Gateway Cloning
原理 利用Site-specific recombination(位點專一性重組)的特性 在原核生物中最為典型。這種重組依賴小範圍的同源序列聯會,重組只限於在這一小範圍內,其重組只涉及特定位置的短同源區或是特定點鹼基序列之間
原理 λ噬菌體DNA有兩種存在型式: 裂解狀態:噬菌體DNA在被感染的細菌中以獨立的環形分子結構存在 為了進入溶源狀態,游離的λ噬菌體DNA必須整合(integrate)到細菌DNA中去;而為了向裂解狀態轉化,原噬菌體DNA必須從細菌染色體DNA上切除(excise) 這兩種類型間的轉換即整合和切離,都是通過λ噬菌體DNA和細菌DNA之間的位點專一性重組實現的,這些特定位點叫做附著點(attachment site,att) 細菌染色體上的附著點稱為attB,長度大約25 bp,位於bio和gal基因之間,分為B、O、B'3個序列組分 噬菌體的附著位點稱為attP,由P、O和P'三個序列組成,長度為240bp
機制 DNA的整合反應涉及attB和attP的核心序列(O序列)中鏈的割裂與重接 首先在attP和attB位點上產生同樣的交錯切口,形成了5'-OH和3'-P的末端,交錯切口的5'單鏈區長7個鹼基。 attB和attP兩個核心區的斷裂完全相同,同位素標記試驗證明,連接過程不需要任何新的DNA合成 整合反應中,attB和attP兩個位點結合後,Int蛋白具拓撲異構酶I的活性,使兩個DNA分子的每一個單鏈斷裂,在一瞬間旋轉以後仍然在Int作用下連接成半交叉,形成重組中間體,即Holliday結構。接著另外兩個單鏈通過相同的過程斷裂重接,這樣便完成了整合過程。
機制
機制
實驗目的 將目標基因接到帶有特定序列的載體上 Ex.將TCP接到帶有YFP的載體上 TCP YFP TCP
實驗流程 Step 1 將PCR產物(目標基因)接到帶有attL1、attL2的載體(TOPO-D) TCP TCP
實驗流程 Step 2 讓帶有目標基因的載體(TOPO-D)和帶有我們所需特定序列及與attL1、attL2的同源序列attR1、attR2之載體(Destination 4C1)產生互換 TCP attL1 attL2 TCP attL1 attL2 kanamycin YFP attR1 attR2 ccdB attR1 ccdB attR2 YFP spectinomycin 同源序列產生互換,並將目標基因重組 致死基因
實驗流程 Step 3 互換後可得到四種結果:以spectinomycin篩選 含致死基因ccdB 沒換 有換 YFP attR1 attR2 ccdB attL1 attL2 ccdB YFP attR1 attR2 TCP TCP attL1 attL2 1 2 3 4 spectinomycin spectinomycin TOPO-D載體需kanamycin
實驗流程 結果 YFP attR1 attR2 TCP
限制位點酶切與Gateway比較