Lib.ujs.edu.cn PubMed 检索与利用 刘海军 0511-88780103-8617.

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1 lib.ujs.edu.cn PubMed 检索与利用 刘海军 hjliu@ujs.edu.cn 0511-88780103-8617

2 lib.ujs.edu.cn 内容提要 一． PubMed 简介 二． PubMed 基本检索及检索规则 三． PubMed 高级检索 四． MeSH 主题词检索 五．检索结果查看与处理

3 lib.ujs.edu.cn 一、 PubMed 简介 1997 年，由美国国立医学图书馆 (NLM) 的下属部门 NCBI(National Center of Biotechnology Information) 开通 了自己的 Medline 免费检索网站 PubMed ，但是其提供内容 比原 Medline 数据库要多。 PubMed 是面向全球的免费的、权威的生物医学文献检索工 具。 网址： http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed 或： http://www.pubmed.gov http://www.pubmed.gov 特点：免费、全面、及时、智能、便捷

4 lib.ujs.edu.cn PubMed 身世由来 美国联邦政府 （ GOV ） 国立卫生研究院 （ NIH ） 国立医学图书馆 （ NLM ） 美国生物技术信息 中心 （ NCBI ） 美国《医学索引》 （ Index Medicus ， IM ）， 1879 年 《牙科文献索引》 （ Index to Dental Literature ） 《国际护理索引》 （ International Nursing Index ） 《医学主题词表》 （ MeSH ） Medline 1950 年 PubMed 1997 年 扩展 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed

5 lib.ujs.edu.cn PubMed 与 NCBI PubMed 是 NCBI 建立的 Entrez 检索 系统中的一个重要 的子库，而 Entrez 所有的子库又形成 了一个错综复杂的 网。 NCBI 数据库集群 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/

6 lib.ujs.edu.cn PubMed 收录范围 至 2011 年，收录了 80 多个国家或地区 37 种语言， 5600 多种 期刊。收录期刊以欧美为主，其中美国出版的期刊大约占 47% 。中国期刊（含港澳台） 123 种。 文献数据年增量约 50~90 万条，到目前为止共收录了 2200 多万篇文献。 其收录的文献以英文文献为主，约占 90% ， 3/4 有英文摘要。 主要以题录摘要为主，部分有全文链接（ PubMed Central ， PMC ）。 文献类型包括期刊、图书、会议文摘等。 文献内容包括生命科学、医学、药学、护理、牙科、心理 学、卫生保健、环境、食品和营养学等

7 lib.ujs.edu.cn PubMed 记录类型 PubMed 除了 1966 年以前的 OldMedline ，其余文献记录 按处理过程分 4 种类型（或状态）。 PubMed - as supplied by publisher PubMed - in process PubMed PubMed - indexed for MEDLINE 属于 Medline 收录范围，建立 ti 、 au 、 ab 等基本书目信息。 不属于 Medline 收录范围， 但也建立 ti 、 au 、 ab 等基 本书目信息。 赋予 MeSH 、 PT 等字段并被 index 。

8 lib.ujs.edu.cn 记录类型举例

9 lib.ujs.edu.cn NCBI 主页和 PubMed 入口 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/

10 lib.ujs.edu.cn PubMed 主页 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed 使用教程 常用工具更多资源 高级检索

11 lib.ujs.edu.cn 系统自动转换匹配检索词： 对常用医学名词自动在规范词索引（主题词、副主题词、 物质名称）中转换、并默认在所有记录字段中匹配。 直接输入检索词 或检索式 二、基本检索

12 lib.ujs.edu.cn 自动转换匹配： PubMed 对输入检索 框中的检索词进行智能化 地校对，将其逐步地与其 数据库中的各类术语匹配 的原则。 MeSH Translation Table MeSH 主题词转换表 Journals Translation Table 期刊名转换表 Common Phrase List 常用词组表 Author Index 作者索引表 No Mapping 检索词拆分 AND 自动词表转换

13 lib.ujs.edu.cn 逻辑运算 逻辑与 AND /& smoking AND lung-neoplasms 逻辑或 OR / | Hyperphagia OR Obesity 逻辑非 NOT Dyslexia NOT Child 括号 ( ) (vitamin c OR zinc) AND common cold 优先级 ( ) > NOT > AND > OR A B A AND BA OR BA NOT B

14 lib.ujs.edu.cn 截词检索 截词符： * 如 bacter*, 可以检出以 bacter 为词干的单词 bacteria 、 bacterium 等 最多 600 个单词。 截词检索时，系统的自动词语匹配功能和 MeSH 自动扩展功能将不 再被执行，如： heart attack* 将不映射到 MeSH 词 Myocardial Infarction 。 bacter* heart attack heart attack*

15 lib.ujs.edu.cn 强制检索 词组限制符： ” ” 限制系统拆分词组，把词组作为一个整体，如 ” gene silencing ” 、 ’’ Jiangsu University ” 。 强制检索时，系统的自动词表转换也将不再被执行。 “gene silencing” gene silencing Jiangsu University “Jiangsu University”

16 lib.ujs.edu.cn 限定检索 字段限定符： [ ] 把关键词限定在某个记录字段进行检索，如查找作者为 Crick 在 1993 年发表的有关 DNA 方面的文献： Crick[au] AND 1993[dp] AND DNA

17 lib.ujs.edu.cn 常用字段 缩写全称缩写全称 ABAbstractLALanguage AD Affiliation （机构） MHMeSH Terms AU Author （作者） PTPublication Type DPPublication DateSOSource CP Publication Country TA Journal Title （刊名） TIABTitle/abstractTI Title （篇名） ISISSN TWText Words

