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目的基因的原核诱导表达及SDS-PAGE凝胶电泳
现代分子生物学大实验 目的基因的原核诱导表达及SDS-PAGE凝胶电泳
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实验目的 重点掌握表达载体构建的原理及方法 掌握目的基因原核诱导表达的原理及方法 了解目的蛋白质 “标签”纯化的基本原理和方法
掌握PAGE变性凝胶电泳的原理及方法 掌握考马斯亮蓝染色的方法
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实验原理 目的蛋白质的诱导表达 目的蛋白质的纯化 目的蛋白质的检测
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实验原理 蛋白质的表达:将克隆基因插入合适载体后导入宿主细胞表达大量蛋白质的方法。 体内很难分析单个蛋白质的作用
进行大量表达和纯化是为了在体外进行研究 应用于蛋白纯化、定位及功能分析等方面
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图 pET14b-His-TAT-EGFP-p38-16 peptides 融合蛋白
例 图 pET14b-His-TAT-EGFP-p38-16 peptides 融合蛋白 在Hela细胞中的荧光显微镜检测(×400)
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实验原理 原核细胞表达系统 真核细胞表达系统 酵母表达系统 大肠杆菌表达系统 昆虫表达系统 哺乳动物细胞表达系统
原核细胞表达系统 真核细胞表达系统 酵母表达系统 昆虫表达系统 哺乳动物细胞表达系统 表达的蛋白具有正常的活性、构象 技术难度较大、耗时、耗资 大肠杆菌表达系统 实验技术简单,时间较短,费用低,系统比较完备 不能有效地对重组蛋白质进行修饰加工,易形成包涵体
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实验原理 原核细胞表达系统菌株 菌株内源的蛋白酶过多,可能会造成外源表达产物的不稳定,所以一些蛋白酶缺陷型菌株往往成为理想的起始表达菌株。
堪称经典的BL21系列就是lon和ompT蛋白酶缺陷型,也是我们非常熟悉的表达菌株。 大名鼎鼎的BL21(DE3)融源菌则是添加T7聚合酶基因,为T7表达系统而设计。
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实验原理 原核表达质粒的构建 目的基因 表达载体 Plasmid Tag lacIq Promoter Ampr 多克隆位点
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实验原理 目的基因 / DNA / PCR / 酶切 / Primer 例: p38中抑制多肽16肽序列
GGA AGA ACA TTG TTT CCT GGT ACA GAC CAT ATT GAT CAG TTG AAG CTC F 5’-ACG GAT CC TA GGA AGA ACA TTG TTT CCT GGT-3’ R 5’-ACG GAT CC TTA GAG CTT CAA CTG ATC AAT ATG G-3’ 5’端引物中AC是随机保护碱基,G GAT CC是BamH I酶切位点,TA是为防止移码而引入的两个碱基,随后是编码16肽前7个氨基酸的碱基序列。 3’端引物中AC是随机保护碱基,G GAT CC是BamH I酶切位点,TAA是终止密码子的反向互补序列,随后是从编码16肽碱基序列的最后一个碱基开始的反向互补序列。
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实验原理 表达载体 元件 各种表达载体的不同之处 在于其表达元件的差异。
能将外源基因运载到大肠杆菌细胞中;在基本骨架的基础上增加表达元件,就构成了表达载体。 元件 启动子、终止子、核糖体识别序列 诱导性表达所需要的元件 操纵子序列 调控基因 多克隆位点 融合Tag 复制起始序列 筛选标记/报告基因 各种表达载体的不同之处 在于其表达元件的差异。
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实验原理 启动子、终止子、核糖体识别序列 操纵子序列及配套的调控基因 多克隆位点 复制起始序列 诱导性表达所需要的元件
启动子的强弱是对表达量有决定性影响的因素之一。从转录模式上看有组成型表达和诱导调控型表达。lac和Tac,PL和PR,T7是最常用的启动子, 转录终止子 核糖体结合位点 操纵子序列及配套的调控基因 诱导性表达所需要的元件 多克隆位点 复制起始序列
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实验原理 用作分离的载体蛋白被称为标签蛋白或标签多肽 (Tag)。
标签位于表达载体的多克隆位点的N端或者C端,能够与目的基因融合表达(N端或者C端融合表达)。 目前常用的标签有 组氨酸标签(His-Tag) 谷胱甘肽S转移酶(glutathione S transferase)标签(GST-Tag) 硫氧还蛋白(thioredoxin, Trx)标签 麦芽糖结合蛋白(Maltose Binding Protein, MBP) 蛋白质 A(protein A) 纤维素结合位点(cellulose binding domain)标签等。 一般对于小分子用较大的Tag(如GST)以获得稳定表达;而一般的基因多选择小Tag(如His)减少对目的蛋白的影响。
