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12、Metabolism of Protein and Amino Acid
Part 1 Nutrition of Protein 一、Nitrogen Balance 正常成人pr分解代谢水平: 总400g:300g循环,100g消耗(产能排泄), 外源补充 Site: 组织内250g,消化道150g 成人分解pr主体:内源蛋白组织内分解
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氨基酸的转化 组织蛋白质 食物蛋白质 氨基酸代谢库 其他含氮化合物 (purine,pyrimide) CO2 胺类 α- 酮酸 NH3
合成 分解 消化吸收 氨基酸代谢库 (metabolic pool) 转变 脱羧基作用 合成 脱氨基作用 其他含氮化合物 (purine,pyrimide) CO2 胺类 α- 酮酸 NH3 酮体 糖 氧化供能 尿素
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Substance with nitrogen
Protein from food Synthesis in vivo Protein in vivo Resource 氨基酸代谢库Amino acid pool NH3 CO2 Fate Ammonia α-Ketoacid Amines (胺) Glucose Substance with nitrogen Urea Keto bodies Energy
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In=Out In>Out In<Out 摄入氮量和排除氮量的关系 All Nitrogen Balance-
摄入氮量=排除氮量 Positive Nitrogen Balance- 摄入氮量>排除氮量 Negative Nitrogen Balance- 摄入氮量<排除氮量 In=Out In>Out In<Out
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二、Essential ,Non-Essential
and Semi-Essential Amino Acid Essential Amino Acids 8 EAA- Lys Trp Val Leu Ile Thr Met Phe Two SEAA- His Arg
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“High Quality” Protein
*
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羧肽酶(Carboxypeptidase) 氨肽酶(Aminopeptidase)
常见蛋白酶: Trypsin Chymotrypsin Pepsin 嗜热菌蛋白酶(Thermolysin) 羧肽酶(Carboxypeptidase) 氨肽酶(Aminopeptidase)
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消化道内几种蛋白酶的专一性 氨肽酶 羧肽酶 (Phe.Tyr.Trp) (Arg.Lys) (脂肪族) 胰凝乳蛋白酶 胃蛋白酶 弹性蛋白酶
胰蛋白酶 氨肽酶 (Phe. Trp)
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水解位点 Trypsin:R1=Lys和Arg侧链(专一性较强,水解速度快)。R2=Pro 水解受抑
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Chymotrypsin 糜蛋白酶 Peptide Chain 水解位点 R1=Phe, Trp,Tyr时 水解快; R1= Leu,Met 和His水解稍慢。 R2=Pro 水解受抑。
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Pepsin胃蛋白酶 Pepsin:R1和R2=Phe, Trp, Tyr; Leu以及其它疏水性氨基酸水解速度较快。
水解位点 Pepsin:R1和R2=Phe, Trp, Tyr; Leu以及其它疏水性氨基酸水解速度较快。 R1=Pro 水解受抑
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Active Site E5-26 Trypsin Chymotrypsin Elastase cut at Lys, Arg
cut at Trp, Phe, Tyr cut at Ala, Gly O O –C–N–C–C–N– C NH3 + O O –C–N–C–C–N– C O O –C–N–C–C–N– CH3 Deep and negatively charged pocket Ser 蛋白脢家族以其專一性區來辨識基質種類,基質的特性決定辨識區的構形。 Trypsin 有一個細長的專一性口袋,帶底還有一個 Asp 189,因此其基質都是 Lys 與 Arg 等帶有正電荷的長條胺基酸。 構形的確決定了很多蛋白質的功能與作用。 Shallow and non-polar pocket COO- C Asp Non-polar pocket Juang RH (2004) BCbasics E5-26
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Thermolysin:R2=Phe, Trp, Tyr; Leu,Ile, Met以及其它疏水性强的氨基酸水解速度较快。
嗜热菌蛋白酶 水解位点 Thermolysin:R2=Phe, Trp, Tyr; Leu,Ile, Met以及其它疏水性强的氨基酸水解速度较快。 R2=Pro或Gly 水解受抑。 R1或R3=Pro 水解受抑。
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谷氨酸蛋白酶: R1=Glu、Asp(磷酸缓冲液); R1=Glu (磷酸缓冲液或醋酸缓冲液)
谷氨酸蛋白酶和精氨酸蛋白酶 水解位点 谷氨酸蛋白酶: R1=Glu、Asp(磷酸缓冲液); R1=Glu (磷酸缓冲液或醋酸缓冲液) 精氨酸蛋白酶: R1=Arg
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Trypsin、Chymotypsin、 Elastase
Part 2 Degradation, Absorption, Putrefaction and Detoxification of Proteins 只能成为Free Aa,少量二肽,三肽才能吸收。 (一)Degradation(分解,消化) Trypsin、Chymotypsin、 Elastase Pepsin peptide fragment Food Pr Duodenum (十二指肠) Stomach(胃) Carboxypeptidase B、A Small peptides (十二指肠)
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Papain, Bromelain(菠萝蛋白酶) Ficin (无花果蛋白酶)etc in Plant
Aminopeptidase Aa,Bipeptide and tripeptide etc Oligo-peptides Dipeptidase,Tripeptidase (消化道各种酶的协同作用产生) Free Aa (肠粘膜细胞) Papain, Bromelain(菠萝蛋白酶) Ficin (无花果蛋白酶)etc in Plant
