医学生物化学 傅海燕 基础部生物化学与分子生物学教研室
绪 论 何谓生物化学? 生物化学学习什么内容? 为什么学习生物化学? 如何学好这门课?
何谓生物化学? 是研究生物体内化学分子与化学反应的科学,它在分子水平探讨生命现象的本质。 医学生物化学主要研究人体的生化,是重要的医学基础课程。
生物化学学习什么内容? 生物大分子的结构与功能 物质代谢及其调节 基因的信息传递及其调控 器官组织生化----肝脏、血液、 糖蛋白与细胞外基质 维生素与微量元素
为什么学习生物化学? 生物化学与其他基础医学研究的关系 方法 技术 药理 (抗生素) 病理(糖尿病) 生物化学与临床医学的关系 方法 技术 药理 (抗生素) 病理(糖尿病) 生物化学与临床医学的关系 疾病诊断 肝炎(肝功) 血友病 (因子Ⅷ ) 强制性脊柱炎 (B27) 疾病治疗 肿瘤的基因治疗 痛风 (别嘌呤醇) 疾病预防 乙肝疫苗 卡介苗等 发病机制研究 肿瘤 心血管 免疫性疾病
如何学好这门课? 生物化学的特点 <1>内容分布 静态生化:生物分子的结构、性质、功能,很少涉及它们的变化,这些生物分子包括糖、脂、蛋白质、核酸、酶、激素、维生素等. 动态生化:讲的是这些生物分子的来龙去脉,即合成与分解. <2>特点 概念性描述性的内容居多,很少有推导性或计算性的内容. “死记” “巧记”
第一部分 生物分子的结构和功能 什么是生物分子? 蛋白质是生命的基础。 核酸是遗传的基础。 第一部分 生物分子的结构和功能 什么是生物分子? 分子较大,结构复杂,包括蛋白质、核酸、脂类、糖类等。 蛋白质是生命的基础。 核酸是遗传的基础。
第一部分 生物分子的结构和功能 主要内容 蛋白质的结构与功能 核酸化学 酶
Structure and Function 蛋白质的 结构与功能 Structure and Function of Protein
?什么是蛋白质 蛋白质(protein)是由许多氨基酸(amino acids)通过肽键(peptide bond)相连形成的高分子含氮化合物
?蛋白质的生物学重要性 蛋白质是生物体重要组成成分 蛋白质具有重要的生物学功能 无处不在— 分布广:所有的组织细胞 含量多:细胞干重 50%± 分布广:所有器官、组织都含有蛋白质;细胞的各个部分都含有蛋白质。 含量高:蛋白质是细胞内最丰富的有机分子,占人体干重的45%,某些组织含量更高,例如脾、肺及横纹肌等高达80%。 1)作为生物催化剂(酶) 2)代谢调节作用 (激素) 3)免疫保护作用 (免疫球蛋白) 4)物质的转运和存储 (血红蛋白) 5)运动与支持作用 (胶原蛋白) 6)参与细胞间信息传递 (G蛋白) 无所不能— 生命活动中所有细胞功能 都离不开蛋白质
主要内容 蛋白质的分子组成 氨基酸和蛋白质的理化性质 蛋白质的分子结构 蛋白质分子结构与功能的关系
组成蛋白质的元素 主要有C、H、O、N和S 有些蛋白质含有少量磷或金属元素铁、铜、锌、锰、钴、钼,个别蛋白质还含有碘
组成蛋白质的元素 2. 体内含N物主要是pr, 但也有非蛋白氮 各种蛋白质的含氮量很接近,平均为16% 凯氏定氮(N) :30年代 精确 :30年代 精确 1. pr中含N量平均16% 100克样品中蛋白质的含量 ( g % ) = 每克样品含氮克数× 6.25×100 由于体内的含氮物质以蛋白质为主,因此,只要测定生物样品中的含氮量,就可以根据以下公式推算出蛋白质的大致含量: 2. 体内含N物主要是pr, 但也有非蛋白氮 (尿酸,尿素,氨,a.a 等)
蛋白质的基本单位-氨基酸
蛋白质的基本单位-氨基酸 R H 甘氨酸 HOOC-CH2-CH2- 谷氨酸
人体蛋白质中的aa都为L型(L-α-aa) L型与D型, 甲醛分子为标准 存在自然界中的氨基酸有300余种,但组成人体蛋白质的氨基酸仅有20种,且均属 L-氨基酸(甘氨酸除外)。 人体蛋白质中的aa都为L型(L-α-aa)
构成人体蛋白质的20种aa 在DNA上有遗传密码 ?除构成蛋白质的20种aa 体内还有其他aa吗 COOˉ ︱ H3N+-C -H R — DNA编码的氨基酸 ?除构成蛋白质的20种aa 体内还有其他aa吗 — DNA不编码的aa?
