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几种基本蛋白质实验技术
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SDS-PAGE Western blotting Southwestern blotting Immunochemistry
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SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳 基本原理:根据蛋白质分子量不同分离复杂蛋白质成分。
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SDS-PAGE试剂 1.制备凝胶试剂: 丙烯酰胺(单体) 亚甲双丙烯酰胺(胶联剂) 二者比例29 :1 母液浓度30% 过硫酸铵(引发剂)
N,N,N,’N’-四甲基乙二胺( TEMED) (加速剂) 十二烷基磺酸钠(SDS)(阴离子变性剂)
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2.蛋白上样缓冲液 3.电泳缓冲液 4.考马斯亮蓝R250染色液 5.脱色液
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SDS-PAGE实验过程流程如下: 凝胶制备 蛋白样品制备及上样 电泳 卸胶 染色 脱色
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凝胶制备
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梳子孔 浓缩胶 分离胶
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分子量范围与凝胶浓度 分子量范围(KDa) 凝胶浓度范围 >100 4%-7% 10-100K 8%-15%
> %-7% 10-100K %-15% < %-30%
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12% SDS-PAGE凝胶成分(15ml) 试剂及浓度 12%分离胶 纯水 4.9ml 30%丙烯酰胺 6.0ml
试剂及浓度 %分离胶 纯水 ml 30%丙烯酰胺 ml 1.5M Tris-Cl(pH8.8) ml 10%SDS ul 10%过硫酸胺 ul TEMED ul
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5% SDS-PAGE凝胶成分(6ml) 试剂及浓度 5%浓缩胶 纯水 4.2ml 30%丙烯酰胺 0.99ml
试剂及浓度 %浓缩胶 纯水 ml 30%丙烯酰胺 ml 1.0M Tris-Cl(pH6.8) ml 10%SDS ul 10%过硫酸胺 ul TEMED ul
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蛋白样品制备及上样 每个加样孔所上样蛋白总量要适中 过高:蛋白条带扭曲 过低:蛋白条带染色浅 蛋白样品需与上样缓冲液混合(1:1)
2×SDS凝胶上样缓冲液(100mM/L Tris-Cl(pH6.8), 200mM/L DTT,4%SDS,0.2%溴酚蓝,20% 甘油) 上样前样品需要沸煮3--5分钟
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电泳 上层胶电压小(80V) 使蛋白在浓缩胶和分离胶的交界处浓缩呈线状 下层胶电压加大(150V) 使蛋白样品充分分开
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卸胶: 防止凝胶破损 染色: 考马斯亮蓝染色 考马斯亮蓝R250 1
卸胶: 防止凝胶破损 染色: 考马斯亮蓝染色 考马斯亮蓝R g,甲醇225ml,冰醋酸 ml,MilliQ水定容500ml。 脱色:甲醇150ml,冰醋酸50ml,MilliQ水300ml。
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Western blotting 基本原理:
将SDS-PAGE分离的蛋白质转移至硝酸纤维素膜(nitrocellulose membrane)上,在膜上进行固相免疫化学染色,原位显示蛋白质带,从而在已知分子量的基础上对蛋白质进行定性、定量分析。
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Western blotting实验过程流程如下:
SDS-PAGE(不经染色) 电场转移 免疫化学染色
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电场转移 切下需转移凝胶,再剪下一块与凝胶块等大的硝酸纤维素膜和两块厚滤纸,均浸泡于电转移缓冲液中(25mM Tris,192mM glycine,0.1%SDS,20%甲醇 ) 至少30分钟。然后用塑料框架固定如“三明治”样。
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( + ) (— ) 固定架 滤纸 NCM 凝胶
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SDS-蛋白质复合物在电场的作用下向正极移动,达到NCM,以共价键结合在NCM上。
根据目的蛋白分子量大小设定电流(恒流)或电压(恒压)大小。
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电转移操作时应注意: 凝胶、NCM 及滤纸一定要在电转移缓冲液中浸泡; 凝胶、NCM 及滤纸大小应一致,以防电转时短路(半干转时);
一定要赶走“三明治”各层间的气泡; 电转移缓冲液中的甲醇(可促进蛋白质与NCM的结合)最好用前加入。
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转移完成后,可用丽春红染NCM,观察转移的效果;同时,转膜后的凝胶也可以进行银染或者考染,评价转移的效果。
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丽春红染色NCM (2-DE)
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银染转膜后的凝胶(2-DE)
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免疫化学染色 试剂: TBS(100mmol Tris,150mmol Nacl) 复性液 (0.3% Triton X-100于TBS中)
TBST漂洗液(0.05% TWeen-20于TBS中)
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免疫化学染色过程: 复性 把硝酸纤维素膜放入复性液中,复性5min后, Milli-Q水冲洗两遍;
封闭 把复性过的硝酸纤维素膜放入封闭液,平放于摇床上室温孵育1-2小时,或4℃放置过夜; 洗涤 弃去封闭液,用TBST洗涤3次, 10min/次; 一抗孵育 一抗与封闭液按比例混匀后,移至塑料袋中,将硝酸纤维素膜放入其中, 密封塑料袋, 于摇床上室温温育2小时; 洗涤 TBST充分3~4次,10min/次;
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二抗孵育 将辣根过氧化物酶二抗用封闭液稀释后, 将硝酸纤维素膜加入其中,室温摇床上放置2小时;
洗涤 TBST充分3~4次,10min/次; DAB显色 将二抗孵育后的硝酸纤维素膜放入显色液中,轻轻摇动3~10min,待膜上可见明显的显色斑点。
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Southwestern blotting
该方法是结合了Western blotting和southern blotting两种试验方法而发展起来的检测与特异DNA序列相结合的DNA结合蛋白的方法. 基本原理: 细胞核蛋白提取物经SDS-PAGE后,转移至NCM上,然后用标记的DNA探针检测转移至膜上的蛋白质。
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Southwestern blotting实验过程流程如下:
SDS-PAGE 电场转移 标记的DNA探针与NCM上蛋白质的杂交
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Immunochemistry 基本原理:
应用抗原与抗体结合的免疫学原理,检测细胞或组织中多肽、蛋白质及膜表面抗原和受体等大分子物质的存在与分布。
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免疫组化法一般实验过程 组织固定、石蜡包埋、切片、脱蜡 过氧化氢灭活内源性过氧化物酶 微波修复抗原 封闭 一抗、二抗孵育孵育 DAB显色
苏木素—伊红(HE)复染
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Key points 蛋白质组及蛋白质组学概念 双向电泳的原理 比较蛋白质组学实验流程 几种功能蛋白质组学研究方法的基本原理
Western blotting的基本原理及操作中的注意事项
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E-mail : yangjiyao123@163.com
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