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and Transformation (二)Absorption of Amino Acid ② 其它转运方式:
① Free Aa进入Cell主要方式:主动转运,需 Na+、ATP 及Carrier,转运与Na+同步进行。 ② 其它转运方式: r-Glutamyl cycle (r-谷氨酰循环),快速转运1Aa消耗3ATP,与GSH谢有关。 ③ 膜上亦有二肽,三肽转运载体蛋白,需ATP, Na+, 二、三肽入小肠粘膜细胞内再分解为Aa
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蛋白质的吸收 K+-ATPase Aa 外 膜 内 Aa 氨基酸进入组织细胞的需钠主动转运机制 Na+ K+ Na+ 载体蛋白质
ADP+Pi K+ Na+ Na+ Aa 氨基酸进入组织细胞的需钠主动转运机制
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-谷氨酰循环 细胞内 细胞膜 细 胞 外 -谷氨酰 氨基酸 -谷 氨酰 基转 移酶 | -谷氨酸 环化酶 AA 5-氧脯氨酸
半胱氨酰甘氨酸 甘氨酸 半胱氨酸 肽酶 ATP 5-氧脯 氨酸酶 ATP 谷胱 甘肽 -谷氨酰 半胱氨酸 合成酶 谷氨酸 ADP+Pi ATP ADP+Pi -谷氨酰 半胱氨酸 ADP+Pi 谷胱甘肽 合成酶
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经消化吸收的Aa进入细胞后,主要有3 fate: ① 合成新蛋白质 ② 产生许多重要生物分子的前体,如H,pu, py, V…,或分解成其它代谢产物排除体外 ③ 过多则产能,4千卡/g(糖4千卡/g,脂9千卡/g)
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氨基酸代谢概况 食物蛋白质 体蛋白 氨基酸 特殊途径 生物固氮硝酸还原 激素 卟啉 NH4+ -酮酸 CO2 胺 嘧啶 嘌呤 NH3
(次生物质代谢) 体蛋白 氨基酸 特殊途径 生物固氮硝酸还原 激素 卟啉 NH4+ -酮酸 CO2 胺 嘧啶 嘌呤 NH3 糖及其代谢中间产物 脂肪及其代谢中间产物 鸟氨酸循环 尼克酰氨衍生物 SO4 2 - TCA 肌酸胺 NH4+ 尿素 尿酸 H2O CO2
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(腐败作用) Putrefaction of Protein
大肠中细菌分解产生胺、脂肪酸、醇、酚、吲哚、甲基吲哚、硫化氢、甲烷、氨、二氧化碳、维生素等的作用。 脂肪酸、维生素等有利于机体的物质被重新吸收。 吲哚、甲基吲哚等有毒物质经过生理解毒作用而排除体外。
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腐败产物大多有毒,大部分可直接排除体外,少数由肝脏酶作用而解毒后,排除体外。
physiological detoxification (解毒) 腐败产物大多有毒,大部分可直接排除体外,少数由肝脏酶作用而解毒后,排除体外。 detoxification ways: ◇Oxidative detoxification (Specific enzyme) ◇Conjugated detoxification (毒素+无毒物)
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Part 3 Common Metabolism of Aa
一、 Deamination of AA Aa失去-NH2的作用称为脱氨基作用 ◆ Oxidative Deamination ◆ Transamination ◆ 联合脱氨(Transdeamination) ◆ Nonoxidative deamination
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★ Oxidative Deamination
-AA在酶作用下,氧化成-酮酸,同时消耗氧并产生氨的过程。 反应通式: H NH2 R-C-COOH - AA oxidase R-C-COOH +H2O2+NH3 +O2+H2O O H NH2 R-C-COOH - AA oxidase H2O R-C-COO- R-C-COOH + NH3 NH2 FP FPH2 O FPH2+O2 FP+H2O2
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1、 FAD or FMN为辅酶或辅基的脱氢酶类
(黄素酶) 受氢体不同分为2类: ⑴需氧黄(素)酶(Aerobic flavoenzyme) 氧为直接受氢体,2H+O H2O2 S-2H FMN or FAD H2O2 S FMNH2 or FADH O2 (已氧化代谢物) e.g. Amino acid oxidase or Amino acid DHase 2H ---- 需氧黄酶 ---- 2H
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不是氧为直接受氢体,催化底物脱下的氢先传给中间传递体,再传给分子氧而生成水。
⑵不需氧黄酶(Anaerobic flavoenzyme) 不是氧为直接受氢体,催化底物脱下的氢先传给中间传递体,再传给分子氧而生成水。 S-2H FMN or FAD 传递体-2H ½ O2 S FMNH 传递体 H2O or FADH2 e.g. Succinate DHase[琥珀酸脱氢酶](FAD) Acyl CoA DHase[脂肪酰CoA脱氢酶](FAD) 2H ---- 2H ---- 不需氧黄酶 2H ----
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2、NAD or NADP为辅酶的脱氢酶 (不需氧脱氢酶) S-2H NAD+ or NADP+ 传递体-2H ½ O2
S NADH+H+ or 传递体 H2O NADPH+H+ 2H ---- 2H ---- 不需氧脱氢酶 2H ----
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AA氧化酶的种类 L-AA oxidase:催化L-AA氧化脱氨,体内分布不广泛,最适pH10左右,以FAD或FMN为辅基。 D-AA oxidase:体内分布广泛,以FAD为辅基。但体内D-AA不多。 L-Glu DHase:专一性强,分布广泛(动、植、微生物),活力强,以NAD+或NADP+为辅酶。 +NAD(P)H+NH3 CH2 - COOH CHNH2 +NAD(P)++H2O 谷氨酸 脱氢酶 ATP GTP NADH变构抑制 ADP GDP变构激活 C=O 体内(正) 体外(逆)
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转氨基作用或氨基移换作用 α-氨基酸1 转氨酶 R1-CH-COO- R2-C-COO- NH+3 O || R2-CH-COO-
转氨酶催化下, α-氨基酸氨基转移到α-酮酸的酮基碳原子上,原α-氨基酸生成相应α-酮酸,而α-酮酸则形成相应的α-氨基酸 α-氨基酸1 R1-CH-COO- NH+3 | R2-C-COO- O || α-酮酸2 α-酮酸1 R1-C-COO- O || R2-CH-COO- NH+3 | α-氨基酸2 转氨酶 (辅酶:磷酸吡哆醛)
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★Transamination[转氨作用]
α-Aa与α-ketoacid之间-NH2转移作用,一种脱氨形式。 Glu Pyruvate GPT[谷丙转氨酶] α-ketoglutarate (α-kG) Ala