氨基酸的分类 非极性疏水性氨基酸 (在水中的溶解度较小) 2. 极性中性氨基酸(比较溶于水) 甘氨酸;丙氨酸 ;缬氨酸 ;亮氨酸 ;异亮氨酸 ;苯丙氨酸 ;脯氨酸 2. 极性中性氨基酸(比较溶于水) 色氨酸;丝氨酸;酪氨酸;半胱氨酸 ;蛋氨酸 ;天冬酰胺 ;谷氨酰胺 ;苏氨酸 3.酸性氨基酸(R基团都有羧基,生理条件下带负电荷) 天冬氨酸;谷氨酸 4.碱性氨基酸(生理条件下带正电荷) 赖氨酸;精氨酸 ;组氨酸
非极性疏水性氨基酸 甘氨酸 glycine Gly G 5.97 丙氨酸 alanine Ala A 6.00 缬氨酸 valine Val V 5.96 亮氨酸 leucine Leu L 5.98 异亮氨酸 isoleucine Ile I 6.02 苯丙氨酸 phenylalanine Phe F 5.48 脯氨酸 proline Pro P 6.30
3. 酸性氨基酸 天冬氨酸 aspartic acid Asp D 2.97 谷氨酸 glutamic acid Glu E 3.22 4. 碱性氨基酸 赖氨酸 lysine Lys K 9.74 精氨酸 arginine Arg R 10.76 组氨酸 histidine His H 7.59
特殊氨基酸 半胱氨酸 + -HH 二硫键 胱氨酸
芳香族AA:苯丙氨酸Phe、酪氨酸Tyr 和色氨酸Trp 蛋白质分子中Phe, Tyr和Trp残基的存在使得蛋白质在近紫外区(220-300nm)有特征性吸收 * 苯丙氨酸的max=257nm 酪氨酸的max=275nm 色氨酸的max=280nm
肽键与肽 肽键(peptide bond) 是由一个氨基酸的-羧基与另一个氨基酸的-氨基脱水缩合而形成的化学键。
肽键与肽 -HOH 甘氨酰甘氨酸 肽键 +
肽键与肽 肽键的特点 肽键中,与C-N相连的O和H呈反式构型 C N O H C N O H (顺式) (反式)
肽键与肽 C N O H C-N单键为0.149nm C=N双键为0.127nm 肽键中C-N键长为0.132nm 具有部分双键性质 肽键的特点 C N O H C-N单键为0.149nm C=N双键为0.127nm 肽键中C-N键长为0.132nm 具有部分双键性质 不能自由旋转
肽单元 参与肽键组成的6个原子C1、C、O、N、H、C2位于同一平面,此同一平面上的6个原子构成了肽单元(酰胺平面)
多肽链的主链由许多酰胺平面组成,平面之间以碳原子相隔
肽键与肽 * 肽 由氨基酸通过肽键缩合而形成的化合物
* 寡肽(oligopeptide)、多肽(polypeptide) 肽键与肽 * 二肽、三肽…… * 寡肽(oligopeptide)、多肽(polypeptide) 两分子氨基酸缩合形成二肽,三分子氨基酸缩合则形成三肽…… 由十个以内氨基酸相连而成的肽称为寡肽(oligopeptide),由更多的氨基酸相连形成的肽称多肽(polypeptide)。 肽链中的氨基酸分子因为脱水缩合而基团不全,被称为氨基酸残基(residue)。 多肽链(polypeptide chain)是指许多氨基酸之间以肽键连接而成的一种结构。 * 氨基酸残基(residue) *多肽链(polypeptide chain) 、 主链、侧链
肽键与肽 N 末端:自由氨基的一端(氨基端) C 末端:自由羧基的一端(羧基端) N末端 C末端 牛核糖核酸酶
要 求 一、蛋白质的分子组成 (一)了解蛋白质的元素组成 掌握蛋白质元素组成特点及其在蛋白质含量计算中的运用。 (二)掌握蛋白质的基本结构单位—20种氨基酸 的结构通式、中文名称及其分类 掌握氨基酸、肽键、肽、主链、侧链、 多肽链N-端、C-端的概念。
主要内容 蛋白质的分子组成 氨基酸和蛋白质的理化性质 蛋白质的分子结构 蛋白质分子结构与功能的关系
氨基酸的理化性质 1. 两性电离的性质 R 氨基酸是两性电解质,其解离程度取决于所处溶液的酸碱度
氨基酸的理化性质 1. 两性电离的性质 pH<pI 阳离子 pH=pI 氨基酸的兼性离子 pH>pI 阴离子 +OH- +H+
