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第四章 遗传信息的的复制
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DNA by RNA中间体复制(少数DNA病毒) RNA复制 (RNA病毒) RNA by DNA 中间体复制(逆转录病毒,
基因组复制的四种形式: DNA复制 DNA by RNA中间体复制(少数DNA病毒) RNA复制 (RNA病毒) RNA by DNA 中间体复制(逆转录病毒, 真核生物端粒DNA)
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第一节 DNA复制(replication)
以亲代DNA为模板合成子代DNA的过程 一、复制特点 1、起始点和方向 (1)复制起始点(origin of replication,ori): 原核生物 只有一个. 真核生物有多个. 单向复制: 从两个起点,以反向单一方向复制 从一个起点以同一方向复制 双向复制: 从一个起点,以两个相反方向复制. (2) 方向: P52
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2.复制的方式 (1)半保留复制(semi-conservative replication)
(2)半不连续复制(semi-discontinuous replication ) DNA 聚合酶只能以5'3'方向催化合成 前导链(leading strand) 后随链(lagging strand) :岗崎片段
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复制的起始 DNA链的延长 复制的终止 (3)基本过程: 小电影 DNA解旋、解链 RNA引物合成 DNA链的延长 切除引物、填补缺口 切除和修复错配碱基 具体:
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冈奇片段中引物的切除
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二、原核生物DNA的复制 (一)参与复制的酶与蛋白质 30多种酶与pr参与 1、DNA聚合酶(DNA polymerase,DNA pol)
作用:催化DNA合成,需Mg2+ 大肠杆菌有三种: A:聚合作用:5‘3’,10nt/sec,20个nt后脱落 B:3'5'外切酶活性:校对功能 C:5‘3’外切酶活性:参与RNA引物的切除、 修复作用 DNA pol 1 (三种功能) DNA pol 2 功能不清楚 真正的复制酶,10个亚基组成, 1000nt/sec,5000 nt后脱落 3'5'外切酶活性:校对功能 DNA pol 3
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2、引物酶: DNA pol只能延长,不能从头合成 需一小段RNA(RNA聚合酶(primase)催化完成) 3、解旋及解链的蛋白质 解链酶(DNA helicase) 拓扑异构酶(DNA topoisomerase,topo) 单链结合蛋白(single strand DNA binding pr,SSB) 4、DNA连接酶(DNA ligase): 连接DNA分子中的缺口,需ATP.
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(二)复制过程 原核生物---大肠杆菌 1. 复制的起始: 起始复合物的形成 : oriC + DnaA pr(局部解链)
DnaA引导DnaB/ DnaC 进入 引发前体形成 : DnaB是一种解链酶 Topo2 打结 SSB结合到单链 解链酶解链: 引物合成: RNA引物合成酶 DNA pol 3 进入复合体: 亚基识别引物3'-OH
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3个13bp 序列 大肠杆菌oriC基因排列示意图 4个9bp序列,DnaA蛋白结合位点
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2、DNA链的延长 DNA pol 三个作用特点决定了DNA链延长的特点 必须以DNA为模板DNA的复制为半保留复制 DNA pol 只能延长,不能从头合成需要RNA引物 合成方向只能5'3', 半不连续复制 3.复制的终止 一般无特殊的终止信号 到DNA分子末端or两个复制叉相遇即终止
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三、其他环状DNA的复制 1、复制: 环状DNA在 ori处解链,两条链分别作为模板进行 复制。
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2、滚环复制 环状DNA 一条链解开,以未解开的链为模板,在开链的3'端不断加上核苷酸。
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3、D环复制: 线粒体DNA的复制。
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四、真核生物染色体DNA的复制 (一)复制起始点及方向: 多起点、双向复制
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(二)DNA pol : 、、、 四种 :DNA链合成的引发 :链的延长 RNA引物空隙的填补 :外切酶活性修复和校正 作用 :线粒体DNA复制 (三)末端复制与端粒酶 由端粒酶(telomerase)参与完成 逆转录酶(由RNA和蛋白质组成)
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合成过程(图4-11): 端粒酶中RNA模板与DNA中的TG引物结合 端粒酶以RNA为模板在DNA末端聚合(加nt) 移位:DNA与RNA重新配对 聚合 至于CA链的合成,目前不清楚
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真核复制与原核复制不同点: 1.真核中,引物及岗崎片段较小 2.真核中,同步合成组蛋白,形成核小体
3.真核中,在全部染色体复制完成以前,各ori不能开始下 一轮复制.