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吡哆素和磷酸吡哆素 磷酸吡哆素: ①磷酸吡哆醛(pyridoxal phosphate,PLP)
②磷酸吡哆胺(pyridoxamine phosphate ,PMP)。 磷酸吡哆素是转氨酶、脱羧酶、消旋酶的辅酶,转氨酶通过磷酸吡哆醛和磷酸吡哆胺的相互转换,起转移氨基的作用
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吡哆醇 吡哆醛 吡哆胺 ATP ADP ATP ADP ATP ADP 磷酸吡哆胺 磷酸吡哆醇 磷酸吡哆醛 吡哆醇氧化酶 吡哆胺转氨酶 激酶
磷酸吡哆胺转氨酶 磷酸吡哆醇 氧化酶 磷酸吡哆胺 磷酸吡哆醇 磷酸吡哆醛
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① 13种转氨酶,特异性不清楚 ②大多数Transaminase都需要α-ketoglutarate或Glu, 即对Glu专一,而对另一Aa无专一性。最重要:GPT, GOT(谷草转氨酶) Glu-Leu,Glu-Tyr…等 ③都以P-吡哆醛(PLP)为辅酶 ④转氨作用不仅可使Aa脱氨,而且-NH2转运, 血糖维持上起重要调节作用。
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Transaminations Glutamate-Pyruvate Aminotransferase Gln α-KG + +
Pyruvate Ala Glu α-KG OAA Asp (GPT in liver) Glutamate-Oxaloacetate Aminotransferase (GOT in muscle)
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意义: 转氨基作用不仅是体内多数氨基酸脱氨基的重要方式,也是机体合成非必需氨基酸的重要途径。 *通过此种方式并未产生游离的氨-氨基转运
Not all amino acids undergo transamination: Thr, Pro, lys
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联合脱氨基作用 (1)概念 (2)类型 转氨基作用和 氧化脱氨基作 用联合进行的 脱氨基作用方 式。 a、转氨酶与L-谷氨酸脱氢酶作用相偶联
b、转氨基作用与嘌呤核苷酸循环相偶联
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★ Transdeamination 联合脱氨(转氨+脱氢脱氨) ( 动物组织主要采取的方式) 指转氨+氧化脱氨-联合作用,使Aa脱氨的过程。 有两种形式: L-Glu DHase为中心的联合脱氨 Purine nucleotide Cycle [嘌呤核苷酸循环]
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1.转氨酶与L-谷氨酸脱氢酶作用相偶联 α-酮戊二酸 谷氨酸 NH3+NADH+H+ 氨基酸 α-酮酸 H2O+NAD+ L-谷氨酸脱氢酶
* 此种方式既是氨基酸脱氨基的主要方式,也为体内合成非必需氨基酸的主要方式。主要在肝、肾组织进行。
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1. 以L-Glu DHase为中心的联合脱氨 由于转氨并不能最后脱掉氨基,氧化脱氨中只有谷氨酸脱氢酶活力高,转氨基和氧化脱氨联合在一起才能迅速脱氨。 氨基的常规受体 + Aminotransferase L-Glu DHase 或NADP+ 思考题:在饥饿状态下,此途径如何运转?
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联合脱氨基作用的特点 1. 转氨基与氧化脱氨基作用偶联 2. 产生 NH3 3. 合成非必需氨基酸的重要途径 4. 肝、肾、脑中最活跃
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肌、肝中主要靠此Cycle ,脑中50%的NH3。
2、Purine nucleotide cycle 嘌呤核苷酸循环 特点: 肌、肝中主要靠此Cycle ,脑中50%的NH3。
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转氨基作用与嘌呤核苷酸循环相偶联 天冬氨酸 草酰乙酸 延胡索酸 苹果酸 此种方式主要在肌肉组织进行 N HN R-5`-P O 次黄嘌呤
(IMP) H ∣ C COOH CH2 HOOC 腺苷酸 代琥珀酸 腺苷酸代琥 珀酸合成酶 α-酮戊 二酸 氨基酸 谷氨酸 α-酮酸 转氨酶 1 腺苷酸 脱氨酶 H2O NH3 草酰乙酸 天冬氨酸 转氨酶 2 延胡索酸 N R-5`-P NH2 腺嘌呤 核苷酸 (AMP) 苹果酸 此种方式主要在肌肉组织进行
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NH3 NH2 NH2 Asp α-AA α-KG NH2 GOT AMP Glu NH2 NH2 IMP 腺苷酸代 琥珀酸 H2O GPT
腺苷酸脱氨酶 H2O 腺苷酸代 琥珀酸 NH2 GPT GOT AMP Glu Fumarate NH2 α-Keto acid OAA NH2 Malate
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嘌呤核苷酸循环联合脱氨(1) 氨基酸 -酮戊二酸 天冬氨酸 -酮酸 GOT GPT 谷氨酸 草酰乙酸
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嘌呤核苷酸循环联合脱氨(2) NH3 GTP GOT 天冬氨酸 IMP 草酰乙酸 H2O 苹果酸 延胡索酸 AMP 腺苷酸代琥 珀酸合成酶
腺苷酸代琥珀酸 AMP
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★氨基酸的脱酰胺作用 CH2 - CONH2 CHNH3+ COO- CH2 - COO- CHNH3+ Glutaminase +NH3
两种酶广泛存在于微生物、动物、植物中,有相当高的专一性。 CH2 - CONH2 CHNH3+ COO- CH2 - COO- CHNH3+ 谷氨酰胺酶 Glutaminase +NH3 + H2O CONH2 CH2 - COO- CHNH3+ 天冬酰胺酶 Asparaginase - CH2 +H2O +NH3 - CHNH3+ - COO- 中性Gln是体内-NH2贮存、运送的重要形式,它不仅为pr, py, pu等合成提供-NH2,而且是解除氨毒性的重要方式。
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★Nonoxidative deamination (多在微生物中)
包括: Direct deamination Dehydrated deamination; Desulfurated hydrogen deamination Hydrolyze deamination Reducing deamination.
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-联合脱氨!!! a、Oxidative Deamination活力低,分布不广。 体内主要途径是?? 综上所述: 除Gly、Glu外
b、Nonoxidative deamination(脱水、脱-SH,水解,还原,氧还)主要见于微生物 c、Glu DHase活力高,但主要催化肝内Glu合成 d、转氨活性高, 分布广, 但不能最后脱下-NH2 体内主要途径是?? -联合脱氨!!!
