实际上,对于我国的生物医学科研工作者来说,在文献检索方面存在着诸多的实际困难,其中一些困难是我国特有的。 引言 据有关报道称,一个临床医生每天要阅读专业文献19篇,才能跟上本领域的发展趋势。而对于一个专门从事研究的科研工作者来说,这个数字应该远远大于19篇。实际上,由于个人精力有限,几乎没有人做到这个数字。这就要求科研人员能够有良好的检索能力和文献评价能力,在较短的时间内完成对文献的检索和评价,获得对自己科研工作有价值的信息。 ★ 如何在短时间内,有效对应海量文献对阅读时间、检索能力、评价文献能力的挑战? ★如何在短的时间内,快速汲取所得文献精华,并保持与世界当前医疗水平的最大同步? ★如何在获取知识的同时,实现对知识通道的发掘、获得和占有? 实际上,对于我国的生物医学科研工作者来说,在文献检索方面存在着诸多的实际困难,其中一些困难是我国特有的。
以上是几乎每一位生物医学科研工作者都能碰到的检索经历,其中的很多环节让我们在具体开展检索工作时感到十分困惑和难以应付。 进入PubMed,输入检索词 出现检索结果 文献太多不知如何选择 如果有Free Fulltext 如果没有Free Fulltext 检索成功,大功告成 登录自己的图书馆查找 无法获取全文 国外同事或朋友帮忙 付费下载? 还是得不到? 偶尔为之,不能长久 极其昂贵 垂头丧气 以上是几乎每一位生物医学科研工作者都能碰到的检索经历,其中的很多环节让我们在具体开展检索工作时感到十分困惑和难以应付。
主管单位:中华人民共和国卫生部 主办单位:中华医学会 新一代检索工具 康健循证医学知识仓库 http: // www.kjebm.com 主管单位:中华人民共和国卫生部 主办单位:中华医学会 承办单位:北京康健世讯公司 中华医学电子音像出版社出版 服务专线:400-650-0371
目录 一、FMJS系统 二、FEBM系统 1.检索方式简介与举例 2.应用举例 3.附词汇解释 2.循证文献页面中的功能按钮 1.系统功能介绍及登陆 2.应用举例 3.附词汇解释 二、FEBM系统 1.检索方式简介与举例 2.循证文献页面中的功能按钮
FMJS介绍 《西文生物医学期刊文献数据库》简称FMJS (Foreign Medical Journal Full-Text Service) 为”十一五”国家重点电子出版物规划项目。 FMJS是中华医学会主办的国家正式电子连续出版物 ; 国际标准连续出版物号为: ISSN 1673-8292 国内统一刊号为 : CN11-9281/R。
收刊情况: FMJS作为中华医学会主办的国家正式电子连续出版物,收录了1995年至今的外文生物医学期刊8000余种,涵盖:全部Medline期刊5400余种、SCIE期刊3500余种、OA期刊3000余种。数据每月更新,数据总量近900多万条,内容涉及医学、医学生物学、药学、药物化学、卫生保健及医学边缘学科等各领域。 FMJS三大期刊来源 1、整合收录我国每年花巨额费用订购的散布在各医学图书馆中的纸本期刊3000余种,其中年订费在十万以上的有四百多种,如:《神经生物学进展》(Prog Neurobiol,影响因子09.140)、《药物学与治疗学》(Pharmacol Ther,影响因子08.897)、等刊的年订费均在二十万以上。 2、整合收录近2000余种我国还未进口的付费Medline医学期刊,如:《外科感染》(Surg Infect)、《俄罗斯免疫学杂志(Russ J Immunol)、《日本麻风病学会杂志》(Nihon Hansenbyo Gakkai Zasshi)等。 3、整合收录散布在互联网上各学科核心、重要的Open Acess期刊3000余种,如:《癌》(CA Cancer J Clin,影响因子87.925)、《新英格兰医学杂志》(N Engl J Med,影响因子47.050)、《生理学评论》(Physiol Rev,影响因子37.726)等众多高质量期刊。
FMJS独特价值分析 作为目前国内最好的外文生物医学期刊文献情报服务系统,FMJS实现了一站式的检索和揭示,即: (1)整合8000余种期刊,实现一站式检索分布于纸版期刊、OA期刊、国内还未进口的Medline期刊等资源,是国内收录最全的外文期刊数据库; (2)提供多项智能化检索(如主题词、自由词、期刊导航、策略检索等),保证检索的查精、查准和查全的服务目标; (3)通过对知识评价工具(Google查引、SCI期刊查收、同行评议、PubMed相关文献)的整合,使用户能够掌握那些最前沿、最重要、最有价值的医学信息; (4)揭示文献的多种全文获取通道,实现对文献全文获取多通道的揭示。 FMJS的核心价值,不单单是帮助用户一站式地找到所需一次文献的全文获取通道,更重要的是找到与临床决策相关的知识和答案!!
