The Hong Kong University of Science & Technology

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本報告內一切內容與香港大學立場無關,內容由民意研究計劃主任鍾庭耀博士負責。
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The Hong Kong University of Science & Technology 孔明灯 (Lantern) 3.4 使用指南 Nevin L. Zhang The Hong Kong University of Science & Technology http://www.cse.ust.hk/~lzhang/tcm/ Thank XXX for the introduction. Today, I am going to talk about an evidence-based approach the TCM patient classification

下载与安装 下载安装Java: http://www.oracle.com/technetwork/java/javase/downloads/index.html 孔明灯下载地址: http://www.cse.ust.hk/~lzhang/tcm/resource.html 未来更新会放在同一地址 解压 点击Lantern-3.4运行

系统语言选择及使用指南

基本功能 隐树分析 模型显示 模型诠释 综合聚类 辨证规则

隐树分析:数据准备 孔明灯支持的数据格式有: 逗号分隔的 CSV 格式 (.csv) Weka ARFF 格式 (.arff) 及其压缩格式 (.arff.gz) Excel数据处理 缺值用空格或“?”表示 另存为逗号分隔的 CSV 格式 (.csv)

隐树分析 “分析”=>“隐树模型学习” 调用数据 Sample-data.csv 52 症状变量,499条数据 选择算法

隐树分析:算法 BI 快, 但模型质量不如 EAST Sample-data BI: 适合初步分析 EAST: 适合正式分析 5分钟 , BIC: -10,671.4 EAST: 适合正式分析 90 分钟 , BIC: -10,645.99 LCM: 获得隐类模型,只有一个隐变量。 分析结束,储存模型

“分析”菜单 参数学习: 给定模型,确定参数 模型评价 计算模型的分值

基本功能 隐树分析 模型显示 模型诠释 综合聚类 辨证规则

模型显示和排版 打开模型 初步模型图 “工具”->“陈列单根图...” “编辑”菜单 节点选择,对齐,分布,节点显示格式 “视图”菜单 显示互信息与边的方向 “文件”菜单 输出模型结构 (.png 或 .eps格式)

基本功能 隐树分析 模型显示 模型诠释 综合聚类 辨证规则

模型诠释 目的: 计算关于隐变量的各种信息,帮助用户把握其统计学含义 “分析”->“模型诠释...” 点击新建按钮 直连分析:只考虑与隐变量其直接连接的显变量 泛连分析:考虑所有显变量 (这里不用) 诠释结果可储存

信息曲线 红色曲线:各显变量与 Y11 的两两互信息或者相关度的大小 蓝色曲线: 累积互信息的高低 蓝色曲线: 累积互信息的高低 左侧的纵轴是互信息的绝对值,而右侧的纵轴则是信息覆盖度的大小 截 取前 6 个显变量,累积信息覆盖度达到95%,其余可不考虑

类概率分布表 Y11把数据分为2个类 类Y11=s0占总数 82% 类Y11=s1占总数 18% 显变量s1例为症状出现 概率。 表可拷贝 鼠标左键 选择,ctrl+c

诠释 (研究者) Y10=s1中 心悸、胸闷出现高率高 Y10揭示心悸、胸闷的概率同现 (统计学意义) 什么证候可以导致心悸、胸闷同时出现? 气滞 (中医学意义)

注意 如隐变量不与显变量直接相连,则不用对其进行诠释 (直连分析会使用其子树中的所有显变量)

基本功能 隐树分析 模型显示 模型诠释 综合聚类 辨证规则

综合聚类 Ctrl +鼠标左键 选择隐变量 点击“分析”--> “综合聚类” 结果:综合聚类模型

综合聚类模型 改动综合隐变量名称 鼠标右键->节点属性

综合聚类:参数设置 综合聚类应运行多次 (建议5次) 如果结果不一致,需调高参数,每次成倍增长

综合聚类模型诠释 用泛连分析:因为要确定Z1与所有显变量的关系

综合聚类模型诠释

基本功能 隐树分析 模型显示 模型诠释 综合聚类 辨证规则

辨证规则 选择隐变量 鼠标右键选择 “辨证规则”

辨证规则结果

辨证规则简化

辨证规则拷贝 拖鼠标右键选择 + ctrl C 副作用:拷贝之症状变量被剔除

多值综合隐变量 对比类有多种选择

多值综合隐变量 辅助信息刻画对比类

多值综合隐变量 辅助信息刻画对比类 模型诠释给出所有类信息, 排在最前的是对分辨所有类最 有用得症状, 而不是对分辨对比类最有用得 症状

总结 大致介绍 孔明灯3.4 的使用 软件自带使用指南有更详尽内容