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小 结 脱氨基作用 1. 氧化脱氨 2.非氧化脱氨 3.氨基酸的脱酰胺作用(重点) 4.转氨基作用 5.联合脱氨基(两个内容,重点)
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二、Decarboxylation脱 羧 基 作 用
专一性强 AA 胺类化合物 脱羧酶 (PLP) 胺类化合物 R1 COOH H-C-NH2 - H R2 O=C - R1 COOH H-C-N= C - H R2 ︱ + + H2O ︱ ︱ 醛亚胺 PLP CO2 H2O R1 H H-C-NH2 - H R2 O=C - R1 H H-C-N= C - R2 + 一级胺 PLP
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1、Aa decarboxylation是正常代谢途径,但不是主要途
径,脱羧后形成一级胺类。 R-NH2CH2-COOH R-CH2-NH2 + CO2 2 、除His外,脱羧酶皆以P-吡哆醛为Coenzyme 以P-吡哆醛为辅酶的还有:转氨酶、脱水酶、脱-SH酶、D-Aa消旋酶 3、酶专一性很强,绝对专一。人体内无Gly、Ala、Thr、Pro、Hyp脱羧酶 4 、一级胺去路 (命运)如下: 脱羧酶(磷酸吡哆醛)
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a. R-CH2-NH2 + O2 + H2O NH3+H2O2 R-CHO R-COOH Metabolism of Lipid 一级胺
胺氧化酶 (解毒过程) NH3+H2O2 R-CHO R-COOH Metabolism of Lipid
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b. 用作药理作用物(用完必须尽快分解) Glu——γ氨基丁酸,作为神经递质 His——组胺,具有降压作用 Tyr——酪胺,具有升压功效 Lys——尸胺 Orn——腐胺 Trp——甲基色胺-粪臭素 Trp——5-OH-色胺,具有血管收缩作用 Phe——苯胺——苯胺衍生物 腐败-微生物作用产生大量胺化物
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Part 4 Metabolism of Deamination Product of AA Products: α-ketoacid Ammonium(NH3)
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一、Metabolism of Ammonia
合成新pr重新利用NH3,余大量 NH3 如不能 尽快清除而在细胞内积累,将会引起“氨中毒”:大量NH3与α-ketoglutarate 结合,而使Krebs cycle的中间物损耗过量,体内氧化过程减慢,大脑缺能所致。 血中NH3含量0.5mg% , > 1mg%即中毒昏迷。
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各种生物排NH3方式: Urea(尿素,脲) 水生动物:排Ammonium 陆生(人和其它哺乳动物):排 鸟类、爬行类:排
Uric acid 植物:不排放,以Asn、Gln形式回收利用,贮存。
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Resource of ammonia (Human and Animal) ① Aa经脱氨作用和胺的分解产生; ② 肠道细菌分解Aa产生; ③ 肾上皮细胞,由Gln分解而来。
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氨的转运(氨以Ala 和Gln 2种形式运输)
1、Ala-Glc Cycle,氨运入肝脏 Aa + Pyruvate (Muscle) Ala 经血液 循环 Liver,联合脱氨 Pyruvate Glc 血液循环 Muscle Pyruvate 再次转氨 NH3 糖异生
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1.丙氨酸-葡萄糖循环 ( alanine-glucose cycle)
(肌肉中氨的主要输出形式,占70%) ⑴ 意义: ① 肌肉中氨以无毒的丙氨酸形式运输到肝 ② 肝为肌肉提供葡萄糖 ⑵ 过程:
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Ala-Glc cycle | Urea NH3 Glc Glc NH3 NH3 -KG Glu Pyr Glu -KG Pyr Ala
Blood | Liver PROTEIN MUSCLE Muscle Urea NH3 Glc Glc AA NH3 NH3 -KG Glu Pyr Glu -KG Pyr Ala Ala Ala
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一举两得 肌肉 血液 肝 葡萄糖 葡萄糖 尿素 NH3 丙酮酸 谷氨酸 丙氨酸 α-酮戊二酸 丙氨酸 丙氨酸-葡萄糖循环 肌肉 蛋白质 葡
糖异生 尿素循环 氨基酸 酵解途径 NH3 NH3 丙酮酸 谷氨酸 丙氨酸 α-酮戊二酸 谷氨酸 丙酮酸 丙氨酸 转氨酶 丙 氨 酸 酵解 丙酮酸 α-酮戊 二酸 糖异生 丙氨酸 肌肉 剧烈运动 糖原 脱氨 NH3 蛋白质分解产能
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2.谷氨酰胺的运氨作用 (主要是脑、肌肉中氨的转运) ⑴ 过程: 临床上用谷氨酸盐 降低血氨 ⑵ 意义:
谷氨酸 + NH3 谷氨酰胺 谷氨酰胺合成酶 ATP ADP+Pi 谷氨酰胺酶 * 在脑、肌肉合成谷氨酰胺,运输到肝和肾后再分解为氨和谷氨酸,从而进行解毒。 临床上用谷氨酸盐 降低血氨 ⑵ 意义: 谷氨酰胺是氨的解毒产物,也是氨的储存及运输形式。
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2、Gln转运氨 Glu + NH3 Gln Gln Glu + NH3 谷氨酰胺合成酶 (Blood cycle) 谷氨酰胺酶
Glutamine synthetase 谷氨酰胺合成酶 (Brain,muscle etc) (Blood cycle) 谷氨酰胺酶 Glutaminase Glu + NH3 (Liver, kidney)
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Excretion of ammonium 氨的排泄
1. NH3可用于Amino acid和Amine的合成以便储存和利用 2. 也作为废物排除体外,不同动物采取不同的排除形式。 人和其它哺乳动物以Urea形式排除体外,即所谓“Ornithine Cycle or Urea Cycle”,由系列酶的催化完成。
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以Ammonium排出:NH3转变成酰胺(Gln),运到排泄部位后再分解。(原生动物、线虫和鱼类)
以Urate排出:将NH3转变为溶解度较小的尿酸排出。(陆生爬虫及鸟类) :经尿素循环(肝脏)将NH3转变为尿素而排出。(哺乳动物) 重新利用合成AA:合成酰胺(高等植物中);嘧啶环的合成(核酸代谢) 1、氨的去路: 以UREA排出
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P P P P 尿素循环(Ornithine Cycle,in liver) 1、Process(liver cell Mit) (Mit)