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实验原理 筛选标记/报告基因表达 抗药性基因,Amp是最常见的筛选标记,kana,新霉素,四环素,红霉素和氯霉素。
抗性基因的选择要注意是否会对研究对象产生干扰,比如代谢研究中要留意抗性基因编码的酶是否和代谢物相互作用。 GFP(绿色荧光蛋白)是最常用的报告基因了,半乳糖苷酶,荧光素酶。 一些融合表达Tag也有报告基因的功能。
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实验原理 常用表达载体 pGEX系列载体是谷胱甘肽S-转移酶(GST)融合蛋白表达系统的载体。
Ptac Promoter Amp pGEX - KG pET系列的载体是His6融合蛋白的表达载体。 T7 Kana pET - 14b
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实验原理 目的蛋白质的诱导表达 lacI q(Lactose)
lacI是大肠杆菌中lac 操纵子(Operon)的调节基因,它所表达的阻遏蛋白是lac 操纵基因(Operator)的抑制因子,抑制转录启动。 当有乳糖存在时,这种阻遏蛋白能与过量的乳糖结合而失去对操纵基因的抑制,使lac 操纵子上的结构基因lacZ(β-半乳糖苷酶)、lacY(透性酶)、lacA(乙酰基转移酶)得以正常表达,启动转录。 IPTG(异丙基-β-D-1-硫代半乳糖苷) 作为乳糖的类似物与lacI阻遏蛋白结合而使操纵基因不被抑制,因此IPTG经常作为lac 操纵子的诱导剂而使用。
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实验原理 AmpR Plasmid pGEX-KG GST lacIq Ptac Promoter Ampr IPTG 多克隆位点
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Nde I BamH I cDNA Nde I BamH I 酶切 基因片段 酶切 酶切后的目的基因 连接 转化 筛选(蓝白斑)
原核表达质粒的构建成功 鉴定(PCR、酶切、测序)
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实验原理 原核表达的诱导条件 IPTG浓度: mmol/L 诱导时间:~3h 诱导温度:15-42℃
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实验原理 目的蛋白质的纯化 破碎细胞 从细胞蛋白中纯化出GST和His融合蛋白 超声破碎 溶菌酶裂解
GST可以通过谷胱甘肽-琼脂糖亲和层析进行纯化。由于GST对谷胱甘肽的亲和力非常高,因此可以利用谷胱甘肽固化于琼脂糖形成的亲和层析树脂对GST及其融合蛋白进行纯化,最后通过含有游离的谷胱甘肽的缓冲液,洗脱结合的GST融合蛋白。 Poly His多聚组氨酸能与多种过渡金属或过渡金属鳌和物结合,因此带HIS-6的蛋白能结合与固化的Ni2+树脂,用适当的缓冲液(PBS)洗冲洗去除其他杂蛋白后,再用可溶的竞争性鳌合剂(咪唑)洗脱可以回收靶蛋白。
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实验原理 目的蛋白质的检测 蛋白质分子量的检测 SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳 目的蛋白质的分析
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实验原理 十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)是目前用于测定蛋白质分子量最好的方法。
SDS是一种强阴离子型去污剂,能断裂分子内和分子间的氢键,使分子去折叠,破坏蛋白质分子的二级和三级结构。在样品和凝胶中加入SDS和还原剂后,强还原剂例如β巯基乙醇和二硫苏糖醇能使半胱氨酸残基之间的二硫键断裂,通过加热使蛋白质解离。解离后的氨基酸侧链与SDS结合形成带负电荷的蛋白质-SDS复合物。
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蛋白质中加入 SDS 并加热, SDS 分子上的非极性区 (黄色尾巴)会与蛋白质上的非极性区结合,使蛋白质变性,成为一线状长条分子,上面布满 SDS 分子。SDS 分子的极性区 (洋红色圆点),则露在外面,以增加亲水性。 SDS是一种阴离子表面活性剂,能打断氢键和疏水键,并按一定的比例和蛋白质分子结合成复合物,使蛋白质带负电荷的量远远超过其本身原有的电荷,掩盖了各种蛋白质分子间的天然的电荷差异。SDS最终使蛋白质变成具有高负电荷的线状分子。
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97.0 kDa
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实验准备
