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PubMed的MeSH词检索 及百链数据库检索
中国疾控中心信息中心 王崴 2017年9月26日
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主要内容 一、 MeSH词及其检索 二、 My NCBI个性化定制 三、 百链数据库检索
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一、 MeSH词及其检索 (一)MeSH词的结构和功能 (二)如何查找MeSH词及在查找到MeSH后如何进 行检索
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背景 医学领域同一概念多种表达的现象 标引和检索的困难
NLM 于1960年创制了Medical Subject Headings, 简称 MeSH
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MeSH 是美国国立医学图书馆用于PubMed数据库索引文献的受控叙词表。
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(一)MeSH词的结构和功能 数量 如:"Vitamin C" is an entry term to "Ascorbic Acid.”
医学主题词(Descriptors)(27,149 个,2014年) 入口词(entry terms)(218,000 个) 如:"Vitamin C" is an entry term to "Ascorbic Acid.” 补充概念记录(Supplementary Concept Records) (219,000 within a separate thesaurus. )
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种类 1、叙词 (Descriptors) 身体各系统、器官的名称、有机体的名称、疾病名称、药物名称、诊 断治疗手段和仪器、各种生命生理现象、地理名称等 形式 单个词:Liver; hypertension 复合词:顺置式 Epidermal Growth Factor Sleep apnea syndromes 倒置式 Hypertension, Malignant Hypertension, Pregnancy-Induced Hypertension, Renal 倒置目的:使同属某一大概念的主题词能集中在一起, 便于准确选词和集中同类文献
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种类 2、入口词(Entry Terms) Acetylsalicylic Acid(乙酰水杨酸) see Aspirin(阿司匹林)
主题词的同(近)义词,不作标引及检索用,仅作为查找 主题词的入口 Acetylsalicylic Acid(乙酰水杨酸) see Aspirin(阿司匹林) 3、副主题词(Subheadings,qualifier) 对主题概念进行细分的规范化词 无独立检索意义,用于对同一主题词下不同研究文献的限定 83个
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种类 4、特征词(Check Tags) 5、文献类型(Publication types)
人类/动物、男(雄)/女(雌)性、儿童/老年、病例报告、 比较研究等 体内研究,体外研究 5、文献类型(Publication types) 综述、荟萃分析、临床试验、随机对照试验、病例报告、 指南等 6、地理位置主题词(Geographic locations) 用以描述地理位置的词汇
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组织形式 字顺表(alphabetic list) 树状结构表(hierarchical/tree structure)
将 MeSH 所收主题词/入口词按字顺排列,通过词下的树 状结构号、注释及参照,揭示主题词所属范畴及其位置、 词表中词与词间的关系,供选词用 树状结构表(hierarchical/tree structure) 将 MeSH 表中的主题词按所属学科范畴划分为16大类 副主题词字顺表(Subheadings) 将83个副主题词按字顺排列,表明其组配范围和规则 如:Therapy(TH,ther 1966) (C1-26、 F3 ) 与疾病主题词组配,表明对疾病的治疗 不包括药物疗法、饮食疗法、放射疗法及外科学
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carcinoma 举例 Cancer Neoplasms tumor tumour
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包含27000多个主题词和近220000个入口词。 每年新增新主题词,淘汰不经常使用的、文献量萎缩的旧主题词。 MesH主题词表
I 主题词更新表 主题词更新表 MesH主题词表 II MesH字顺表 MesH字顺表 III MesH树状结构表 MesH树状结构表 IV MesH副主题词表 MesH副主题词表
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主题词的特点:规范/受控 写法规范 摈弃同义词 概念具有逻辑关系 可以组配副主题词
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副主题词的特点:规范/受控 写法 词义 可组配的主题范畴
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MeSH词表功能:主题标引与检索 标引: 对文献进行主题分析,用某检索语言或标识符号把文献的主题概念及其他有检索意义的特征表示出来,以此作为文献存储和检索的依据的过程。 标识: 是一种代表文献内容的标记符号,实质是标引时给予文献的主题词或分类号。 主题标引: 是将表达文献主题内容的自然语言转换成主题语言, 用规范词来描述文献内容特征的过程。
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(二)如何查找MeSH词及在查找到MeSH后如何进行检索
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主题词: 哮喘/*诊断;咳嗽/病因学;……
主题词: 哮喘/*诊断;咳嗽/病因学;……
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1. 利用CBM数据库查找 主题检索法 基本检索法 拆词浏览树状结构法 — 前列腺癌 — DNA疫苗
