tk的宿主细胞——小鼠LMTK—细胞 HAT选择法
T:胸苷;补救合成dTTP的原料 tk—细胞的鉴别与获得:5`-溴脱氧核糖尿苷(BUdR)筛选
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二氢叶酸还原酶(DHFR)基因选择系统 DHFR:真核细胞生物合成核苷酸的关键酶,功能是催化二氢叶酸还原成四氢叶酸
筛选剂:叶酸类似物——氨基喋呤或氨甲喋呤 dhfr—缺陷型细胞——CHO细胞 正常细胞可通过提高氨甲喋呤浓度筛选 突变型dhfr基因的导入扩大筛选宿主细胞的范围
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新霉素抗性基因选择系统 新霉素(neo):即G418,一种氨基糖苷类抗生素,影响80S核糖体功能核蛋白质的合成
适用于所有的真核细胞
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氯霉素乙酰转移酶(CAT)基因选择系统 CAT:大肠杆菌Tn9转座子编码的催化氯霉素乙酰化反应的蛋白质 真核细胞缺乏CAT
常用于瞬时表达研究
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表位标记 表位:抗原决定簇即抗原分子于一特定抗体结合的化学基团,一般由少至几个氨基酸的多肽组成 用于重组DNA技术的示踪、分析、纯化(亲和)
优点 用一种抗体可鉴别不同重组蛋白 不影响蛋白功能 有利于研究蛋白功能 常用表位:6His;FLAG;LZ等
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构建含表位的重组体 使用常用密码子 注意克隆位点(限制性酶切位点)相符 5`端加上起始密码子ATG 3`端加上终止密码子
可插入蛋白酶切位点基因,以利于产生天然蛋白 其他常规构建载体的注意点
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真核表达载体 质粒:真核表达元件、真核抗性 病毒载体:改建后 SV40病毒 腺病毒 反转录病毒 痘苗病毒
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病毒基因组的结构特点 病毒基因组大小相差较大,与细菌或真核细胞相比,病毒的基因组很小 病毒基因组可以由DNA组成,也可以由RNA组成
病毒基因组的大部分是用来编码蛋白质的 病毒基因组DNA序列中功能上相关的蛋白质的基因或rRNA的基因往往丛集在基因组的一个或几个特定的部位,形成一个功能单位或转录单元 除了反转录病毒以外,一切病毒基因组都是单倍体,每个基因在病毒颗粒中只出现一次 噬菌体(细胞病毒)的基因是连续的;而真核细胞病毒的基因是不连续的
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病毒载体优点 真核细胞可识别的启动子 报告基因 可持续复制(感染周期) 部分载体可整合入基因组 部分载体本身带有完整的复制及表达元件
部分载体具有宿主细胞特异性 识别受体 假病毒颗粒
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猿猴空泡病毒(SV40) 种属分类:乳多空病毒科多瘤病毒属 双链共价闭合环状DNA(cccDNA),5243bp
20面体立体对称结构,直径45nm 以EcoRl内切酶切点作为0点分成100等分,Ori点是DNA双向复制的起绐点 早期编码进程是逆时钟方向,在病毒DNA自制前,编码的蛋白质(大T、小T抗原)与诱发宿主细胞的转化有关 晚期编码区进程为顺时钟方向,是在病毒DNA复制开始以后,编码的蛋白质为三种病毒壳体蛋白VP1、VP2和VP3,这些蛋白是病毒的结构蛋白,不参与细胞的转化过程
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SV40感染细胞模式 感染形式:随宿主的不同产生的效应不同 许可性细胞——裂解性感染(猿猴细胞)
非许可性细胞——整合入染色体(啮齿动物细胞) 半许可性细胞——既不整合也不裂解(人细胞)
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SV40载体类型 取代型重组病毒 重组病毒-质粒载体 去掉晚期区一段DNA,外源基因可插入 需辅助病毒感染 可形成病毒颗粒
保留病毒复制相关序列 插入细菌质粒序列,可在大肠杆菌种复制增殖 不形成病毒颗粒
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SV40及衍生载体的优点 可在多种细胞中表达 基因组DNA、cDNA均可表达 SV40的复制起始点 广泛宿主范围的启动子 多聚A信号
部分载体含有报告基因
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SV40及衍生载体的缺点 感染宿主范围有限 复制只能在猿猴细胞中 载体DNA分子量小,容量小 在用辅助病毒混合感染时,有野生化危险
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痘苗病毒 双链DNA病毒 180kb,编码200种左右的蛋白 可独立的在细胞质中复制转录
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痘苗病毒载体优越性 宿主范围广泛 容量大——插入的外源基因可达25kb 瞬时表达 无致癌性——本身即需接种 可作为重组活疫苗的载体
