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美国医学文献数据库PubMed 福建医科大学图书馆 林菲菲.

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1 美国医学文献数据库PubMed 福建医科大学图书馆 林菲菲

2 主要内容 一 认识Pubmed数据库 Pubmed的基本检索 三 Pubmed的高极检索(检索历史功能) 四 期刊数据库的检索
1、初步检索 2、检索结果过滤器 3、结果显示设置 4、结果输出 5、更多信息 三 Pubmed的高极检索(检索历史功能) 四 期刊数据库的检索 五 Mesh主题词检索 六 单引文匹配器(题录检索)

3 一、数据库概况 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/
NCBI:National Center for Biotechnology Information(美国国立生物技术信息中心) NCBI是目前国际上几个重要分子生物信息网站之一,是NIH底下的NLM的部门之一。 Pubmed是NCBI数据库之一。 NLM: National Library of Medicine(国立医学图书馆) NIH: National Institutes of Health (国立卫生研究所)

4 (一)主办单位:NLM创建的生物医学文献书目型数据库 (二)收录范围:
年限:1949-今 文献量: - 收录全球80多个国家和地区的5200多种生物医学期刊,大都经美国卫生健康研究院的文献选择技术评估委员会Literature Selection Technical Review Committee(LSTRC)评估挑选,由NLM和各专业协会的数据协作采集专家推荐。 - 累积了2200多万篇文献,年收录文献约40万篇,涉及37个语种,回溯至1950年的数据涉及60个语种。数据库47%为美国本土出版的文献,90%为英文文献,79%的文献有著者撰写的英文摘要。

5 PubMed是一个免费的生物医学文摘数据库,约10%论文提供全文( PubMed Central, PMC),大部分论文提供指向全文提供者(付费或免费)的链接。
学科范围: - 主要收录生物医学和健康科学以及生命科学相关领域的文献。 - 包括行为科学、健康专业所需要的化学、生物工艺学,基础研究和临床、护理、公共卫生、卫生政策发展或相关教育活动的内容。 - 2000年起增加了生物、环境科学、海洋生物、植物和动物学、生物物理学和生物化学等生命科学方面的研究内容。

6 (三)PubMed数据来源 MEDLINE(完整的核心数据) 是美国国立医学图书馆最重要的书目文摘数据库,PubMed主体部分,
1966至今的MEDLINE已标引数据,有MeSH字段和摘要,每条记录 标有[PubMed-indexed for MEDLINE] OldMDENLINE(早期的旧数据) 年间的MEDLINE数据,没有MeSH字段和摘要,每条记录标有[PubMed-OLDMEDLINE]

7 (三) PubMed数据来源 MEDLINE Inprocess(正在被标引的数据)
PubMed每天收录由Medline的期刊出版商提供的尚未经规范处理的数据,该库中的记录只有简单的书目信息和文摘,又称PreMedline 。该库中的数据每周一次转入MEDLINE,同时从PreMedline中删去。当进入MEDLINE时就会被标引,每条记录标有[PubMed-in process]。 Not MEDLINE(数据商提供的数据) 出版商提供的电子文献中MEDLINE不收录的数据。出版商一般提供的是整本期刊的信息,一部分数据每日将被添加到PreMedline中去,若有部分没有被MEDLINE收录,PubMed仍保存。每条记录标有[PubMed-as supplied by publisher]。

8 PubMed数据收录情况 Medline Not Medline
New Data Collect Medline Pre-Medline Process PubMed Not Medline OldMedline

9 点击数据库名称

10 基本检索框 高级检索 主题词检索 题录检索 期刊检索

11 例1:检索有关心瓣膜疾病(heart valve disease)诊断(diagnosis)方面的文献。
输入检索式 点击“Search” 例1:检索有关心瓣膜疾病(heart valve disease)诊断(diagnosis)方面的文献。

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17 文献类型 文献可获取内容 读者评论 出版时间 物种 语言 性别 主题 期刊来源

18 年龄 检索字段

19 例2:检索近两年有关细胞凋亡的综述文献,要求检出免费全文
内容特征: apoptosis 外部特征: last 2 years review free full text

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23 显示设置 排序 输出格式 时间 摘要 相关度 文本格式摘要 出版时间 文摘 第一作者 文本格式文摘 通讯作者 期刊 网页格式 标题

24 结果输出 文本 剪贴板 邮箱 文献管理软件

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31 按收入时间/相关度排序切换 按年统计的文章图表 标题含有检索词文献

32 查找相关文献 详细检索过程 点击See more 最近检索行为

33 点击“URL”

34 点击“Create alert”

35 点击注册帐户

36 点击注册

37 输入用户名和密码 点击登录

38 显示用户名 点击保存

39 点击“My NCBI”

40 二、高级检索 1、检索式编制(search builder) 通过字段限定和索引选词构建复杂检索式 内容特征
例3:研究更年期抑郁症激素替代疗法的非中文文献 内容特征 激素替代疗法 Hormone Replacement 更年期抑郁症 Involutional Depression 外部特征 非中文 NOT chinese

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42 输入检索词: hormone replacement

43 直接编辑检索式 执行检索结果预览 执行检索

44 例4:检索2000年以来美国斯安那州Pennington Biomedical Center 的Smith SR在期刊Diabetes上发表了多少篇文献。

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54 五、主题词检索(MeSH Database)
确定规范化主题词 查看主题词词义注释、树状结构表 选择副主题词、扩展主题词、主要主题词

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56 例5:欲查近5年研究肾衰竭饮食疗法并进一步观察其疗效的相关文献。
内容特征: renal failure diet therapy treatment outcome 外部特征: last 5 years

57 输入自由词:renal failure

58 点按规范词可获详细注解

59 主题词注释 检索式构建盒 副主题词选择

60 主题词树形结构表:显示该词的学科隶属关系
加权 扩展树:不进行下位词扩检 入口词:该规范词所代替的非规范词 主题词树形结构表:显示该词的学科隶属关系

61 一篇文献的所有主题词中,论述文献中心的主题词称主要主题词(major topic headings) ,如以下三篇文献的所有主题词中红色框里带星号的就是主要主题词

62 进一步检索肾衰竭综合疗效观察(treatment outcome)
输入新主题词: Treatment outcome 将组配检索式放入检索盒中

63 选择逻辑组配符

64 通过MeSH Database检索的结果,共85篇
检索结果更为专指

65 六、单引文匹配( Single Citation Matcher)
输入文献外部特征信息,查找特定文献。 刊名要准确,缩写要标准 著者姓名大小写不敏感 例6:查找黄国俊2006年发表在中华肿瘤杂志上的文献

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68 1、查找“65岁及以上男性老年人老年痴呆症的预防”的文献。(分别用Pubmed数据库的快速检索和Mesh主题词检索)
2、查找近五年老年人肺小细胞癌综述性文献 (语种为英文并有免费全文) 3、查找Jeannine Farina发表于《Nephrology Nursing Journal》的文章。

69 下课啦 谢谢!


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