FMJS能给医学院校及其附属医院带来什么? 1、提升医、教、研水平方面,创效增收 FMJS提供的一站式的检索有效解决国内用户获取外文文献查找难、花费高、耗时长的难题,而且可显著提升其互联网医学信息资源利用能力和文献评价能力。 FMJS使得中国医生能够拥有一种已经达到国际标准的检索、获取、利用医学信息的平台,能够在正确的时间、以正确的方式获取正确有用的文献,藉此解决医疗和科研中的问题! 2、满足资源需求方面,保障有力 外文期刊价格昂贵,实力强的大型医院多则也仅能订购几百种期刊(包括数据库的电子刊),经费多的医学院校虽能购买数十个数据库,但期刊种类依然不到3000种,而且这些国外的资源每年都以15%的价格递增。相比之下,FMJS在此基础上额外多出近4000多种核心、重要期刊,这些资源恰恰能有效满足广大用户的“校(院)外期刊需求”! 3、系统操作使用方面,便捷高效 医学院校中使用的数据库,大部分资源分散,用户要查找一篇文献,一般都要逐个入库检索,耗时长,效率低;同时,用户也很难掌握数十个数据库的使用方法,因此,检索方面的不便导致很多资源无法有效利用。FMJS为全中文界面,并按照中国医生的检索习惯设计多项情报按钮,方便用户通过一次检索就能达到查全、查准、查精的目的。 4、摒弃资源共享弊端方面,自由无“限” 经过调查,作为资源利用大户,为保证内部正常使用,医学院校订购的资源对其附属医院的用户都进行了较高的限制(如登陆数、并发数限制、IP地址限制等)。因此,医学院校附属医院的医生想用的时候不一定能得到保证。相比之下,FMJS从源头上摒弃了资源共享的弊端,提供互联网版、局域网版、康健贵宾版(即VIP卡)三种服务模式,能让所有用户摆脱资源限制使用的苦恼,随时随地共享资源。
我们对FMJS数据库已经有了一个概括性的了解。 接下来我们一看看如何登陆以及每个功能的操作!
1.1、系统登陆及功能介绍 1、院内局域网题录镜像登陆 ( http://192.168.30.13 I) 2、互联网登录方式 (网址:http://www.kjebm.com 在正式用户位置输入用户密码)用户名:w3562243密码:46183258 3、贵宾卡用户登录 (进入康健网站由贵宾卡进入系统) (以本单位购买的使用方式为准)
1、院内局域网题录镜像登陆 1
2
3
2. 互联网登录方式 1.选择我们要登陆的系统( 有几个服务器选任何一个都可以) 2. 互联网登录方式 1.选择我们要登陆的系统( 有几个服务器选任何一个都可以) 2.如果手中有用户名密码请到这里输入后点击登陆即可 3.如果手中有VIP贵宾卡请先安装手动安装驱动后再点击登陆即可(只需第一次安装即可)
功能介绍 数据库首页 功能导航
1.期刊导航 刊名导航:按字母A-Z排列点击进某本刊。 期刊过滤器,可以过滤出六类期刊 影响因子 红色上标:表示升高 绿色下标:表示下降 期刊导航栏:按中图法分类 点击“+”号可以展开二级目录。
期刊简介 期刊收录情况
2.复合检索 复合检索即高级检索,检索项有:题名\关键词\刊名\摘要\作者\机构\ID号,可以使用AND,OR,NOT三种逻辑关系
主题词检索 可以先检索出对应相关主题词,然后根据提示找主题词链接检索。 主题词树状结构:点击“+”号可以展开下一级目录。
点击后进入 输入“血液”,可以检索出对应相关的37条主题词,血液主题词:Blood 中文主题词:血液
主题词“血液(Blood) ”以及其副主题词,可以根据需要勾选条件,默认为全选 确定了主题词以及副主题词后,点这里检索相关文献
自由词检索 在这里输入检索词 可以选择限定条件
自由词检索--二次检索 可以选择限定条件,进行二次检索 在这里输入二次检索词
三、应用举例 检索题目:老年人肝肿瘤手术切除后的存活率研究 1.关键词检索: Liver Neoplasms(肝肿瘤) Hepatectomy(肝切除) Postoperative Complications (手术后并发症)
