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流式细胞术 在微生物学中的应用 彭公峰
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流式细胞术原理
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流式细胞术在微生物学中的应用
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FISH-FCM技术检测活性污泥中微生物群落结构
1.制备活性污泥悬浊液 2.制备菌悬液以及原位杂交 3.流式细胞仪的校正以及cell quest软件分析
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将阴性区域设定在Rejected region内,G1中的每一个小点均代表探针阳性细胞,利用CellQuest软件统计G1中的微生物数目
5‘端经过羧基荧光素标记,适量的甲酰胺溶液,目的是为了增加探针杂交严格性,探针BET与GAM 之间只有一个碱基的差别
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100~10 1区域为NON探针标记的阴性区域,FL1一H 值大于10 的区域为阳性区域 类群相对含量(%)=特异性探针标记的细胞数目/探针
I:Eucarya ;2:Proteobacteria;3:BProteobacteria; 4: Proteobacteria; 5:Comamonas spp. A.bacteria;B:Eucarya ;c:d-Proteobacteria;D:B Proteobacteria;E: Proteobacteria;F:Comamonas spp. 100~10 1区域为NON探针标记的阴性区域,FL1一H 值大于10 的区域为阳性区域 类群相对含量(%)=特异性探针标记的细胞数目/探针 EUB标记的数目X100%
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FISH-FCM 方法检测酵母-细菌 二元体系中微生物数量
微生物样品固定(E.COLI,酵母,两种二元体系) 荧光原位杂交(细菌通用探针EUB33,5’端用荧光染料Cy5修饰;酵母探针为PF2,5’端用荧光染料Cy3修饰) 流式细胞仪计数 微生物样品超声预处理研究 FISH-FCM同时检测不同浓度的细菌与酵母数量
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染色后的细菌或酵母都能够发出强烈荧光,并与荧光微球、噪音
明显分开。
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FISH杂交后微生物散点图 图a为细菌单一体系的FI4—SSC散点图,图b为酵母单一体系
的FL2-SSC散点图,图c为二元体系的FL2一FIA双通道散点图
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单一体系和二元体系中酵母数量测定 单一体系和二元体系中细菌数量测定 Measured concentration(cell/ml)
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