a. 氨甲酰- 合成 P NH4+的活化 氨甲酰磷酸合成酶-I CO2 + NH4+ + H2O NH2-CO P (Mit) 2ADP + Pi 2ATP 氨基甲酰磷酸合成酶II HCO3- + Gln NH2-CO + Glu (Cytosol) P 2ATP 2ADP + Pi CTP b. 瓜氨酸(Cit)合成 NH2-CO +鸟氨酸(Orn) 瓜氨酸 Orn转氨甲酰基酶 P
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2. Process in cytosol 瓜氨酸出Mit 精氨酰琥珀酸 Arg + Fumarate 瓜氨酸 + Asp 精氨酰琥珀酸
精氨酰琥珀酸合成酶 瓜氨酸 + Asp 精氨酰琥珀酸 ATP AMP + PPi 精氨酰琥珀酸裂合酶 Malate Arg,H2O OAA NH2-CO-NH2 鸟氨酸 (Urea) Asp
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鸟氨酸循的全过程 Urea 氨基甲酰磷酸 NH3 + CO2 + H2O 鸟氨酸 瓜氨酸 线粒体 Asp 瓜氨酸 鸟氨酸 H2O -KG
2ATP 2ADP+ Pi N-乙酰谷氨酸 氨基甲酰磷酸 NH3 + CO2 + H2O 鸟氨酸 Pi 瓜氨酸 线粒体 鸟氨酸循的全过程 Asp 瓜氨酸 Urea 鸟氨酸 H2O -KG ATP AMP+PPi Glu AA -酮酸 精氨酸代琥珀酸 胞液 OAA 精氨酸 Fumarate Malate
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尿素循环 1 2 3 5 4 线粒体 O H2N-C- 2ADP+Pi 氨甲酰磷酸 谷氨酸 谷氨酸 鸟氨酸 瓜氨酸 氨基酸 氨基酸 瓜氨酸
2ATP+CO2+NH3+H2O 2ADP+Pi 氨甲酰磷酸 -酮戊二酸 谷氨酸 谷氨酸 2 鸟氨酸 -酮戊二酸 瓜氨酸 氨基酸 -酮戊二酸 氨基酸 瓜氨酸 鸟氨酸 谷氨酸 NH2-C-NH2 O 3 尿素循环 天冬氨酸 尿素 5 精氨琥珀酸 精氨酸 4 细胞溶液 延胡索酸
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鸟氨酸循环 O NH2-C-NH2 氨基酸 谷氨酸 胞液 谷氨酸 尿素 鸟氨酸 H2O 鸟氨酸 氨甲酰磷酸 精氨酸 线粒体 延胡索酸 瓜氨酸
2ATP+CO2+NH3+H2O H2O 鸟氨酸 2ADP+Pi 氨甲酰磷酸 精氨酸 线粒体 延胡索酸 瓜氨酸 精氨琥珀酸 AMP+PPi 基质 瓜氨酸 ATP 天冬氨酸 -酮戊二酸 草酰乙酸 谷氨酸 氨基酸
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尿素循环与柠檬酸循环的联系 Mit CO2+NH4+ α-KG 瓜氨酸 Asp Glu 氨甲酰磷酸 OAA 精氨酸代琥珀酸 鸟氨酸
Malate Arg Fumarate Cycle Cytosol
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(1)氨甲酰P供1分子NH2、Asp 供 1分子NH2,CO2提供1分子CO2 (2)Arg-琥珀酸合成需 1ATP(2 高能键)
每合成一个Urea循环一次,需: (1)氨甲酰P供1分子NH2、Asp 供 1分子NH2,CO2提供1分子CO2 (2)Arg-琥珀酸合成需 1ATP(2 高能键) (3)1分子urea入肾、尿排出 总耗能4高能键 (4)酶类 Mit:氨甲酰-P合成酶,2ATP,Orn转氨甲酰酶(Cit) Cyt:Arg-琥合成酶,耗2高能键 Arg-琥裂合酶 ,Arg酶(Arginase),Asp 转氨酶 Glu脱氢酶 酶缺陷病人将NH3中毒:智力迟钝,神经发育停滞。 小儿忌pr,喂α-酮戊二酸及酮酸
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•生理意义:体内氨的主要去路, 解氨毒的重要途径。
CO2 2NH3(其中1分子来自于天冬氨酸*) 4ATP 限速酶:精氨酸代琥珀酸合成酶 总反应方程式: 2NH3 + CO2 + 3ATP + H2O Urea + 2ADP + AMP + 2Pi +PPi •生理意义:体内氨的主要去路, 解氨毒的重要途径。 鱼类等水生,NH3 + Glu Gln(运出细胞) Glu+NH 水 鸟类,尿酸(uric acid)合成复杂,NA代谢中提到。
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二、Metabolism of α-keto acid
脱羧骨架 FA metabolism(amine胺、aldehyde醛、acid酸) CO2-排出及合成新物质 NH3-合成New Aa,Protein and Urea 脱氨后的α-keto acid骨架: 20种不同keto acid分解方式不同,可以生糖或生酮。但最终都进TCA Cycle,按进入方式可分为6类。
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1、生成Aa α- keto acid NEAA(非必需氨基酸) 2、氧化成CO2和H2O
Pyruvate、OAA 、α-ketoglutarate TCA Cycle 3、转变为FA和Sugar Glucogenic Aa (All non-essential Aa,13/14) Ketogenic Aa (Lys ?, Leu) Glucogenic with Ketogenic Aa (Ile、Lys、Phe、Trp、Tyr,5)即 异赖3芳 如Ala、Ser、Cys也可形成AcCoA OAA, 生糖Aa和生酮Aa的界定并非严格 Amination
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氨基酸碳骨架进入三羧酸循环的途径 进入方式 2 进入方式 1 进入方式 3 苯丙氨酸 酪氨酸 亮氨酸 赖氨酸 色氨酸 丙氨酸 苏氨酸 甘氨酸
丝氨酸 半胱氨酸 进入方式 1 异亮氨酸 亮氨酸 缬氨酸 葡萄糖 丙酮酸 磷酸烯醇式酸 乙酰CoA 乙酰乙酰CoA 进入方式 3 天冬氨酸天冬酰氨 草酰乙酸 苯丙氨酸 酪氨酸 天冬氨酸 谷氨酸 谷氨酰胺 精氨酸 组氨酸 脯氨酸 延胡索酸 柠檬酸 异亮氨酸 甲硫氨酸 缬氨酸 琥珀酰CoA -酮戊二酸 氨基酸碳骨架进入三羧酸循环的途径
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氨基酸、糖及脂肪代谢的联系 T A C 脂肪 糖 葡萄糖或糖原 甘油三酯 α-磷酸甘油 脂肪酸 磷酸丙糖 PEP 丙氨酸 半胱氨酸 丝氨酸
苏氨酸 色氨酸 丙酮酸 乙酰乙酰CoA 酮体 异亮氨酸 亮氨酸 色氨酸 乙酰CoA 亮氨酸 赖氨酸 酪氨酸 色氨酸 苯丙氨酸 草酰乙酸 柠檬酸 天冬氨酸 天冬酰胺 T A C CO2 延胡索酸 α-酮戊二酸 谷氨酸 精氨酸 谷氨酰胺组氨酸 缬氨酸 苯丙氨酸 酪氨酸 琥珀酰CoA CO2 异亮氨酸 蛋氨酸 丝氨酸 苏氨酸 缬氨酸
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Part 5 Catabolism of Amino Acids
一、One Carbon Group Metabolism 具一个C原子的基团称一C单位,体内一C单位包括: 甲基 -CH3 亚甲基 -CH2-(甲叉基,甲烯基) 次甲基 -CH=(甲川基,甲炔基) 甲酰基 -HCO 亚氨甲基 -CH = NH(亚氨甲基) 羟甲基 -CH2OH 凡属一C单位的转移和转化都叫一C单位代谢 一C代谢与FH4,FH2,S-腺苷-Met有关
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载体:THFA(F THFA)还原酶催化,NADPH2供氢
部位:N5 和 N10
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一C单位供体Aa 一C单位除与Aa代谢有关外,还与Pu、Py合成,肾 上腺素、肌酸、胆碱、卵磷脂合成有关,生物学意义重要。
