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TIANGEN BIOTECH (BEIJING) CO.,LTD

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1 TIANGEN BIOTECH (BEIJING) CO.,LTD
“从RNA提取到荧光定量PCR”解决方案 ―RT系统 TIANGEN BIOTECH (BEIJING) CO.,LTD 大家好,我天根生化公司负责RNA及病毒研究专项的产品负责人,我叫周波,很高兴今天能在这里和大家共同讨论在RNA和病毒研究中关于核酸纯化方面的一些问题。 过渡词:各位老师都知道,RNA中的信使RNA是遗传信息的载体,提取RNA是分子生物学最基本的一项技术,但是因为RNA非常容易降解,这就增加了提取的难度。

2 RT-PCR原理简介 RT-PCR技术中的关键点 TIANGEN公司RT产品选择指南

3 RT-PCR原理简介 RNA cDNA 目的 片段 PCR RT

4 cDNA第一链合成法示意图(两步法)

5 一步法实验示意图(同一个反应管中)

6 RT-PCR两种方法 适用于mRNA表达量解析 适用于病毒、病原菌检测 Two Step RT-PCR效率高
cDNA分装 One Step RT-PCR 适用于mRNA表达量解析 Two Step RT-PCR效率高 使用Random和Oligo-dT 引物可以制备cDNA pool cDNA可长期保存 适用于病毒、病原菌检测 操作简单 污染几率低

7 RT引物的选择 目的片段在mRNA任何位置都能使用。通常mRNA表达量分析最适。 5’ 3’ 1,500base 2,000base
Random 6mer 1,500base 目的片段 5’ 3’ R F Gene specific Primer AAA···A 2,000base Oligo dT Primer 目的片段在mRNA任何位置都能使用。通常mRNA表达量分析最适。 目的片段在距Poly(A) Tail 2kbp以内适用。 One Step RT-PCR只能使用Gene specific Primer, 不适用于mRNA表达量分析等复数基因的检出。

8 RT-PCR原理简介 RT-PCR技术中的关键点 TIANGEN公司RT产品选择指南

9 RT反应体系 模板:总RNA,mRNA,体外转录的RNA 引物:随机引物,Oligo dT,基因特异性引物(GSP) 反转录酶:AMV
M-MLV Quant Reverse Transcriptase

10 逆转录酶的选择 AMV:禽成髓细胞瘤病毒,逆转录酶和RNA酶H活性。最适42℃。
MMLV:Moloney 鼠白血病病毒,逆转录酶,RNA酶H活性较弱。最 适37℃或42℃。 Quant Reverse Transcriptase 全新高效逆转录酶,与RNA模板的亲和力强, 对GC含量高的模板通 读效果好,质量稳定,最适37℃。

11 RNase H的作用 水解RNA-DNA杂合链中的RNA

12 RT实验要素-决定反应的特异性及灵敏性 分离高质量RNA 使用高活性的逆转录酶 提高逆转录酶保温温度 减少基因组DNA污染

13 问题1:RT-PCR没有产物 对 策 原因 分离无污染、高质量的RNA,用0.1-0.5μg乙酰BSA增加RNA的量 RNA降解或起始量少
确定退火温度适合实验中所用的引物 PCR步骤中cDNA模板不能超过反应体积的1/5 尝试其它组织 RNA降解或起始量少 RNA提取后含抑制成分 cDNA合成时引物退火 不充分 PCR失败 目的基因在组织中不 表达或表达量低

14 问题2:非特异性扩增

15 非特异性扩增 对 策 原因 用扩增级DNase1处理RNA,使用抗气雾剂的吸头 cDNA合成中使用基因特异性引物,使用递减PCR
RNA中有内源或外源DNA污染 引物和模板非特异性退火 基因特异性引物设计较差 形成引物二聚体 镁离子浓度太高 原因 用扩增级DNase1处理RNA,使用抗气雾剂的吸头 cDNA合成中使用基因特异性引物,使用递减PCR 遵循用于扩增引物设计的同样原则 设计在3’端没有互补序列的引物 优化镁离子浓度

16 问题3:弥散

17 弥 散 对 策 原因 常规PCR步骤中减少模板cDNA的量 cDNA第一链产物的含量过高 提取高质量RNA,防止被DNA污染
减少引物的用量 优化PCR反应条件,减少PCR的循环次数 提高退火温度,防止非特异性的起始及延伸 cDNA第一链产物的含量过高 DNase降解DNA产生的寡核苷酸的非特异性扩增 PCR反应中引物过多 循环数过多 退火温度过低

18 RT-PCR原理简介 RT-PCR技术中的关键点 TIANGEN公司RT产品选择指南

19 TIANGEN公司RT产品系列 目录号 产品名称 包装 价格(元) ER103-02/03/04
Quant Reverse Transcriptase 25/50/100次 850/1500/2800 KR103-03/04 Quant cDNA第一链合成试剂盒 25/100次 1000/3000 KR113 Quant一步法RT-PCR试剂盒 50次 1400 ER104-03/04 TIANScript M-MLV 5000/20000U 250/850 KR104 TIANScript cDNA第一链合成试剂盒 400/1380

20 谢谢! 谢谢!


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