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NCBI教學
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Google搜尋NCBI
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選擇該網站,或開啟下列網址 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
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搜尋 Cmap藥物名稱 選擇PubChem Compound
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搜尋結果 選擇較前面的去做之後的動作
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點選13.Biological Test Results
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點選Download,CSV Save 下載Excel檔案
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開啟Excel檔案,選擇資料、篩選
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taxid選擇9606(人類)
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actvty選擇active
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acname選擇IC50
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例外狀況!!(範例alexidine) 可能篩選完,沒有半個geneid,這時候可以選擇其他搜尋結果(P4)
不然就是無法在NCBI找到有效的geneid
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geneid複製出來
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移除重複 將geneid拿去David找出
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David教學
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Google搜尋David
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選擇該網站,或開啟下列網址 http://david.abcc.ncifcrf.gov/
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選擇Gene ID Conversion
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Step.1 貼上genid 空白要刪除 錯誤範例 ENTREZ_GENE_ID List
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請照步驟操作 1.Gene ID Conversion 2.OFFICIAL_GENE_SYMBOL 3 會跑一段時間,但是太久請重新提交
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GENE_SYMBOL
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