主要来源:苏、组、甘、 甲 、丝 (记住!!) 1、Gly 甲川FH4 (PuC8);甲酰FH4(PuC2) 2、Thr 乙醛 + Gly 3、Ser 甲叉FH4 + Gly 4、His 亚氨甲基FH4;甲川FH4 5、Met S-腺苷-Met Met 是近50种物质的CH3供体,如肌酸、胆碱,肾上腺素等。失去的甲基由N5-CH3-FH4补充,供给。
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二、Catabolism of Gly and Ser
TCA CYCLE PYRUVATE Ser Gly 甘氨酸代谢途径
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三、 Catabolism of Met ,CysH and Cys
Met S-腺苷 Met S-腺苷同型Cys 同型Cys (高Cys) PPi + Pi ATP CH3 腺苷 FH4 N5-CH3-FH4 Propionyl CoA Succinyly CoA TCA CYCLE
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游离Cys极少,CysH与Cys的代谢基本相同 。
Cys Pyruvate + NH3 H2SO4 3-磷酸腺苷-5-磷酸硫酸 (活性硫酸根) 牛黄酸 Other Metabolism
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× × Phe Tyr Other metabolism 尿黑酸 Attention:!!!!!
四、Catabolisn of Tyr, Trp and Phe × 酪胺、肾上腺素、黑色素等 Phe Tyr Phe hydroxylase Other metabolism 尿黑酸 尿黑酸氧化酶 × 乙酰乙酸(生酮) 延胡索酸(生糖) 苯乙酸 苯乳酸 黑色物质 Attention:!!!!! Phe hydroxylase缺,患苯丙酮尿症(Phenylketonuria) 尿黑酸氧化酶基缺,患黑酸尿症(Alcaptonuria)
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Phenylketonuria (PKU) Disease
苯丙酮尿症 Deficiency of Phe hydroxylase Occurs in 1:16,000 live births in U.S. Seizures, mental retardation, brain damage Treatment: ?? Screening of all newborns mandated in all states Tyr Phe Phenylpyruvate (urine) Transamination
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①转化为Pyruvate AcCoA(生糖和生酮)
Trp (生糖、酮) ①转化为Pyruvate AcCoA(生糖和生酮) ② 转化为尼克酸 (合成维生素原料,特例,但少) NAD/NADP ③ 转化为5-羟基色胺(动物,血管收缩、体温调节等) ④ 转化为吲哚乙酸(植物生长刺激素)
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Tryptophan Metabolism: Serotonin Formation
Indole ring CO2 hydroxylase Trp 5-Hydroxy- Tryptamine (5-HT); (Serotonin) Decarboxylase O2 Tryptophan (Trp) 5-Hydroxy-tryptophan
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Serotonin Metabolism: Melatonin
2 Steps Melatonin Serotonin Melatonin: Formed principally in pineal gland Synthesis controlled by light, among other factors Induces skin lightening Suppresses ovarian卵巢function Possible use in sleep disorders (松果腺)
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五、Metabolism of Other Aa (自学) (一)Leu, Ile and Val (代谢途径相似) Leu AcCoA + AcAcCoA Ile AcCoA + Propionyl CoA Val Propionyl CoA Succinyl CoA
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(二) Catabolism of Thr Thr Gly + 乙醛(转化为AcCoA) α-ketobutyrate
(Liver、kidney and some microorganism) α-ketobutyrate Propionyl CoA Butyrate + Propionate (Some microorganism) (三) Catabolism of His His Glu (四) Catabolism of Lys Lys Glu + AcAcCoA
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(六)Catabolism of Ala 、Glu and Asp
(五)Catabolism of Arg Arg Urea + Orn Orn Glu (六)Catabolism of Ala 、Glu and Asp Affter Oxidative Deamination and Transamination, Form Pyruvate, α-ketoglutarate and OAA ? Another improtant rout of Glu is GAGA 支路: Glu脱羧的γ-aminobutyrate 是神经递质和大脑细胞能源物质。
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GABA Formation Glutamate Gamma-aminobutyrate (GABA)
decarboxylase CO2 Glutamate Gamma-aminobutyrate (GABA) γ-氨基丁酸 GABA is an important inhibitory neurotransmitter in the brain Drugs (e.g., benzodiazepines苯(并)二氮卓类,苯(并)二氮卓类) that enhance the effects of GABA are useful in treating epilepsy (癫痫)
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六 Aa and Bioactive Substance Aa是很多物质的前体,如 H,V,CoE,生物碱,卟啉,抗菌素,色素,神经递质。
① GSH 在Aa转运入Cell中(已讲)。同时,它是机体氧化还原体系的重要成员。 ② 肌酸- (脊椎动物贮能形式) -肌酸在骨肌中含量较丰富,是脊椎动物贮能的一种形式。非脊椎中则为 -Arg。 P P P
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乙酰胆碱是兴奋性神经递质,胆碱经胆碱乙酰化E 催化而成乙酰胆碱.
