不一样的PubMed---Pubmedplus 郑友红 北京唯博赛科技有限公司
Pubmedplus的介绍 来自于Pubmed,从Pubmed官方授权的接口获取数据。认可Pubmed的所有检索模式,检索结果和Pubmed完全一样。 弥补Pubmed的缺憾,展示Pubmed不能实现的功能。 提供Pubmed站内大数据聚类分析的功能。
Pubmedplus与Pubmed相同点 PubMed支持限定检索,自由词自动转换主题词等功能;Pubmed认可的检索式都可以在系统检索,检索结果也与Pubmed完全一致。 读者使用中文检索式,由内部词典翻译为英文再检索;
一亿四千万引文与参考文献,数据可以分析
实现了:使用Pubmed数据库进行检索,检索结果按文献被引用次数排序。
一亿四千万引文与参考文献,数据可以分析
一亿四千万引文与参考文献,数据可以分析
引文范围:仅收集Pubmed收录的期刊文献。 Pubmedplus收录了一亿六千万条引文与参考文献,可以帮助读者更好的检索自己的课题。 引文的数量和来源 引文范围:仅收集Pubmed收录的期刊文献。 Pubmedplus收录了一亿六千万条引文与参考文献,可以帮助读者更好的检索自己的课题。
中文主题词导航。
本地馆藏库与Pubmed检索对接 实现了本馆资源整合:读者检索文献后,把读者导向本馆购买的、可以直接打开全文的链接。 万方,知网收录的文献,Pubmed没有提供链接;部分Springer,ACS,wiley等常规数据库收录的文献,Pubmed有遗漏链接; Pubmed提供了链接,读者不清楚本馆哪些有权限。
提供期刊链接,三大馆
期刊导航,免费+权限
概念的聚类分析 Pubmed收录了2470万文献目次,每天增加的文献超过1000篇,每个课题检索到的文献结果太多,对结果进行概念的聚类分析可以帮助读者检索,节约时间。 对检索结果进行聚类分析可以帮助读者了解研究热点、发现新的课题。
聚类分析 作者
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聚类分析:常用聚类 汇总的机构 作者缩写:提取作者缩写信息。 文献主题词:Mesh词。 城市:规范化的城市名称。 Substance:Pubmed自有的字段。 症状:规范化的 治疗方法:规范化的 分子功能:基因本体的一部分。 生物过程:基因本体的一部分。 基因蛋白:规范化处理的蛋白名称。
聚类分析 作者
聚类分析 作者
聚类分析:其他聚类 机构:未规范化的机构,用于查机构的异名。 单词:文献出现频率最高的单词。 词组:文献出现频率最高的词组。 物种:研究对象。 解剖:文献涉及到的解剖位置。 食品:文献涉及到的食物。 Chemical:药物,未规范。 Gene Ontology:基因本体,未规范。 Gene Protein:基因蛋白,未规范。
共词分析 共词聚类分析法采用聚类的计算方法,对文章中共现的词对(主题词或关键词)的关联性进行运算,将关系密切的词聚集归类,从而达到挖掘隐含信息的目的。聚类原理的分析方法具有客观性、科学性、敏感性的特点。 “主题词与主题词”,“主题词与作者”,“作者与作者”
主题词与主题词聚类:掌握领域内的研究热点 耐药性与肿瘤
共词性分析 数据巨大
聚类分析 作者
三个例子:利用Pubmed完成三个目标 本机构文献的时时在线跟踪,学科竞争力分析对比。 投稿前选刊。 矫正检索式,跟踪课题的最新研究。
聚类分析 本机构分析,异名
聚类分析 本机构分析,异名
二:如何利用PubMedPlus进行选刊 举例: 一位神经科的大夫想发表一篇IF值2-3的病例报告,发表在哪些期刊上比较合适?
二:如何利用PubMedPlus进行选刊 思路: 1.搜索近3年发表在PUBMED上的文章; 2.通过过滤筛选①神经科学;②病例报告;③IF值, 得到与课题相关的所有文献; 3.通过聚类分析“期刊”,找出合适期刊。 4. 对期刊评估,最终选出适合的期刊
检索2011至2013年pubmed收录文章
影响因子2-3过滤
过滤病例报告
聚类分析“期刊”
期刊信息
期刊信息
期刊信息 按收录各国家文献的百分比进行分析
三种期刊分析对比表 某神经内科教授想发表一篇影响因子是2-3的病例报告,选哪些期刊投稿比较合适? The Journal of neuropsychiatry and clinical neurosciences Journal of the neurological sciences Muscle & nerve 中文名称 神经精神病学和临床神经科学杂志 神经科学杂志 肌肉与神经 学科排名 81 87 85 录用难易 较易 命中率约33.33% 容易 审稿周期 较慢,6-12周 平均4月 一般,3-6周 出版国家 United States Netherlands 年出版文献数 187 436 344 影响因子(2012) 2.397 2.243 2.314 国家文献百分比(近三年) 美国 12.966% 中国 0.754% 美国 17.502% 中国 10.266% 美国 35.753% 中国 2.548% 某神经内科教授想发表一篇影响因子是2-3的病例报告,选哪些期刊投稿比较合适? 思路:查找最近3年、影响因子是2-3、神经内科的病例报告方面的期刊
三、修正检索式,辅助检索查全 查准:优先主题词检索 并不是所有的词都有主题词 只能检索Medline数据(有主题词标引的数据) 不能检索: 出版商提供的数据:[PubMed - as supplied by publisher] 加工中的数据:[PubMed - in process]
三、修正检索式,辅助检索查全
非小细胞肺癌最后的检索式 ("carcinoma , non-small-cell lung"[MeSH Terms] OR "non small cell lung cancer"[tiab] OR "nsclc"[tiab] OR "squamous cell carcinoma"[tiab] OR "non small cell lung carcinoma"[tiab] OR "adenocarcinomas"[tiab] OR "lung adenocarcinoma"[tiab] OR "squamous cell carcinomas"[tiab]) 这样的检索式检索出的结果更加全面
谢谢大家! 敬请批评指正!