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人类疾病与健康 之基因治疗 主讲人:吴润琦. 疾病的定义 “ 疾病 ” 最常应用的定义是 “ 对人体正常形态与功能的偏离 ” , 一般可分为普通疾病和遗传病。 生物技术与人类.
从 PubMed 到 PubMedPlus 课题辅助分析与智能选刊投稿 北京唯博赛科技有限公司 祖传辉 手机 : —— 大数据科研分析利器、学科服务工具.
咨询委年度工作总结 2008 年 1 月 28 日 林励吾. 结合清洁能源国家实验室建设的咨询 结合清洁能源国家实验室建设的咨询 协作重大项目 协作重大项目 配合职能部门(科技处、信息中心)进行战略研究 配合职能部门(科技处、信息中心)进行战略研究 考察调研(中科院大连科技创新园) 考察调研(中科院大连科技创新园)
鼻咽癌 一 ﹑ 病因 ( 一 ) 病毒 本病与 EB 病毒感染有关。 ( 二 ) 遗传因素 鼻咽癌患者有家族聚集性和种族易感性, 与遗传因素有关。 ( 三 ) 化学致癌物 一些化学物质(如多环芳烃类、亚硝胺 类、微量元素镍等)与鼻咽癌的发生有一 定的关系。
第六节 呼吸系统常见肿瘤 是一种发生在鼻咽腔粘膜上皮的 恶性肿瘤,东南亚国家多见,我国居 世界之首,广东广西居全国之首,西 江流域发病率特高。 一、鼻咽癌 (nasopharyngeal carcinoma,NPC) 临床:头痛、鼻衄、鼻塞、抽吸性涕 血、耳鸣,听力减退、复视、颈部肿 块 等。
Lib.ujs.edu.cn PubMed 检索与利用 刘海军
美国生理学会期刊. 美国生理学会( The American Physiological Society, APS )是出 版生理学各学科期刊和图书的主要 出版社。该学会出版 15 本著名科技 期刊 ,致力于推动生理学研究 —— 生物学进展的基础。 美国生理学会.
流行病學 -肺炎 Pneumonia. 流行病學 -肺炎 Pneumonia 病原體侵入呼吸系統而引起肺部感染發炎稱為「肺炎」 -會造成肺泡損傷,使得氣體交換機能降低或停止。 肺炎的程度、侵犯範圍與部位不同,所表現出來的症狀也不同 一般而言,年齡 55 歲以上、營養不良、有全身性疾病、慢性肺病、昏迷、有氣管內管者,其肺炎的發生率較高。
肺癌病人的护理 lung cancer 中国医科大学 李晓波.
现代化医院建设中 ——医院信息建设软环境的探寻
从PubMed到PubMedPlus 科研辅助分析与智能选刊投稿系统
牛津期刊- Oxford Journals 國立台北護理健康大學 教育訓練 Oct 邱子翎.
实际上,对于我国的生物医学科研工作者来说,在文献检索方面存在着诸多的实际困难,其中一些困难是我国特有的。
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人的生殖 人通过生殖产生新个体 生殖是指生物产生后代和繁衍种族的过程,是生物界普遍存在的一种生命现象。 生殖是由生物产生幼小的个体以繁殖后代。生殖是生命的基本特征之一。   生物体生长发育到一定阶段后,能够产生与自己相似的子代个体。   人类分为男性和女性,要由两性生殖细胞结合才能生成子代个体。父系和母系的遗传信息分别由男性生殖细胞和女性生殖细胞带给子代。生殖是传种接代的一种方式。
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案例1 某高校打算聘请哈佛大学布莱根妇女医院的Piero Anversa教授为客座教授,但首先需要对Piero Anversa教授的学术水平进行评价,请问可从哪些方面进行评价?
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Pubmedplus的介绍 来自于Pubmed,从Pubmed官方授权的接口获取数据。认可Pubmed的所有检索模式,检索结果和Pubmed完全一样。 弥补Pubmed的缺憾,展示Pubmed不能实现的功能。 提供Pubmed站内大数据聚类分析的功能。

Pubmedplus与Pubmed相同点 PubMed支持限定检索,自由词自动转换主题词等功能;Pubmed认可的检索式都可以在系统检索,检索结果也与Pubmed完全一致。 读者使用中文检索式,由内部词典翻译为英文再检索;

一亿四千万引文与参考文献,数据可以分析

实现了:使用Pubmed数据库进行检索,检索结果按文献被引用次数排序。

一亿四千万引文与参考文献,数据可以分析

一亿四千万引文与参考文献,数据可以分析

引文范围:仅收集Pubmed收录的期刊文献。 Pubmedplus收录了一亿六千万条引文与参考文献,可以帮助读者更好的检索自己的课题。 引文的数量和来源 引文范围:仅收集Pubmed收录的期刊文献。 Pubmedplus收录了一亿六千万条引文与参考文献,可以帮助读者更好的检索自己的课题。

