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NCBI教學.

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1 NCBI教學

2 Google搜尋NCBI

3 選擇該網站,或開啟下列網址 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/

4 搜尋 Cmap藥物名稱 選擇PubChem Compound

5 搜尋結果 選擇較前面的去做之後的動作

6 點選13.Biological Test Results

7 點選Download,CSV Save 下載Excel檔案

8 開啟Excel檔案,選擇資料、篩選

9 taxid選擇9606(人類)

10 actvty選擇active

11 acname選擇IC50

12 例外狀況!!(範例alexidine) 可能篩選完,沒有半個geneid,這時候可以選擇其他搜尋結果(P4)
不然就是無法在NCBI找到有效的geneid

13 geneid複製出來

14 移除重複 將geneid拿去David找出

15 David教學

16 Google搜尋David

17 選擇該網站,或開啟下列網址 http://david.abcc.ncifcrf.gov/

18 選擇Gene ID Conversion

19 Step.1 貼上genid 空白要刪除 錯誤範例 ENTREZ_GENE_ID List

20 請照步驟操作 1.Gene ID Conversion 2.OFFICIAL_GENE_SYMBOL 3 會跑一段時間,但是太久請重新提交

21 GENE_SYMBOL


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