项目六 微生物的遗传变异 王波 主要内容: 一、细菌遗传的物质基础 二、基因突变 三、基因的转移与重组 四、研究细菌遗传变异的实际意义
第一节 细菌遗传的物质基础 1、 基因组 (genome) 第一节 细菌遗传的物质基础 1、 基因组 (genome) 细菌的基因组位于核体,是遗传的主要 物质基础。核体又称染色体(chromosome)是由两 条环状双螺旋DNA长链组成,含细菌的遗传基因, 控制细菌的遗传与变异。细菌染色体DNA以半保 留方式进行复制。故子代写亲代细菌的性状相同。 倘若在DNA复制中,子代DNA发生改变,便会出现 变异。
2、质粒 (Plasmid) 质粒是细菌染色体外的遗传物质,多为 环状双螺旋DNA分子。质粒可以自身复制,随宿 主菌分裂传到子代菌体。在一定条件下,质粒可 以转移,也可丢失。质粒是自行复制单位,有的 需与核质染色体的复制同步,称为严紧型复制。 编码细菌各种重要的生物学性状。
№1 F质粒:编码性菌毛的质粒称致育质粒或F 质粒 ,具有F质粒的细菌有性菌毛,为雄性细菌; 无F质粒的细菌无性菌毛,为雌性细菌,该质粒与 细菌的有性结合有关。 №2 毒力质粒:编码细菌各种毒力因子的质粒统 称毒力质粒或Vi质粒 。如致病性大肠杆菌在黏膜 上定居及产生毒素的能力可由不同质粒编码,其 中K质粒编码对黏膜具有黏附活性的菌毛,ST质粒 与LT质粒分别编码耐热肠毒素和不耐热肠毒素。 细菌对抗菌药物或重金属盐类的抗性则由R质粒所 决定。一个质粒可同时具有几种编码功能。
质粒可以在细菌间转移,当质粒从一 个细菌转移至另一个细菌时,携带的性状也随 之转移。质粒的转移不仅可以发生花同种、同 属的细菌之间,有的甚至还可以在不同种属的 细菌间进行。按其转移的特性时将质粒分为二 类:接合性质粒与非接合性质粒。
2、穿梭载体 是一类特殊的质粒,可在某种属 关系差异较大的微生物中转移,例如在大肠杆 菌与酵母之间。利用它可携带质核或真核微生 物的外源序列。 3、转座因子 (transposable element) 近年来发 现微生物的某些DNA片段作为一个独立单位可 在染色体上移动,此种移动甚至可发生在不同 种细胞之间。这种可移动的DNA片段称之为转 座因子。细菌的转座因子有三种类型:插入序列 (IS)、转座子(Tn)以及某些特殊的噬菌体,例 如Mu是促变噬菌体的简称。
4、毒力岛(pathogenicity island,PAI) 是20世纪90年代提出的一个新概念。PAI是指病 原菌的某个或某些毒力基因群,分子结构与功 能有别于细菌染色体,但位于细菌染色体之内, 因此称之为“岛”。PAI虽然是染色体的DNA片 段,但两端往往具有重复序列与插入元件,其 G+Cmol%及密码使用与细菌染色体有明显差异, 分子量较大,多为30~40kb,也有达100kb者。
遗传变异的物质基础 转化实验 三个经典实验证明核 噬菌体感染实验 酸是微生物遗传物质 植物病毒的重建实验 遗传物质在微生物细胞内的存在部位和方式
转化实验(2)细菌培养实验 体外培养 SⅢ〖杀死〗 无菌落生长 体外培养 RⅡ〖活菌〗 RⅡ菌落 SⅢ〖杀死〗 RⅡ菌落多 SⅢ菌落少 体外混合培养 SⅢ〖杀死〗 RⅡ〖活菌〗
+ 转化实验(3)S型菌无细胞抽提液试验 + + S菌DNA S菌落 S菌Pr R菌落 S菌多糖 活R菌 S菌无细胞抽提液 大量R菌落 Cncnc-micro
植物病毒的重建实验 同时又可把它们重新组合成具感染性的病毒. 植物病毒蛋白质和RNA可以人为地分开, Cncnc-micro
植物病毒的重建实验 TMV HRV (TMV变种) HRV TMV 原始株 拆开 重建 感染 分离纯化