在系统“自由词”中分别检索以下关键词 Liver Neoplasms (肝肿瘤) Hepatectomy(肝切除) Postoperative Complications (手术后并发症)
接下来就会用到 “检索史”这个功能按钮 2.检索史运算: 运用“and”运算#1、#2、#3,得到#4。
3、二次检索: 在#4的基础上,输入“老年人”,进行二次检索,得到#5。 最后得到结果
浏览检索结果时,还可以运用知识评价工具,分析、鉴别、评价文献价值。 4、分析评价文献: 浏览检索结果时,还可以运用知识评价工具,分析、鉴别、评价文献价值。
策略检索 本功能可以保存你当前检索结果中认为有跟踪研究动态意义的结果,当下次使用FMJS时,可以运用本功能加载上来,可以对比出此结果是否有最新更新的文献.
链接检索功能,以及鼠标截词翻译 鼠标划词翻译,不需安装翻译软件 每篇文献的细览里都有蓝色字体显示的链接,方便您在各种结果中跳跃. 机器翻译功能辅助翻译题名或摘要信息
同时系统还对每篇文献提供了知识点链接 如:SCI期刊查收,Google 学术搜索功能,PUBMED 相关文献、PUBMED电子资源通道揭示 等功能。 馆际互借通道,全文获取的重要按钮 OA免费文献链接,通过此链接可以直接在线看全文 SCI期刊查收:快速查明文章的SCI收录情况
全文获取 1. 2 2 1、首先“ 勾选 ”您要的题录。 2、点击“馆际互借通道” 1 可以同时选择多篇文章,点击这里的馆际互借得到,但是同一期刊每次互借不得超过5偏
3、点击“ 保存” 3. (保存到电脑上,网页文件) 推荐使用163、126邮箱
4、发送请求(在电脑上找到保存的文件,然后双击打开) 5. 4. 5、登录邮箱,查看全文请求情况
五、附:词汇解释 同行评议 循征医学 系统综述 文献综述 OA期刊 SCI期刊查收
同行评议 同行评议(F1000)是新一代发现和评价生物学与医学文献的最新工具,使医学科研人员保持与本学科专业的前沿视野一致的网络文献评价工具。F1000评委会成员由美国哈佛大学和英国剑桥大学国际知名度高的1900个生物学和2500名医学顶尖教授组成,具有绝对的权威性。
其主要特点是: ★ 弥补SCI只评价期刊不评价文章的重大不足 ★ 促使生物学家和医生保持与本学科专业的前沿视野一致 ★ 论文评估有系统的组织和严格的评价标准 ★ 同行评议因子对应每篇论文推荐的等级,“推荐—Recommended”为3 分,“必读—Must Read”为6分,“杰出—Exceptional”为9分。 ★ 同行评议涉及医学领域的被评估论文包括: 新奇发现 (New Finding) 技术进展 (Technical Advance) 有趣假说 (Interesting Hypothesis) 重要确认 (Important Confirmation) 争议性发现 (Controversial Findings) 等
同行评议国内评价专家概况 我国的医学专家入选F1000评委会的数量很少,全国包括台湾和香港地区共仅有14名专家,其中F1000M委员12名,F1000B委员2名。大陆地区的F1000委员只有四名,主要分布在北京和上海。 我国卫生部长陈竺因其医学上的杰出成就而在今年2月当选为F1000血液学委员会评委,其主要负责专业为急性白血病专业
循征医学 循证医学( Evidence-based medicine,EBM) 即遵循证据的医学,是20世纪90年代在国际上迅速兴起的一种新临床医学模式。国际著名的临床流行病学家 David Sackett 教授将其定义为“医师慎重、准确和明智地应用目前所能获得的最佳证据,来确定病人的治疗措施”。其核心思想是任何医疗决策都应该建立在客观的科学研究证据的基础上。目前,循证医学的具体概念已被医学界的主流思潮、病人和各国政府广为接受,并被认为是“21世纪的临床医学”。 详细请参考 http://web.omcq.com/kjmed1/products1/fmjs.asp?id=38