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前列腺癌
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1. 利用CBM数据库查找 主题检索法 基本检索法 拆词浏览树状结构法 — 基因治疗 — 慢性乙肝 — 类风湿关节炎 — 遗传代谢性疾病
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基因治疗
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将“基因治疗”作为关键词,在基本检索中检索
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显示格式——详细 输出范围——当前页 点击——打印
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出现打印格式 关注含“基因治疗”的文献的【主题词】行 找到基因治疗对应的主题词“基因疗法”
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将“基因疗法 ”输入主题检索中 中英文主题词
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利用CBM数据库查找 检索结果 前列腺癌 前列腺肿瘤 Prostatic Neoplasms 主题检索法
DNA疫苗 疫苗, DNA Vaccines, DNA 检索结果 基因治疗 基因疗法 Gene Therapy 基本检索法 慢性乙肝 肝炎, 乙型, 慢性 Hepatitis B, Chronic 类风湿关节炎 关节炎, 类风湿 Arthritis, Rheumatoid 遗传代谢性疾病 代谢缺陷, 先天性 Metabolism, Inborn Errors
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1. 利用CBM数据库查找 主题检索法 基本检索法 拆词浏览树状结构法 拆词 慢性乙肝 肝炎 拆词 遗传代谢性疾病 代谢性疾病
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拆词 1 慢性乙肝 肝炎 肝炎
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拆词 2 遗传代谢性疾病 代谢性疾病 √
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拆词 2 遗传代谢性疾病 代谢性疾病 代谢缺陷,先天性
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2.利用PubMed数据库查找 MeSH数据库法
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MeSH数据库法 rheumatoid arthritis Arthritis, Rheumatoid
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rheumatoid arthritis
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PubMed的MeSH检索中,直接输入 关键词很多检索不到MeSH词 需要借助CBM数据库查找英文主题词
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3. PubMed数据库的主题词检索 选择 主题词 构建 检索式 结果处理 举例: 肺癌的手术治疗 Lung cancer surgery
步骤: 选择 主题词 构建 检索式 结果处理
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1). 选择主题词 填入自由词或者主题词
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2). 构建检索式 主要主题词检索 缩小检索 不在主题词树形结构的下位词中扩展检索
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2). 构建检索式 添加至检索框 1 2
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3). 处理结果 结果列表 限定结果
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3). 处理结果 文献类型 检索领域 年龄 期刊种类 话题 性别 语言 物种 出版时间 评论 文字可用性 展示其他 过滤条件
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3). 处理结果 免费全文
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二、 My NCBI个性化定制 保存、提取和管理检索式 可对保存的检索式自动更新检索 可对检索结果设定过滤器 使用前需先注册
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三、 百链数据库检索 中文文献和外文文献的全文推送 地址: http://www.blyun.com/login.jsp
百链是超星读秀内嵌的一站式学术资源检索平台,整合了网络 数字资源,提高了用户获取资料的效率。 百链集成了264个数据库, 由3.8亿条元数据组成,其中外文元数据约10872万条,中文元数据约 8200万条,能够为读者提供期刊、报纸、学位论文、会议论文、专 利、标准、视频、图书等一系列海量资源检索及使用。 全文文献推送(传递)
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百链 访问方式
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百链 检索页面
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百链 外文传递
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百链 外文传递
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百链 外文传递
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百链 外文传递
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