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第二节 DNA的损伤与修复 一、DNA的损伤 复制过程中发生的DNA 突变 常见方式有四种: 点突变 1、嘌呤嘌呤(AT)
point mutation 1、嘌呤嘌呤(AT) 嘧啶嘧啶(CG) 转换(transition) 颠换(transversion) 2、嘧啶嘌呤 3.移码突变(frame shift mutation) :丢失or插入一个or 一段nts 4、链内或链间发生共价连接 .如 T-T, C-T,C-C
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二、DNA损伤的修复 (一)光修复: 图 光复活酶(photolase)
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(二)切除修复:图4-13 主要修复方式 内切酶切除损伤DNA DNA pol 1 填补空隙 DNA连接酶封口
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(三)重组修复(recombination repairing)
损伤面积较大DNA,先复制后修复 复制(损伤部位调过) 重组修补缺口(从另一DNA分子上移过来) 修复(正常DNA上的缺口补齐)
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DNA损伤严重,细胞处于危急状态 recA 蛋白酶被激活 水解lexA(抑制蛋白) SOS修复酶系大量表达
(四)SOS修复(SOS repairing) 应急修复机制 DNA损伤严重,细胞处于危急状态 recA 蛋白酶被激活 水解lexA(抑制蛋白) SOS修复酶系大量表达
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指以RNA为模板,RNA指导的DNA聚合酶以5'3'方向合成与RNA互补的DNA链的过程。
第三节 逆转录 指以RNA为模板,RNA指导的DNA聚合酶以5'3'方向合成与RNA互补的DNA链的过程。 一、 逆转录酶(reverse transcriptase) 1970年在鸡肉瘤病毒Rous中首次发现 多功能酶: A:具有RNA指导的DNA Pol活性,沿5'3'方向合成,需引物 B:具有RNA 酶H(RNase H)活性,可特异水解RNA-DNA上的RNA. C:具有DNA 指导的DNApol活性,可以cDNA为模板合成互补NDA D:对DNA无3'-5'外切酶活性,所以无核对功能.
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二、逆转录病毒的基因组复制过程 逆转录病毒的基因组为RNA 在宿主cell中必须转变为DNA,才能进行基因表达和基因组复制. 过程: 逆转录病毒的结构
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(1)以+RNA为引物合成一小段(-)cDNA(5'3')
(2)RNase H活性切去DNA-RNA中的RNA (3)DNA R与RNA3'端R结合 (第一次跳跃) (4) (-)cDNA合成(5'3') (5)RNase H除去DNA-RNA中的大部分RNA (6)合成一部分(+)DNA(5'3')包括PB- (7)除去RNA(tRNA,RNA中的PB+区) (8)(+)、(-)股DNA中的PB-结合(第二次跳跃)
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(9)合成剩余的(+)DNA(5'3') 形成双链DNA 可随机插入宿主细胞染色体.
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第四节 RNA的复制 某些大肠杆菌噬菌体(f2、MS2、R17、Qetc)和动物RNA病毒.
以RNA为模板,在RNA指导的RNA聚合酶作用下,按5'-3'方向合成互补RNA的过程 RNA复制酶(RNA replicase): A:由四个亚基组成,只有一个为病毒产物 B:缺乏校对功能,错误率较高 C:只特异地对病毒RNA起作用
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