遗传物质在微生物细胞内的存在部位和方式 核染色体 遗传物 质类型 真核生物细胞器 核外染色体 原核生物质粒
基因是一段DNA 染色体 基因Ⅱ 基因Ⅰ DNA
第二节 基因突变 一、基因突变的概念及种类: 1、概念: 第二节 基因突变 一、基因突变的概念及种类: 1、概念: 基因突变简称突变,是变异的一种,指 生物细胞遗传物质DNA分子结构突然发生了稳定的 可遗传的变化。它是生物进化的一个重要因素。 2、种类: 细菌与一般生物细胞一样可发生突变, 其突变也可按发生改变的范围大小,分为染色体 畸变和点突变。
二、细菌常见的变异现象 1、菌落形态变异 分为两种类型,即菌落表面光滑、湿润, 边缘整齐的光滑型(S型)和菌落表面粗糙、枯干, 边缘不整齐的粗糙型(R型)。在一定条件下,光滑型 菌落可变为粗糙型,称为S→R变异。S→R变异,经 常伴随着S型抗原的丧失和病原菌毒力由强变弱等性 状的改变 。
2、形态结构变异 常见的有细胞壁缺陷变异 (细菌 L型等)、荚膜变异或鞭毛变异等。 3-6%食盐 鼠疫杆菌────→多形态性(衰残型)。 琼脂培基
形态结构变异 青霉素、溶菌酶 正常形态细菌──────→ L型变异 抗体或补体 (部分或完全失去胞壁) 正常霍乱弧菌 霍乱弧菌L型
形态结构变异 特殊结构的变异 42-43℃ 炭疽杆菌────→失去形成芽胞能力, 毒性 10-20天 降低 42-43℃ 炭疽杆菌────→失去形成芽胞能力, 毒性 10-20天 降低 变形杆菌(H) 1%石炭酸 (O) 迁徙生长 单个菌落 鞭毛变异
3、抗原变异 由于细菌基因突变而引起其抗原结构 发生改变的变异类型。 常见的抗原变异有: 菌体抗原变异 鞭毛抗原变异 (H-O变异) 荚膜抗原变异
4、抗性变异 是对某种化学药物或致死物理因子抗性 的变异。如耐药性的产生、对多种物理因素的抗 性增强等。 5、营养型变异 主要引起营养缺陷型变异,即细菌丧失 合成一种或几种生长因子的能力,无法 在基本培 养基上正常生长繁殖的变异类型。这种突变对研 究细菌代谢产物的 生物合成途径很有用处。此外, 营养型变异菌株可作为杂交、转化、转导和原生 质体融合等研究中的标记菌种。
6、毒力变异:毒力增强或减弱 毒力是病原菌特有的一种生物学性状。 在自然条件下,不仅不同菌株的毒力有所不同,就 是同一菌株在不同条件下也表现出不同的毒力。在 某种传染病的发病初期,从患病动物体内分离出来 的菌株毒力较强,然而在流行末期分离到的细菌毒 力大为减弱。毒力强的菌株在体外连续传代改变培 养条件后,毒力往往减弱,而通过易感动物又能便 毒力减弱的菌株恢复毒力。
细菌毒力减弱的方法 (1)长时间在体外连续培养传代 病原菌在 体外人工培养基上连续多次传代后,毒力一般 都能逐渐减弱乃至失毒力。 (1)长时间在体外连续培养传代 病原菌在 体外人工培养基上连续多次传代后,毒力一般 都能逐渐减弱乃至失毒力。 (2)在高于最适生长温度条件下培养 例如 炭疽I型和Ⅱ号疫苗,均是将炭疽杆菌强毒株在 42~43℃培养传代育成。
(3)在含有特殊化学物质的培养基中培养 如广为采用的结核病卡介苗 (BCG),系将牛型 结核杆菌在含有胆汁的马铃薯培养基上每15天 传1代,持续传代13年后育成。 (4)在特殊气体条件下培养 如无荚膜炭疽 芽孢苗是半强毒菌株在含50%动物血清的培养基 上,在50%CO2的条件下选育的。
(5)通过非易感动物 如猪丹毒弱毒苗 (GC42 )系将强致病菌和株通过豚鼠370代后, 又通过鸡42代选育而成。 (6)通过基因工程的方法 去除毒力基因或 用点突变的方法使毒力基因失活,可获得无毒 力菌株或弱毒菌株。但对多基因调控的毒力因 子较难奏效。