一种原始文献的合并处理方法,将多个RCT的数据合并以求获得更为真实的结论,是最重要的循证医学文献类型。 系统综述 一种原始文献的合并处理方法,将多个RCT的数据合并以求获得更为真实的结论,是最重要的循证医学文献类型。 文献综述 在分析、比较、整理、归纳一定时空范围内有关特定课题研究的全部或大部分文献的基础上,简明类述其中最重要的部分,并标引出处的文献研究报告 详细请参考 http://www.kjmed.com.cn/kjmed1/products1/product3.asp
OA期刊 OA,即 Open Access, 是国际科技界,学术界,出版界,信息传播界为推动科研成果利用网络自由传播而发起的运动.通过网络技术,任何人都可以及时,免费,不受任何限制地通过网络获取各类文献,用于科研教育及其他活动,从而促进科学信息的广泛传播,学术信息的交流与出版,提升科学研究的共利用程度,保障科学信息的长期保存. 详细请参考 http://www.libnet.sh.cn:8080/dlweb/editorsys/upload/UploadFile1246807728296_0.doc
以下为第二部分内容 《康健临床决策循证数据库》简称FEBM (Foreign Evidence-based Medicine )
二、FEBM介绍 FEBM是在国家卫生部、中华医学会相关领导关注和支持下开发的我国第三代医学专业搜索引擎,它以国际上最权威的生物医学文献数据库PubMed 1995年以来的文摘数据为基础,对约1000多万条数据进行加工处理,有效整合、揭示了约4388种疾病、8338种药物、14万条化合物与物质、500多种诊断方法以及近千种治疗方法和技术, 其数据量以每年60万条左右的速度递增,几乎涵盖了临床医学各领域的重要文献信息。
FEBM的功能亮点 FEBM是最好的获取循证医学证据的信息检索利器!
相关知识点解析 循证医学 循证医学(Evidence-based Medicine,EBM) 是指慎重、准确和明智地应用现有的最好研究证据,同时结合临床医生的个人专业技能和多年临床经验,考虑患者的权利、价值和愿望,将三者完美地结合,对患者作出医疗决策。 EBM运用最新、最有力的科研信息,指导临床医生采用最适宜的诊断方法、最精确的预后估计和最安全的治疗方法来治疗病人。
二、FEBM系统登录
(一)检索方式简介与举例
1.1关键词与主题词检索 此检索功能支持英语与汉语两种检索入口,可以对输入的任何词关键词或者医学主题词进行检索,并对检索的词的同义词以及它下位类的词进行扩充检索,使检索结果更加全面。
例如:可在输入框中输入“liver cancer”,同样也可以输入“肝癌”,点击检索就完成了这一步的检索,系统跳入到下一个“知识统计发现”的页面。此检索过程在检索liver cancer这个词的同时还同时检索了其所对应的主题词Liver Neoplasms,并对这个主题词进行了扩充检索
1.2导航检索 为临床医务工作者更加方便的对疾病与药物这类词的获取,特设置了疾病与药物的树状结构,医务工作者可以利用这种结构来找到自己专科内的相关疾病和相关药物。
1.2.1 ICD-10疾病分类导航 国际疾病分类(简称,ICD)是以首先满足统计需要为前提的国际统计分类,但其应用范围早已远远超出了原来的预想。ICD随着医学科学的发展也在不断向前发展,各个医学领域及医学需求都可以在应用ICD的过程中找到依据,国际分类家族的内容完全可以满足公共卫生、临床医学和基础医学的需要。 ICD-10疾病分类导航目前在医院的HIS系统和病案系统中已经得到了广泛的应用。因此,FEBM也将ICD-10分类导航整合到文献检索中来。如果我们想依据此标准来检索自己学科内的疾病时,可以通过点击ICD-10疾病分类导航,查找到相对应的词,点击检索按钮则直接对所点击的词进行检索,并进入到下一个“知识统计发现”页面中。