③ GABA( -NH2-丁酸) -氨基丁酸是抑制性神经递质 ④ 5-OH-Trp与吲哚乙酸、组胺 5-OH-Trp是一种血管收缩素,升压 Trp—吲哚乙酸催熟(植物) 组胺是一种血管舒张素,降压。 ⑤ 乙酰胆碱与卵磷脂 由Ser形成,Met提供甲基 乙酰胆碱是兴奋性神经递质,胆碱经胆碱乙酰化E 催化而成乙酰胆碱. 卵磷脂是生物膜重要组份
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⑥ 卟啉 卟啉是血色素,胆红素,Cyt,叶绿素等环的核心部分,它们的基本结构都是四吡咯环。合成吡咯环的是 Gly + 琥珀酰CoA——胆色素原(吡咯环衍生物) ⑦ Tyr与黑色素、肾上腺素、多巴胺 ⑧ Cys与牛黄酸 ⑨ 甲基苯丙胺—过份兴奋
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Summarization 1、内源和外源性蛋白质主要靠各种Proteases水解为Aa ① 合成New Protein; ② 产生许多重要生物分子的前体,如H,pu, py, V… ③分解成其它代谢产物排除体外 2、Free Aa进Cell有 2 ways: ①Positive transform主动转运 ② r-Glutamyl cycle,ATP、GSH参加
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3、Aa入细胞后,脱羧( R-CH2-NH2 + CO2 );
脱氨(α-Keto acid 和Glu的转氨最重要。方式:转氨-氧化脱氨和嘌呤核苷酸循环)。转氨酶(PLP)和NDA/NADP参加。 4、氨的转运形式为Gln。 5、Urea通过尿素循环形成,直接前体为Arg,Asp和ATP等参加。 6、生糖Aa(非必须氨基酸),2种生酮Aa (Leu, Lys? ), 生糖兼生酮Aa (异赖3芳) 7、 Aa的碳骨架以6 pathways enter TCA Cycle
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① Ala, Ser, Cys, Gly, Thr Pyruvate AcCoA
② Asp and Asn OAA ③ Gln, His, Pro, Arg Glu α-ketoglutarate Succinyl CoA AcCoA ⑤ Phe ,Leu,Tyr,Lys,Trp AcAcCoA AcCoA ⑥ Tyr, Phe Fumarate ④ Met, Ile, Val
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Part 6 Anabolism of AA 1、不同生物合成Aa的能力不同,合成的种类差异大。机体维持正常生长所必需,自身不能合成,只有从外界获得的Aa,叫EAA(人和大白鼠为10种)。能自己合成的为NEAA。 2、氨基酸合成碳骨架来源于TCA CYCLE、EMP、PPP。按其途径划分为:
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①α-酮戊二酸提供碳骨架 包括Glu、Met、Thr、Ile、Lys(以OAA)
② 3-磷酸甘油酸提供碳骨架 包括Ser、Cys、Gly ③ 其始物为赤藓糖-4-磷酸和PEP 包括Phe 、Tyr、Trp(Trp合成中还有PRPP和Ser参加) ④ His合成是嘌呤核苷酸代谢的一个分支。合成需要PRPP(5-磷酸核糖-1-焦磷酸)和ATP的N-C基团
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一、氨的同化 生物体N的来源 定义:生物体将无机态氨转化为含氮有机化合物的过程(N素亦称生命元素)
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生物固N机制的研究历史: :完整的细胞水平(分离固氮微生物) :无细胞水平(发现固N需要铁氧还蛋白等 作电子传递体,需要ATP等) 1966-目前:分子水平(Nitragenase固N酶纯化,组分I为钼铁蛋白;组分II为铁蛋白,1992年测定其空间结构)
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硝酸还原生成(植物体中的N源) 氨同化的途径 Glu的形成途径 氨甲酰磷酸形成途径 NO3- NH3 NO2- AA 其它含N 化合物
亚硝酸还原酶 硝酸还原酶 NH3 NO2- AA 其它含N 化合物 Pro
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1、Glu合成途径 NH3 Glu other AA Glu DHase(细菌) CH2 - COOH C=O CH2 - COOH
CHNH2 +NH3 +NADH +NAD+ +H2O 此反应要求有较高浓度的NH3,足以使光合磷酸化解偶联,不可能是无机氨转为有机氮的主要途径 α-KG (From TCA cycle)
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谷氨酰胺合成酶(高等植物的主要途径) CH2 - CONH2 CHNH2 COOH CH2 - COOH CHNH2 +NH3 +ATP
+ADP +Pi+H2O 谷氨酰胺(贮存了氨) 可做为NH3的供体将其转移 CH2 - CONH2 CHNH2 COOH CH2 - COOH C=O CH2 - COOH CHNH2 +2H + 2 Glu合成酶 总反应: NH3 +ATP + α-酮戊二酸+2H 谷AA+ADP+H2O+Pi
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2、氨甲酰磷酸合成途径(微生物和动物) 原料:NH3 CO2 ATP 氨甲酰激酶 NH3 + CO2 + ATP O
利用体内代谢的氨 原料:NH3 CO2 ATP 氨甲酰激酶 氨甲酰磷酸 Mg2+ NH3 + CO2 + ATP O H2N-C-OPO3H2 + ADP = 氨甲酰磷酸合成酶 辅因子 NH3 + CO2 + 2ATP O H2N-C-OPO3H2 + 2ADP+Pi Mg2+ 在植物体中,氨甲酰磷酸中的氮来自谷氨酰胺的酰胺基,不是由氨来的。
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二、氨基酸的合成 主要通过转氨基作用 AA-R1 α-酮酸R2 转氨酶 α-酮酸R1 AA-R2 许多氨基酸可以作为氨基的供体,其中最主要的是谷氨酸,其被称为氨基的“转换站”,先 Glu 其它AA。 氨基酸合成 { 有C架( α-酮酸) AA提供氨基(最主要为Glu,领头AA)
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1、丙氨酸族氨基酸的合成 包括:Ala、Val、Leu 共同碳架:EMP中的Pyruvate 记住!!! CH2 - COOH C=O CH2 - COOH CHNH2 COOH CH3 C=O - COOH GPT - CHNH2 + + - - CH3
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丙氨酸族其它氨基酸的合成 Val 2 Pyruvate α-酮异戊酸 α-酮异己酸 Leu CH3 CH3 - CH3-CH CH3-CH
转氨基 CO2 2 Pyruvate α-酮异戊酸 缩合 转氨基 α-酮异己酸 Leu CH3 CH3 - CH3-CH CH3-CH - - CH2 - C=O - C=O - COO- - COOH α-酮异戊酸
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2、丝氨酸族氨基酸的合成 包括:Ser、Gly、Cys Gly碳架:光呼吸乙醇酸途径中的乙醛酸 COOH + + - CH2 C=O Glu
CHNH2 COOH CHO - COOH CH2NH2 - + + 乙醛酸 Gly Glu α-KG
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COOH CH2OH CHNH2 - 2 Ser还有其它合成途径 碳架:EMP中的3-磷酸甘油酸 记住哦! H2O COOH
+NH3+CO2 +2H+ + 2e- Gly Ser Ser还有其它合成途径 碳架:EMP中的3-磷酸甘油酸 记住哦!