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仪器与设备 诱导、培养 37℃恒温摇床 电泳检测 Hoefer miniVE Vertical Electrophoresis System
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实验试剂 LB培养基、Amp、IPTG 30%丙烯酰胺贮液
1.0M Tris(PH6.8)(浓缩胶),1.5M Tris(PH8.8)(分离胶) 10%SDS,10%过硫酸铵(AP),四甲基乙二铵(TEMED) 1XTris-甘氨酸电泳缓冲液:25mM Tris, 250mM 甘氨酸,0.1% SDS 1xSDS上样缓冲液:50mM Tris-HCl(6.8),100mM DTT,2% SDS,10% 甘油,0.1% 溴酚蓝 染色液:90甲醇:90冰乙酸:20水+0.5g R-250 脱色液:90甲醇:90冰乙酸:20水
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实验步骤
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实验步骤 培养 诱导 样品制备 SDS-PAGE 凝胶检测
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目的蛋白质的诱导表达及检测 1)挑取单菌落,接入3ml含氨苄青霉素(50ug/ml)的LB培养液, 37℃培养过夜。
2)取50ul过夜培养物接入3ml含氨苄青霉素(50ug/ml)的LB培养液,37℃振荡培养2h以上,至对数中期(A600=0.5~0.6)。 3)吸出500ul未经诱导的培养物放在一个微量离心管中,室温高速离心1min,沉淀悬浮于100ul 1 x SDS凝胶加样缓冲液,100度加热3min,室温高速离心1min,冰上放置。 4)在剩余培养物中加入IPTG至终浓度1mmol/L,37 ℃继续培养3h,取500ul样品放于微量离心管中,室温高速离心1min。 5)沉淀悬浮于100ul 1 x SDS凝胶加样缓冲液,100度加热3min,室温高速离心1min,冰上放置,待全部样品处理完后上样。
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SDS-PAGE 30min)后将电压调至120V,待指示剂(溴酚兰)到达凝胶 的底部距离下缘1cm时停止电泳,大约需2h,电泳结束。
6 )将电泳槽玻璃板洗净,吹干,并用凡士林封边,安装好 7 )配12%分离胶,将配好的分离胶立即倒入凝胶槽内,至凝胶槽 高三分之二处,加蒸馏水密封。待胶凝固后(约需 30min倒掉 水,用吸水纸吸干 8)配5%浓缩胶将配好的浓缩胶立即倒入凝胶槽内(以插入梳子不 溢出为宜),插入梳子 9)待胶凝固后,拔出梳子,放入电泳槽中 10)制备好的样品加入上样孔 11)连接电泳仪 12)打开电源,调整电压至80V,待样品跑过浓缩胶(大约需 30min)后将电压调至120V,待指示剂(溴酚兰)到达凝胶 的底部距离下缘1cm时停止电泳,大约需2h,电泳结束。
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聚丙烯酰胺凝胶配制(mini VE) 12%分离胶 5%浓缩胶 H2O 2.45 ml 2.05ml 30%丙稀酰胺 3.0 ml
Tris 缓冲液 1.9 ml(1.5M pH8.8) 375ul (1.0M pH6.8) 10%SDS 75 ul 30ul 10%过硫酸铵 TEMED 3 ul 3ul 注:1 . 丙稀酰胺为神经毒剂,使用时要小心,操作请务必戴手套。 2. 过硫酸铵需新鲜配制,并注意浓度,否则影响胶凝固。 3. 1块胶可以用10 ml离心管,2块胶要使用小三角瓶便于混匀,配制 后余液可暂时留存,便于参考胶凝固时间,一般30min即可。
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目的蛋白质的检测-考马斯亮蓝染色 考马斯亮蓝R250(coomassie brilliant blue)是一种三苯甲烷纺织染料,又称酸蓝83,分子上含有两个S03H基团,偏酸性,能结合在蛋白质的碱性基团上。 能够检测出大于0.1ug蛋白条带。
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凝胶染色 将凝胶浸泡在染色液中,室温在摇床上缓慢染色4小时(或过夜)。
脱染:将染液回收,凝胶先用蒸馏水漂洗一次,浸入脱染液中脱染,室温浸泡凝胶或37℃加热使其脱色,更换几次脱色液,直至出现清晰的电泳带为止。 脱色后,将凝胶保存在水中或是20%甘油的水中。
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作业 按要求认真撰写报告,包括实验目的、实验原理、实验材料、实验用品及药品、实验步骤、实验结果。 阐述目的基因表达载体的构建。
分析实验结果。 包涵体的出现是目的基因的原核表达中常见问题,其发生原因是什么,如何解决?
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实验结果与分析
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