Homework 1 (10/11 13:00前交) chlu@mail.cmu.edu.tw 學號：106xxxxx 姓名：ＸＸＸ
根據以下條件，利用Protein Data Bank的Advanced Search，並列出所搜尋到的PDB ID。 Name Text Search X-ray Resolution Has Ligands Source Organism Browser (NCBI) Release Date 柯紹文 Hemoglobin 0.5~1.5 Yes Homo sapiens 1998-01-01~1999-12-31 張景富 Insulin 1.5~2.5 No 2000-01-01~2004-12-31 姚佳伶 Crambin 0.5~2.5 Crambe hispanica 1980-01-01~1999-12-31 蕭廷怡 Green Fluorescent Protein Aequorea victoria 1990-01-01~1999-12-31 徐 綾 Deoxyribonucleotidase 1.0~2.5 Homo sapiens 2000-01-01~2009-12-31 王靖涵 HIV integrase 2.0~2.5 Human immunodeficiency virus 曾賀德 Endonuclease VII 1.0~2.0 Enterobacteria phage T4 sensu lato 戴若雲 Serine racemase 1.5~3.0 2000-01-01~2014-12-31 柯廷揚 Myosin 1.5~2.0 Dictyostelium discoideum 2000-01-01~2003-12-31 張哲綱 MrkH Klebsiella pneumoniae 2015-01-01~2017-12-31
根據以下條件，利用Protein Data Bank的Advanced Search，並列出所搜尋到的PDB ID。 Name Text Search X-ray Resolution Has Ligands Source Organism Browser (NCBI) Release Date 崔雁茹 Colicin E9 1.5~2.0 Yes Escherichia coli 1995-01-01~2004-12-31 鄭宇倫 Hemoglobin 0.5~2.0 Homo sapiens 1998-01-01~1999-12-31 許芯緁 RANKL 1.5~3.0 2000-01-01~2015-12-31 許潔馨 D-amino acid oxidase 1.0~3.5 Sus scrofa 1995-01-01~2009-12-31 姚秉宏 Zinc finger 1.5~2.5 Drosophila melanogaster 2000-01-01~2014-12-31 劉守軒 Plastocyanin Phormidium laminosum 1995-01-01~2014-12-31 鍾妮津 Desulfoferrodoxin Desulfovibrio desulfuricans 柯宏欣 Deoxyribonucleotidase 1.0~2.5 Homo sapiens 2000-01-01~2009-12-31 黃翎瑄 Green Fluorescent Protein 2.0~2.5 No Aequorea victoria 1990-01-01~1999-12-31 周昱吟 Hemagglutinin 2.0~3.0 Influenza A virus 2000-01-01~2005-12-31
利用下列PDB ID : 2. 請列出該Protein Chain在SCOP與CATH兩個資料庫裡的分類。 3 利用下列PDB ID : 2. 請列出該Protein Chain在SCOP與CATH兩個資料庫裡的分類。 3. 利用PDBsum裡的Procheck分析 Name PDB ID 柯紹文 1BZ0(A) 王靖涵 1EMV(A) 張景富 1BJE(A) 曾賀德 1HYZ(A) 姚佳伶 1OEM(X) 戴若雲 1E7L(A) 蕭廷怡 1CRN(A) 柯廷揚 3L6B(A) 徐 綾 1C4F(A) 張哲綱 5KEC(A)
利用下列PDB ID : 2. 請列出該Protein Chain在SCOP與CATH兩個資料庫裡的分類。 3 利用下列PDB ID : 2. 請列出該Protein Chain在SCOP與CATH兩個資料庫裡的分類。 3. 利用PDBsum裡的Procheck分析 Name PDB ID 崔雁茹 3BQV(A) 劉守軒 1EPW(A) 鄭宇倫 1DFX(A) 鍾妮津 1AKL(A) 許芯緁 1MH9(A) 柯宏欣 1JQG(A) 許潔馨 1VE9(A) 黃翎瑄 1DOS(A) 姚秉宏 4U77(A) 周昱吟 1TI8(A)