18 lib.ujs.edu.cn PubMed 字段大全

19 lib.ujs.edu.cn PubMed 运算符小结 逻辑算符： AND/&, OR/|, NOT, () 截词算符： * 强制算符： ” ” 字段限定符： [] 所有运算符必须是英文半角输入 英文字母不区分大小写

20 lib.ujs.edu.cn 检索词自动构建 和编辑器 字段限定 逻辑算符 三、高级检索

21 lib.ujs.edu.cn 索引功能 显示输入字母或单词开 头的所有词、词组

22 lib.ujs.edu.cn 检索历史 查看检索史 下载和清除 检索史

23 lib.ujs.edu.cn 四、 MeSH 主题词检索 MeSH 高级检 索和限定检索 NLM MeSH 主页 MeSH 浏览器

24 lib.ujs.edu.cn 什么是 MeSH 主题词 MeSH ： Medical Subject Headings 主题词：在标引和检索中用以表达文献主题的规范化的词 或词组。如： 主题词特点：规范、受控、可以组配副主题词。 MeSH 词表： NLM 从 1963 年起编制，每年更新，至 2014 年 有 16 个大类， 27149 个主题词， 83 个副主题词。

25 lib.ujs.edu.cn 什么是 MeSH 副主题词 副主题词 (Subheadings) ：论述主题某一方面内容的词， 对文献主题起限定作用。如： drug therapy( 药物疗法 ) 、 diagnosis( 诊断 ) 、 genetics( 遗传 ) 等。 涉及的其它概念： 款目词 (Entry Terms) ：主题词的同义词或相关词，也称入口词，作 用是将自由词引见到主题词。如： Vitamin C see Ascorbic Acid 类目词：对主题词进行学科分类设立的词。如： Nutritional and Metabolic Disease （ Non MeSH ） 特征词：用于表达文献中的某些特征，如对象、时间、地理位置和 文献类型等。如： Human

26 lib.ujs.edu.cn 主题词检索第一步 利用主题词法查找糖尿病 (Diabetes ) 治疗 (therapy) 方面的文献。 第一步：输入关键词查 找对应主题词

27 lib.ujs.edu.cn 主题词检索第二步 第二步：确定主题词

28 lib.ujs.edu.cn 第三步：选择副主题词 主题词 副主题词 加权检索：限定主要主题词 扩展检索：禁止下位词扩展 款目词 （主题词的同义词或近义词） 主题词检索第三步

29 lib.ujs.edu.cn 主题词检索第四步 第四步：添加到 检索式构建器 生成的主题 词检索式

30 lib.ujs.edu.cn 得到检索结果 检索表达式 检索结果记录数 一般关键词 检索结果数

31 lib.ujs.edu.cn 还嫌范围太大？ 勾选加权检索和 禁止扩展检索 检索式字段 限定有区别

32 lib.ujs.edu.cn 什么是主要主题词 ( MeSH major topic) ？ 对文献进行标引时，把跟 文献内容更相关的主题词 加 * ，给予更大权重，为 主要主题词。

33 lib.ujs.edu.cn 注意 1 ：多个主题词不能直接检索 系统提示找不到 相应主题词

34 lib.ujs.edu.cn 注意 2 ： MeSH 检索的不足 人工标引费时，最新论文还未标 MeSH 词（ In Process ），用 MeSH 会漏检。 Medline 不收录的文献， Supplied by publisher 的文 献，不标 MeSH 词。 新词、一些很专指的概念没有对应的规范词。 查上述类型的文献需结合自由词检索 MeSH 主页： http://www.nlm.nih.gov/mesh/meshhome.html http://www.nlm.nih.gov/mesh/meshhome.html

35 lib.ujs.edu.cn 五、检索结果 检索结果 结果过滤 关联数据 详细检索式

36 lib.ujs.edu.cn 检索结果过滤

37 lib.ujs.edu.cn 过滤后的文献记录

38 lib.ujs.edu.cn 结果排序与导出

39 lib.ujs.edu.cn 导出为 Medline 格式的文本文件

40 lib.ujs.edu.cn 导出到剪贴板 ( 临时保存 ) 只有 8 小时时限， 用于临时保存选定 记录，最多保存 500 条记录。

41 lib.ujs.edu.cn 导出到 MyNCBI 个人收藏夹 需要登录 MyNCBI

42 lib.ujs.edu.cn 查看单篇文献摘要信息 免费全文链接 查看文献类型及 MeSH 主题词 外部出版商及资源获取链接

43 lib.ujs.edu.cn 展开查看相关主题词 带 * 的是文献重点论述的主题， 即 Major Topic Headings

44 lib.ujs.edu.cn 对获取全文更感兴趣？

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46 lib.ujs.edu.cn 期刊网站全文 ( 网页格式 )

47 lib.ujs.edu.cn PMC 全文

48 lib.ujs.edu.cn 何为 PMC ？ PMC ： PubMed Central ，是 NCBI 建立的生命科学和医 学期刊全文开放获取（ Open Access ， OA ）数据库，以 电子副本形式保存生物医学原始文献全文，并向全球免费 提供检索和下载。

49 lib.ujs.edu.cn 内容回顾 PubMed 与 NCBI 、 PubMed 与 Medline PubMed 文献记录有 4 种类型 PubMed 具有自动词表转换功能 PubMed 运算符：与或非、截词、强制、字段限定 MeSH 主题词、副主题词、主题词检索四步骤（重点） 检索结果筛选过滤、排序、导出、全文链接