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痘苗病毒载体的缺点 分子量大,操作较困难 无剪接功能——不能插入含内含子的基因 外源基因必须插入非必需区
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构建重组痘苗病毒流程 tk基因插入质粒 tk基因内插入痘病毒早期启动子 接上多克隆位点 接上外源基因 野毒株感染细胞 导入重组载体
筛选含外源基因的重组病毒 感染敏感宿主细胞表达外源基因
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腺病毒 Ad病毒颗粒的直径为70-90nm,呈20面体立体对称型,核心外层的壳体由252个壳粒亚单位组成
双股线型DNA,DNA约占病毒重量的11-14% 不同亚型Ad病毒的DNA的G+C%含量不同,与其致瘤性能强弱有关 Ad2基因组的早期转录区有6个独立的区域: IA(EIA)、EIB、E2(E2A和E2B)、E3、E4 Ad2基因组约长36kb,EIA和EIB与Ad2的启动和转化细胞密切有关 腺病毒虽然分布广泛,其中某些亚型对动物具强致瘤性,但是从A组到E组,迄今尚未证明与人类肿瘤有病因学上的联系
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腺病毒载体 容量较大:可插入7kb 易培养、纯化 复制与转录依赖与宿主聚合酶 不整合 释放壳体蛋白,引起免疫反应
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基因的导入方法 光穿孔法:激光;悬浮细胞 冲击波:活体局部的基因转移 基因枪法:即微粒轰击;动物细胞,更适用于植物细胞
穿孔法:脉冲电场;Cytomix缓冲液;70%细胞死亡时效率最高 磷酸钙共沉淀法 脂质体法:Lipofectin;阳离子 抗体转染法:抗CD3,CD34或表面免疫求蛋白 其他:超声波法;微注射法原生质体融合法;反转录病毒感染法
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表达产物的检测技术 Western印迹法——免疫学方法——抗原-抗体反应 荧光显微镜法——表位标记的抗体与直接抗体进行荧光标记——免疫学方法
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Western印迹法 蛋白样品制备→ SDS-PAGE(按分子量大小)→电转移→一抗(特异性)→二抗→显色 敏感度:1-5ng
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样品的制备 裂解细胞 电泳加样缓冲液裂解细胞(煮沸5-10min) 抽提细胞蛋白(超声)
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SDS-PAGE 丙烯酰胺和N,N`-亚甲双丙烯酰胺交联,形成一定孔径的分离介质,孔径大小由浓度决定,具有分子筛效应
在不连续的缓冲系统,具有浓缩效应 蛋白质本身的电荷效应 SDS:阴离子去污剂,与蛋白质结合 SDS浓度大于0.05%时,使样品中的蛋白质带同样密度的电荷 电泳时使蛋白迁移只与分子量有关,且呈线性(对数分子量与迁移率),可测定分子量
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电转移 支持介质:重氮苄氧甲基纸(DBP纸)、阴离子化尼龙膜、硝酸纤维素膜(NC) 蛋白质带负电,向正极迁移
凝胶考马斯亮兰染色,检查转移是否完全 膜丽春红染色 标记分子量位置
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靶蛋白的免疫学检测 封闭非特异性结合位点,脱脂奶粉或血清白蛋白 第一抗体:具有特异性,最好氏多抗或抗血清
标记的第二抗体:同位素标记;碱性磷酸酶(AKP)标记;辣根过氧化物酶(HRP)标记 注意封闭非特异性位点 注意抗体浓度:尤其是一抗浓度
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显色反应 AKP催化5-溴-4-氯-3-吲哚磷酸与氮蓝四唑发生反应,产生深蓝色
HRP催化3,3`-二氨基联苯胺与H2O2反应产生棕色条带,易褪色,注意保存结果
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转基因动物 概念:以动物个体为基因受体的基因表达技术,并由于这种外源基因的导入而产生可以遗传的变异 这些遗传改变包括:
外源DNA至少整合到一条染色体上 由于外源DNA的插入使任一基因发生改变 由于外源DNA的插入使染色体发生重排 有意识的导入可以持久存在的遗传实体
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植物生物反应器 生物反应器:一种定向的生产系统,是为获取某种产品而定向构建和改造的装置,这种装置是最复杂最高等的生命系统
特点:自组织,自复制,自调节,自适应 优点 无污染,可持续发展 操作简单灵活 成本低廉 可直接食用 稳定,便于储藏和运输
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