1.2.1 ICD-10疾病分类导航 例:我们想检索有关“胃癌”的文献,我们可以首先在ICD-10疾病导航中找到“第二章肿瘤”,再点击“消化器官恶性肿瘤”,这时候点击“胃恶性肿瘤”后的“检索”,就会对胃恶性肿瘤这个词进行检索。如下图:
1.2.2 MESH疾病分类导航 MESH疾病主题词树状结构是依据MESH主题词表中的树状结构而设立的。如果我们想检索自己学科内的疾病主题词,而又对相关主题词概念不太熟悉时,可以通过点击MESH疾病分类导航,查找到相对应的主题词,如果本身知道自己所要检索的主题词,则可通过上面的A-Z的的导航来检索主题词。点击详情按钮则可以了解到本词的详细信息。找到了自己所需要的主题词,直接点击词语本身,则直接对所点击的词进行检索,并进入到下一个“知识统计发现”页面中。
1.2.2 MESH疾病分类导航 例如:我们想检索有关“肠炎”的文献,我们可以首先在MESH疾病导航中找到消化系统疾病,如果我们还知道肠炎是字母“E”开头的话,我们再点击字母检索“E”就可以很快的检索到“肠炎”这个词了,这时候点击肠炎这个词就可以对其进行主题词检索。如下图:
1.2.3 药物分类导航 药物分类导航是依据收集到的有药理作用的药物,来进行分类建立的树状结构,用户可根据用途来快速找到某种分类下的药物与物质。 例:我们想了解一下镇咳药有哪些,那我们就可以点击“呼吸系统药”下的“镇咳药”,系统会把有镇咳作用的所有药物列举出来,这时候点击具体的每一种药物,就可以对这种药物进行检索了。如下图: 有药理作用的镇咳药
1.3 PICO检索 PICO检索方式是从实验实践中总结而来,是检索临床循证文献的一种最重要的方法。对于临床上常见的问题通常都可以分解为4个要素,即:P—Patient or Population患者或人群 I—Intervention 干预 C—Comparison 比较 O—Outcome 结果。 例如:“电磁场治疗与安慰剂治疗骨关节炎有效吗”这个临床问题。我们通过这个案例先确定主题词:骨关节炎“Osteoarthritis”,电磁场“Electromagnetic Fields”,药物治疗“Placebo”,效果“Effect”,我们可依次对应在P中输入Osteoarthritis,I中输入Electromagnetic Fields,C中输入placebo,O中输入Effect来确定这个PICO的检索应用策略。点击“检索”后我们就可以找到回答这个问题的文献。如果觉得检索到的文献比较少或者无自己所要找的文献,我们可以把结果这一项清空,这样再进行检索时就可以帮助我们查到更多的文献。
1.4临床查询 该检索通道基于加拿大McMaster大学海恩斯教授(Haynes RB)等研究结果构建,为临床医生快速准确地获得循证文献提供帮助。海恩斯设计了针对不同的临床问题的检索式,此检索式成为了检索临床问题的重要方法,本功能将这些复杂的检索式化全都所为后台处理的规范,形成了容易使用的检索模式。 此通道提供治疗(Therapy)诊断学(Diagnosis)预后/治疗效果(Prognosis)这三种临床最关心的问题,同时可以提供广泛检索(Broad)精确检索(Narrow)检索的限制。 例如:我们检索一下关于“非小细胞肺癌”的治疗方面的精确的文献我们就可以在输入框中输入Carcinoma, Non-Small-Cell Lung,选择治疗的同时,再选择“精确检索”点击检索即可。如下图:
(二)知识统计发现页面 2.1对检索结果几大类目的分析 FEBM是基于第三代检索引擎的开发的智能检索系统,可以对检索结果快速的分析与分组。揭示出存在于文献内部的词与词之间的关系,并可以根据这些词语的提示进行逻辑运算检索。智能分析主要对相关疾病、相关药物、相关诊断方法、相关治疗方法、相关物质名词、代谢分析及其它和相关中药与物质展开快速的分组分析。如下图: 点击进入循证文献页面
(二)知识统计发现页面 2.2 临床问题组建(布尔逻辑运算) 我们知识在做一个临床问题检索的时候,我们会时常运用到布尔逻辑运算,而FEBM系统通过在知识统计发现这个页面上的搜索提示,逐层的缩小检索范围,最终取得您满意的检索结果。 例如:我想检索关于“顺铂来治疗肺肿瘤的副作用”方面的文章,那我们第一步要分解一下这个提示式。我们很容易找出关键词一个是顺铂的副作用,一个是肺肿瘤。完成这个操作我们就必须要通过布尔逻辑运算检索来实现,分为以下几步: (1)利用关键词\主题词检索“肺肿瘤”。如下图: 点击进入循证文献页面
(2)再出现的知识发现页面中,我们找到顺铂并单击。这时系统会跳一个提示框,提示我们是要重新检索顺铂,还是要与肺肿瘤做“AND”运算。那我们想要是顺铂的副作用,我们就可以在这个页面上勾选中“副作用”这时我们的检索式也随着勾选而变化。这个检索式已经制定成功。我们再点击肺肿瘤 AND 顺铂的副作用这个检索式,所有我们所需要的文献就都会检索出来了。如下图: 2.3对数线性比例尺 FEBM面向临床常用的实用信息,采用对数线性刻度比例尺以反映文献量,使用户方便快速直观地浏览自己所需的临床信息。
(三)循证文献页面中的功能按钮 3.1 循证医学文献类型: 系统评价 荟萃分析 随机对照实验 一般综述 多中心研究 评价研究 效度研究 对比研究 临床试验 临床指南 病例报告 队列研究 横断面研究 血清流行病学研究 同行会议共识 基金项目
3.2 统计分析 该系统从文献计量学和数据挖掘技术等方面着手,对检索结果进行多角度统计分析,使临床医生快速了解检索到的文献的概貌和本研究领域的研究态势(如领先内容、领军人物、领先国家和城市、高产出期刊和文献发表时间趋势分布等),满足其对医学文献进行科学统计分析的情报需求,并通过快速了解本研究领域态势和最新国际前沿信息,不断提高自身医技水平。 同时,还可以实现对检索结果的链接检索功能,例如:在高产出作者统计中点击作者的名字,就可以重新查到这位专家发表的相关文献,如下图: 链接检索功能
3.3 题录输出 题录输出是为了方便用户获取文献所提供的工具。如果您想保留某文献的摘要,首先要先选择该文献(在文献前的方格内打勾),点击“题录输出”,选择格式后击“下载”按钮即可。如下图:
3.4 机器翻译 为方便我国医务工作者更好的阅读外文文献,FEBM专门设计了机器翻译这个功能按钮。对文献题名、摘要进行机器中文翻译,便于医生快速阅读英文文献,掌握学科进展,有效提高用户阅读英文文摘的速度和能力。如下图:
3.5 相关度与出版日期排序 智能检索的主要特点就是可以按照用户的某种意愿,快速地排序。系统设计了相关度排序与出版本日期排序两个功能,默认为相关度排序。 例如:我们输入检索词“liver cancer”后,点击循证文献按钮后,在下面的文献中与liver cancer关系最密切的文献就会出现在最上面,我们再点击出版日期排序,这时系统会自动按照出版日期进行降序排列。想回到相关度排序只需要再点击此处即可。如下图: 点击切换排序功能
3.6结论——>文摘——>全文获取通道 FEBM系统提供由“结论”、“文摘”、“全文获取通道揭示”三层文献发掘的内容。当我们检索到一篇文献时,我们可以先点击“结论”按钮,先查看文献的结论部分,再点击“文献”部分,最后觉得此文献正是自己所需要的文献时,就可以利用馆际互借通道来获取文献的全文。如下图:
联系方式 图书馆 数据库工程师 联系人: 蒋鹏辉 联系电话:15545051771 QQ: 48955759