中文主题词导航。

本地馆藏库与Pubmed检索对接 实现了本馆资源整合:读者检索文献后,把读者导向本馆购买的、可以直接打开全文的链接。 万方,知网收录的文献,Pubmed没有提供链接;部分Springer,ACS,wiley等常规数据库收录的文献,Pubmed有遗漏链接; Pubmed提供了链接,读者不清楚本馆哪些有权限。

提供期刊链接,三大馆

期刊导航,免费+权限

概念的聚类分析 Pubmed收录了2470万文献目次,每天增加的文献超过1000篇,每个课题检索到的文献结果太多,对结果进行概念的聚类分析可以帮助读者检索,节约时间。 对检索结果进行聚类分析可以帮助读者了解研究热点、发现新的课题。

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聚类分析:常用聚类 汇总的机构 作者缩写:提取作者缩写信息。 文献主题词:Mesh词。 城市:规范化的城市名称。 Substance:Pubmed自有的字段。 症状:规范化的 治疗方法:规范化的 分子功能:基因本体的一部分。 生物过程:基因本体的一部分。 基因蛋白:规范化处理的蛋白名称。

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聚类分析:其他聚类 机构:未规范化的机构,用于查机构的异名。 单词:文献出现频率最高的单词。 词组:文献出现频率最高的词组。 物种:研究对象。 解剖:文献涉及到的解剖位置。 食品:文献涉及到的食物。 Chemical:药物,未规范。 Gene Ontology:基因本体,未规范。 Gene Protein:基因蛋白,未规范。

共词分析 共词聚类分析法采用聚类的计算方法,对文章中共现的词对(主题词或关键词)的关联性进行运算,将关系密切的词聚集归类,从而达到挖掘隐含信息的目的。聚类原理的分析方法具有客观性、科学性、敏感性的特点。 “主题词与主题词”,“主题词与作者”,“作者与作者”

主题词与主题词聚类:掌握领域内的研究热点 耐药性与肿瘤

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三个例子:利用Pubmed完成三个目标 本机构文献的时时在线跟踪,学科竞争力分析对比。 投稿前选刊。 矫正检索式,跟踪课题的最新研究。

聚类分析 本机构分析,异名

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二:如何利用PubMedPlus进行选刊 举例: 一位神经科的大夫想发表一篇IF值2-3的病例报告,发表在哪些期刊上比较合适?

二:如何利用PubMedPlus进行选刊 思路: 1.搜索近3年发表在PUBMED上的文章; 2.通过过滤筛选①神经科学;②病例报告;③IF值, 得到与课题相关的所有文献; 3.通过聚类分析“期刊”,找出合适期刊。 4. 对期刊评估,最终选出适合的期刊

检索2011至2013年pubmed收录文章

影响因子2-3过滤

过滤病例报告

聚类分析“期刊”

期刊信息

期刊信息

期刊信息 按收录各国家文献的百分比进行分析

三种期刊分析对比表 某神经内科教授想发表一篇影响因子是2-3的病例报告,选哪些期刊投稿比较合适?  The Journal of neuropsychiatry and clinical neurosciences Journal of the neurological sciences Muscle & nerve 中文名称 神经精神病学和临床神经科学杂志 神经科学杂志 肌肉与神经 学科排名 81 87 85 录用难易 较易 命中率约33.33% 容易 审稿周期 较慢,6-12周 平均4月 一般,3-6周 出版国家 United States Netherlands 年出版文献数 187 436 344 影响因子(2012) 2.397  2.243 2.314 国家文献百分比(近三年) 美国 12.966% 中国 0.754% 美国 17.502% 中国 10.266% 美国 35.753% 中国 2.548% 某神经内科教授想发表一篇影响因子是2-3的病例报告,选哪些期刊投稿比较合适? 思路:查找最近3年、影响因子是2-3、神经内科的病例报告方面的期刊

三、修正检索式,辅助检索查全 查准:优先主题词检索 并不是所有的词都有主题词 只能检索Medline数据(有主题词标引的数据) 不能检索: 出版商提供的数据:[PubMed - as supplied by publisher] 加工中的数据:[PubMed - in process]

三、修正检索式,辅助检索查全

非小细胞肺癌最后的检索式 ("carcinoma , non-small-cell lung"[MeSH Terms] OR "non small cell lung cancer"[tiab] OR "nsclc"[tiab] OR "squamous cell carcinoma"[tiab] OR "non small cell lung carcinoma"[tiab] OR "adenocarcinomas"[tiab] OR "lung adenocarcinoma"[tiab] OR "squamous cell carcinomas"[tiab]) 这样的检索式检索出的结果更加全面

谢谢大家! 敬请批评指正!