细菌毒力增强的方法 在自然条件下,回归易感动物是增强 细菌毒力的最佳方法。易感动物既可是本动物, 也可是实验动物。特别是易感实验动物,已广泛 用于增强细菌的毒力,如多杀性巴氏杆菌通过小 鼠,猪丹毒杆菌通过鸽子等。
三、诱发细菌变异的方法 诱发突变是应用人工方法使细菌增殖 和复制DNA时出现 “错误”, 从而育成人类需 要的细菌变异品系。如下介绍常用的诱变方法 及其致突变的机制。
(一) 物理方法 包括温度及各种射线 。 1、温度:温度诱发基因突变的机制似乎是 专一对GC碱基对的作用。包括使C脱氨基转换为 尿嘧啶 (U),在复制中造成GG → AT转换;以及引 起G-脱氧核糖键的移动,从而在DNA复制过程中 出现包括两个G的碱基对,在再一次复制中造成 GG →CG颠换。
2、辐射:辐射的诱变作用一般认为有直接 作用和间接作用两个方面。前者是指辐射直接 作用于染色体,包括引起DNA骨架断裂所造成的 染色体畸变和引起复制差错。 间接作用是使染色体以外的细胞物质 发生变化,再由这些物质作用于染色体引起突 变;它包括碱基类似物的形成及其突变诱发作用, 和电离辐射引起过氧化氢和游离基的产生以及 它们诱发突变。
(二)化学方法 常用的化学诱变剂有5溴脱氧尿苷 ( UBr )、5-氟脱氧尿苷、2-氨基嘌呤、8-氮鸟 嘌呤、亚硝酸、羟胺、烷化剂(B丙酸内酯和芥子 气等)、亚硝基胍、丫啶橙染料 (丫啶黄、丫啶 橙、原黄素等)、一系列烷化剂和丫啶类结合的化 合物、溴化乙锭等。它们的作用机制复杂而各有 差异,总的说来主要有以下几方面。
1.取代碱基参入DNA,从而使DNA的某些碱 基对发生置换。例如UBr是T的结构类似物,它通 常以酮式出现,能代替T与A形成氢键而配对。 2. 使碱基发生化学变构,从而引起DNA的 某些碱基对发生置换。例如亚硝酸对碱基有氧 化脱氨基作用,可以便C成为U与A配对,或A成 为次黄嘌呤(H)与C配对,从而引起DNA的某些碱 基对发生置换突变。
3.插入DNA相邻的碱基之间,引起移码突变。 在邻近的两个嘌呤碱基之间插入丫啶染料分子, 可引起DNA复制时碱基增添或缺失的错误,造成 密码子的移码,出现基因突变。
(三)生物学方法 利用各种生物学的方法可诱使微生物 发生变异,使细菌发生毒力等性状的改变,获 得性能良好的菌株。 1、增强毒力 连续通过易感动物,可使病 原菌毒力增强。有的细菌与其他微生物共生, 或被温和噬菌体感染,也可增强毒力。例如产 气荚膜梭菌与八叠球菌共生时毒力增强;肉毒梭 菌当被温和噬菌体感染时,方产生毒素。
2、减弱毒力 病原菌毒力自发减弱的现象, 常见于传染病流行末期所分得的病原菌株。人 工减弱病原微生物的毒力通常使用病原菌通过 非易感动物、鸡胚等方法。如将禽霍乱强毒菌 株通过琢鼠190代后,再经鸡胚传40代,育成禽 霍乱弱毒菌株。无论自然变异弱毒株或人工培 育的变异弱毒株,均由于DNA上核甘酸碱基顺序 的改变的结果。
第三节 基因的转移与重组 细菌是单细胞生物,以二分裂方式进行 无性繁殖,子代只有从一个亲代获得遗传物质, 在某种情况下,两个不同性状细菌的基因可以转 移到一起,经过基因间的重组,形成新的遗传型 个体。细菌的基因转移和重组的主要形式有转化、 转导、接合、原生质体融合和转染。
转化 转化因子(transforming principle ) 感受态(competence) 在转化过程中,转化的DNA片段称为转化因子 ,分 子量小于107,最多不超过10~20个基因。 感受态(competence) 受体菌只有处于感受态时,才能摄取转化因子。细 菌处于感受态是因为其表面有一种吸附DNA的受体.