氨基酸的理化性质 1. 两性电离的性质 等电点(isoelectric point, pI) 在某一pH的溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等,成为兼性离子,呈电中性。此时溶液的pH值称为该氨基酸的等电点。
氨基酸的理化性质 1. 两性电离的性质 pH<pI 阳离子 pH=pI 氨基酸的兼性离子 pH>pI 阴离子 +OH- +H+
氨基酸的理化性质 2. 紫外吸收 色氨酸、酪氨酸的最大吸收峰在 280 nm 附近。 芳香族氨基酸的紫外吸收
氨基酸的理化性质 3. 茚三酮反应 氨基酸与茚三酮水合物共热,可生成蓝紫色化合物,其最大吸收峰在570nm处。由于此吸收峰值与氨基酸的含量存在正比关系,因此可作为氨基酸定量分析方法。
氨基酸的理化性质 1. 两性电离的性质 2. 紫外吸收 色氨酸、酪氨酸 280 nm 定量 R 1. 两性电离的性质 等电点(isoelectric point, pI) 在某一pH的溶液中,氨基酸解离成阳离子和阴离子的趋势及程度相等,成为兼性离子,呈电中性。此时溶液的pH值称为该氨基酸的等电点 2. 紫外吸收 色氨酸、酪氨酸 280 nm 定量 3. 茚三酮反应 氨基酸与茚三酮水合物 570 nm 定量
蛋白质的理化性质 (一)蛋白质的两性电离 蛋白质分子除两端的氨基和羧基可解离外,氨基酸残基侧链中某些基团,在一定的溶液pH条件下都可解离成带负电荷或正电荷的基团。
蛋白质的等电点( isoelectric point, pI) 当蛋白质溶液处于某一pH时,蛋白质解离成正、负离子的趋势相等,即成为兼性离子,净电荷为零,此时溶液的pH称为蛋白质的等电点。 生理条件下pH7.4蛋白质所带电荷? 电泳技术 相同条件下不同蛋白质的分子量、电荷不同,同一电场中移动速度不同
(二)蛋白质的紫外吸收 由于蛋白质分子中含有共轭双键的酪氨酸和色氨酸,因此在280nm波长处有特征性吸收峰。蛋白质的OD280与其浓度呈正比关系,因此可作蛋白质定量测定
(三)蛋白质的呈色反应 ⒈茚三酮反应(ninhydrin reaction) ⒉双缩脲反应(biuret reaction) 蛋白质和多肽分子中肽键在稀碱溶液中与硫酸铜共热,呈现紫色或红色,此反应称为双缩脲反应,双缩脲反应可用来检测蛋白质水解程度。
(四)蛋白质的高分子性质与胶体性质 蛋白质属于生物大分子之一,分子量可自1万至100万之巨,其分子的直径可达1~100nm,为胶粒范围之内。 超速离心:大小、形状不同---沉降速度 透析:孔径不同的透析袋 * 蛋白质胶体稳定的因素 颗粒表面电荷 水化膜
不沉淀 沉淀 不沉淀 水化膜 - + + - 带正电荷的蛋白质 在等电点的蛋白质 带负电荷的蛋白质 酸 碱 酸 碱 脱水作用 不稳定的蛋白质颗粒 酸 碱 不沉淀 沉淀 不沉淀
(五)蛋白质的变性、沉淀和凝固 维持蛋白质分子在水溶液中稳定、不易发生凝聚的因素 分散在溶液中的蛋白质分子发生凝聚,并从溶液中 水化膜:蛋白质分子表面亲水基团的存在 电荷: 正电荷或负电荷 分散在溶液中的蛋白质分子发生凝聚,并从溶液中 沉淀、析出的现象,称为蛋白质的沉淀。
常用的蛋白质沉淀法 盐析法 由于加入大量中性盐而破坏蛋白质的水化膜,中和所带的电荷,从而引起蛋白质的凝聚沉淀。 中性盐:硫酸铵、硫酸钠、亚硫酸钠和氯化钠 应用:分离蛋白质 不同蛋白质盐析时需要的盐浓度不同 血清球蛋白:半饱和硫酸铵溶液 清蛋白: 饱和硫酸铵
常用的蛋白质沉淀法 有机溶剂沉淀 有机溶剂如乙醇、甲醇、丙酮是脱水剂,能破坏蛋白质的水化膜而使蛋白质沉淀。 某些酸类沉淀 某些酸可与蛋白质的正离子结合成不溶性的盐沉淀,但沉淀的条件是PH<PI P NH3+ X- COOH P NH3+ COO- P NH3+ COOH H+ X-
常用的蛋白质沉淀法 重金属盐沉淀 重金属离子如铅、汞、银、铜等可与蛋白质的负离子结合,形成不溶性沉淀,但沉淀的条件是PH>PI。 P NH3 COO- P NH3 COOM P NH3+ COO- M+ OH- 加热凝固 加热使蛋白质变性,疏水基团暴露。
要 求 二、蛋白质的理化性质 (一)掌握蛋白质两性解离、等电点的概念及与其结构的 关系。 (二)掌握维持蛋白质亲水胶体稳定的两个因素。 掌握蛋白质沉淀的概念并熟悉沉淀的常用方法。 (三)了解蛋白质的颜色反应及吸收光谱特点。