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- CHNH2 - HO-CH - COOH CHNH2 - HO-CH - Ser C=O - COOH C=O CH2O-P COOH
磷酸化途径 3-磷酸丝氨酸 3-磷酸甘油酸 COOH HO-CH CH2O-P - 转氨 3-磷酸羟基丙酮酸 H2O 磷酸酶 Pi H2O COOH CH2OH CHNH2 - COOH HO-CH CH2OH - Pi Ser COOH C=O CH2OH - 氧化 转氨基 甘油酸 3-羟基丙酮酸 非磷酸化途径
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Ser +乙酰-CoA O-乙酰-Ser + CoA
半胱氨酸的合成途径(植物或微生物中) 转乙酰基酶 Ser +乙酰-CoA O-乙酰-Ser + CoA O-乙酰-Ser + 硫化物 Cys +乙酸 三种氨基酸的关系 提供硫氢基团 乙醛酸 Gly Ser Cys 3-磷酸甘油酸
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半胱氨酸的合成途径(动物中) H2O L-高半胱氨酸 + Ser 胱硫醚 L-Cys H2O
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{ 3、天冬氨酸族氨基酸的合成 共同碳架:TCA中的OAA!!! 记住哈!! 包括:Asp、Asn、Lys、Thr、Met、Ile CH2
- COO- C=O CH2 - COO- CH+NH3 CH2 - COO- CH+NH3 CH2 - COO- C=O 转氨 + + 天冬酰胺合酶 Mg2+ { Asp + NH3 + ATP Asn + H2O + AMP + PPi Asp + Gln + ATP Asn + Glu + AMP + PPi (植,细菌) (动)
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天冬氨酸族其它氨基酸的合成 OH O= C-O-P=O CH2 - COOH CHNH2 OH - CH2 - CHNH2 - COOH
ATP ADP OH - CH2 NADPH+H+ Asp kinase - CHNH2 - Asp kinase COOH NADP+ CH2 - CHO CHNH2 COOH 天冬氨酰磷酸 Asp β-天冬 氨酸半醛 L-高丝氨酸 Met α,ε-二氨基庚二酸 Thr CO2 Ile (4个C来自Asp,2个C来自丙酮酸) Lys
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几种氨基酸的关系 OAA Lys Thr Met Ile Asn Asp β-天冬氨酸半醛
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4、谷氨酸族氨基酸的合成 包括:Glu、Gln、Pro、Hyp、Arg 共同碳架:TCA中的α-KG!!! α-KG Glu 为还原同化作用
DHase α-KG+ NH3 +NADH Glu +NAD+ +H2O Synthetase Glu +NH3 +ATP Gln+ADP+Pi+H2O (动物和真菌,不普遍) Glu合酶 Gln + α-KG Glu(普遍) NADPH+H+ NADP+
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由Glu Pro - - CH2 COOH CHNH2 CH2 COOH CHNH2 CHO H2C CH2 HC N CHCOOH
(△’-二氢吡咯-5-羧酸) CH2 - COOH CHNH2 CH2 - COOH CHNH2 CHO NAD(P)H NAD(P)+ H2C CH2 HC N CHCOOH Mg2+ ATP ADP (谷氨酰半醛) NADH H NAD+ HO C CH2 H2C NH CHCOOH H2C CH2 NH CHCOOH 1/2O2 (羟脯AA) (Pro)
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由Glu 其它AA CH2 - CH2NH2 CHNH2 COOH CH2 - COOH CHNH2 COOH CHO - - CH2
鸟氨酸 N-乙酰谷氨酰半醛 CH2 - CH2NH2 CHNH2 COOH CH2 - COOH CHNH2 COOH CHO - - CH2 NADPH+H+ NADP+ CH2 转乙酰酶 转氨作用 - - CH2 CH2 AcCoA CoA O= O= - - HC-NH-C-CH3 HC-NH-C-CH3 - - COOH COOH CH2 - CHNH2 COOH NH CH2 - CHNH2 COOH NH NH2 CH2 - CHNH2 COOH NH NH2 COOH 氨甲酰磷酸 C-NH2 - C=N-CH C=O - - - - CH2 转甲酰酶 - - - - COOH 裂解酶 磷酸 精氨酸 延胡索酸 天冬氨酸 精氨酰琥珀酸 瓜氨酸
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几种氨基酸的关系 Asn α-KG Glu Pro 羟脯AA Arg 鸟AA 瓜AA
131
5、组氨酸族和芳香族氨基酸合成!! 包括:His、Trp、Tyr、Phe His族碳架:PPP中的磷酸核糖
芳香族AA碳架:4-磷酸-赤藓糖(PPP)和PEP(EMP) N 来自ATP CH2 HC C CH-NH2 COOH - CH 来自核糖 NH 来自谷氨酰胺的酰胺基 从Glu经转氨作用而来
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芳香族氨基酸的关系 Trp PEP 4-磷酸赤藓糖 莽草酸 分支酸 预苯酸 Tyr Phe
若将莽草酸看作芳香族氨基酸合成的前体,因此芳香族氨基酸合成时相同的一段过程叫莽草酸途径
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