转化 转化因子吸附在受体菌表面受体上,然后再被 摄入 。 解链,一链进入受体菌,另一链为进入提供能 量。 重组。 DNA复制重组菌繁殖后,获得新的性状的细菌 称为转化菌的突变株。
转化
接合(conjugation) 接合是细菌通过性菌毛相互连接沟通, 将遗传物质(主要是质粒DNA)从供体菌转移 给受体菌。 接合性质粒:能通过接合方式转移的 质粒称为接合性质粒,F质粒、R质粒、Col质粒 和毒力质粒。
E. coli strains undergoing conjugation (TEM x27,700)
接合 Donor F+ F- Recipient
接合 R质粒的接合 日本首先分离到抗多种药物的宋内志贺菌多重 耐药株,多重耐药性很难用基因突变解释。 健康人中大肠埃希菌30%~50%有R质粒,而致病 性大肠埃希菌90%有R质粒。 R质粒与耐药性有关,尤其与多重耐药性有关 。耐药质粒从一个细菌转移到另一个细菌中。
接合 R质粒 耐药传递因子(resistance transfer factor,RTF)与F质粒 相似,编码性菌毛的产生和通过接合转移 耐药(r)决定子 r-dir能编码对抗菌药物的耐药性,可由几个转 座子连接相邻排列,如Tn9带有氯霉素耐药基 因,Tn4带有氨苄青霉素、磺胺、链霉素的耐 药基因,Tn5带有卡那霉素的耐药基因。
转导(transduction) 转导是以转导噬菌体为载体,将供 体菌的一段DNA转移到受体菌内, 使受体菌获得新的性状。 普遍性转导(generalized transduction) 局限性转导(restricted transduction)
普遍性转导 前噬菌体从溶原菌染色体上脱离,进行 增殖,在裂解期的后期,噬菌体的DNA已大量复制 ,在噬菌体DNA装入外壳蛋白组成新的噬菌体时, 在105~107次装配中会发生一次装配错误,误将细 菌的DNA片段装入噬菌体的头部,成为一个转导噬 菌体。转导噬菌体能以正常方式感染另一宿主菌, 并将其头部的染色体注入受体菌内。因被包装的 DNA可以是供体菌染色体上的任何部分,故称为普 遍性转导。 部
普遍性转导
普遍性转导 完全转导 外源性DNA片段与受体菌的染色体整 合,并随染色体而传代,称完全转 导 流产转导
局限性转导 局限性转导或特异性转导, 所 转导的只限于供体菌染色体上特定的基 因。如λ噬菌体进入大肠埃希菌。
局限性转导 gal bio
第四节 细菌遗传变异研究的实际意义 1、理论意义:用细菌进行的一系列遗传学实验, 不仅揭示了细菌本身许多遗传变异的规律,而 且推动整个分子遗传学的迅速发展。在微生物 学领域内,细菌遗传变异的研究也有助于对其 他有关问题的了解和发展,例如帮助了解微生 物的起源和进化,微生物结构与功能的关系, 原核生物性状的调节控制,以及推动微生物分 类学的深入发展。
2、实践意义:在实践方面,细菌遗传变异的研 究在以下若干方面也具有重大的实用意义。 №1 疾病诊断 在临床细菌学检查工作中,要 作出正确的诊断,不但要熟悉细菌的典型特性, 还要了解细菌的变异规律。 №2 疾病预防 菌苗接种是使机体建立特异性 免疫,预防传染性疾病的有效措施,弱毒菌苗 株都是病原菌的减毒变异株,有较好的免疫效 果。
№3 疾病治疗 在治疗细菌疾病用药时,应选 择敏感的抗菌药物,并应防止耐药菌株的扩散。 №4 疾病诊断
№5 基因工程 基因工程是用人工方法将所需要 的某一供体生物的DNA大分子提取出来,在离体 的条件下用适当的工具酶切割,把它与作为载 体的DNA分子连接起来,然后与载体一起导入某 一易生长、繁殖的受体细胞中,让外源遗传物 质在其中“安家落户”,进行正常的复制 和表达,从而获得新的产物。
它的主要操作步骤如下: (1)目的基因分离; (2)目的基因与载体DNA的体外重组,形成一个完整 的有复制能力的嵌合体; (3)重组载体导人受体细胞,通常用转化的方法,导 入能容纳外源载体的受体细菌。 (4)复制与表达;重组载体在受体细胞内必须自主复制 而获得扩增,以表达目的基因特有的遗传性状或产 物,使之成为 “工程菌”。应用这一技术可使细菌 表达出需要的性状或产物。