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如何篩選重原子衍生物 1. co-crystal : 養晶時加入重原子 (JBScreen Heavy Kit)。
一.取得重原子衍生物的方法: 1. co-crystal : 養晶時加入重原子 (JBScreen Heavy Kit)。 2. Soaking : 用浸泡的方式將重原子導入晶體內。 二.實驗執行步驟： 1.選定好Xtal後將Xtal以mother liquid wash 兩次。 2.直接轉移入含heavy atom的mother liquid (無沉澱) 浸至預定時間。 3.時間到後將Xtal轉移至無heavy atom的mother liquid wash 兩次。 4.Back soaking (轉移與取代) 1hours：每隔 30 min 換一次soaking solution， 更換2次後進行Cryo-soaking，使晶體能夠抗凍。 5.上機收集數據或送到液態氮中保存。 三. 注意事項: 1.重原子非常毒!進行實驗時請戴口罩並避免沾染到皮膚，其廢棄物需另行 處理。 2.浸泡重原子的時間及濃度需經過測試，以晶體不受到損傷為原則，浸泡 時間為2小時至數月，重原子濃度約為1mM至10mM。 3.利用養晶方法取得的重原子衍生物，會有非isomorphous的問題，此時無 法使用MIR解決Phase問題，得改用SIRAS、MAD等方法。
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1.利用同步輻射的光源確定重原子是否在晶體內。
四. 檢測重原子是否進入晶體內(請依以下順序): 1.利用同步輻射的光源確定重原子是否在晶體內。 2.利用Patterson map觀察重原子是否在晶體內的固定位置。 (Patterson map可由Xtalview 或CCP4計算) 3.確定重原子特定的與晶體結合之後可利用SHELX或CCP4解析相位問題。 五.Xtalview 及 CCP4的檔案格式及使用順序: native.sca file H.A.sca file H.A.x file CCP4流程 Xtalview流程 importscale (轉換成CCP4格式的mtz檔) cad 與 scaleit (merge two data .mtz) fft_patterson (計算patterson map .map) npo (觀看patterson map) rsps (重原子位置尋找 .pdb .map) xparafin (轉換格式 .fin .df) xmerge (組合兩組數據 .fin .df) xfft (計算isomorphous patterson map .map) xcounter (觀看patterson map結果)
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