站在医药研发最前沿 ——Integrity数据库使用实例

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站在医药研发最前沿 ——Integrity数据库使用实例 李敬芝 汤森路透 2014.9.11

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Integrity解决如下问题(实战操作) 1.Thomson Reuters Integrity数据库基本简介 2.信息情报最前沿(新闻,专利,会议,新分子实体,基因研究,临床试验快讯) 3.如何深入研读一篇疾病综述?(多维度) 4.“药物检索”(多重检索条件限制,强大筛选功能) 4.1设置专属Email跟踪获取更新内容 4.2构效关系比较(IC-50等数据的排序和取平均值) 5.最新靶标跟踪及特定靶点研究进展剖析(关联在研药物给出评级;关联疾病适应症的分类整理) 6.结构式检索

Thomson Reuters Integrity 数据库 服务于医药研发全过程的信息平台 为药物研发项目提供及时、准确的相关信息 特点: - 事实型数据库 - 针对药物研发 - 每天更新 - 信息准确 - 专家意见 - 深度索引、高度关联 Company Confidential – For internal use only

Thomson Reuters Integrity 数据库主要内容 药物(包括化药与生物药) 437,645( 400,999化学结构式数据 ) 药物靶标以及发病通路图 2,522 药物靶标 药物/疾病相关的基因组学信息 33,405 相关基因 化学合成 26,661合成路线 药理/毒理试验数据 1,627,574药理/毒理 药代动力学/药物代谢试验数据 645,587药代/药动 疾病相关的综合性评述 148疾病综述 临床试验方案/结果 234,287临床试验 研发单位 14,926家企业或研发机构 文献期刊及会议 1,819,195个记录 专利文献 270,600个专利家族 实验模型 26,905实验模型 数据采集截至:2014年9月10日

Thomson Reuters Integrity帮助您了解: 监测国际最新研发动态 及时获取国际上的研发新闻 跟踪早期药物研发产品管线 了解药物开发全貌和 靶标、合成等最新进展 药理学实验数据比较 寻找具有某药理学特性的相关药物 比较同一领域/类似结构等药物之间的药理学活性 靶标进展报告和通路图 了解某一靶标的研发进展、研究领域、作用机理等 促进药物设计及基础机理的研究 疾病综述 了解疾病研发历史、重要靶标、主流药物、治疗方法等 申请基金或课题时作为课题背景信息来源

Integrity解决如下问题(实战操作) 1.Thomson Reuters Integrity数据库基本简介 2.信息情报最前沿(新闻,专利,会议,新分子实体,基因研究,临床试验快讯) 3.如何深入研读一篇疾病综述?(多维度) 4.“药物检索”(多种检索条件限制,强大筛选功能) 4.1设置专属Email跟踪获取更新内容 4.2构效关系比较(IC-50等数据的排序和取平均值) 5.最新靶标跟踪及特定靶点研究进展剖析(关联在研药物给出评级;关联疾病适应症的分类整理) 6.结构式检索

信息情报最前沿(新闻,专利,会议,新分子实体,基因研究,临床试验快讯)

信息情报最前沿(新闻,专利,会议部分) 制药行业重要新闻 当天发布的重要专利 重要行业会议 快速了解行业内发生的信息:新闻(新药被批准上市或III期)、新发布的专利、会议。 药物领域,会议非常重要,有很多信息各药厂会议披露,期刊里没有,查不到。 重要行业会议

编辑人员阅读后对内容的高度概括

信息情报最前沿(新闻,专利,会议部分) 制药行业重要新闻 当天发布的重要专利 重要行业会议 快速了解行业内发生的信息:新闻(新药被批准上市或III期)、新发布的专利、会议。 药物领域,会议非常重要,有很多信息各药厂会议披露,期刊里没有,查不到。 重要行业会议

专利号及申请人 专利标题 主题 相关适应症 核心化合物 专利号及申请人 专利标题 主题 相关适应症 核心化合物

优先权数据:优先权年,国家代码,优先权号 专利题目 申请人 发明人 专利号 公开时间 法律状态链接l 优先权时间 优先权数据 最新更新时间 主题 适应症 原始摘要 Integrity改写摘要 相关信息(药物,公司)

Integrity药物编辑团队提供的文摘 专利原文中的摘要,翻译为英文

信息情报最前沿(新闻,专利,会议部分) 制药行业重要新闻 当天发布的重要专利 重要行业会议 快速了解行业内发生的信息:新闻(新药被批准上市或III期)、新发布的专利、会议。 药物领域,会议非常重要,有很多信息各药厂会议披露,期刊里没有,查不到。 重要行业会议

Meeting Team参加会议,相关信息收集 将会议中披露的化合物与相关靶点、结构,药理数据等做链接标引,加工到数据库中——美国之行的收获!

信息情报最前沿(新闻,专利,会议,新分子实体,基因研究,临床试验快讯)

新闻周刊:本周视点 上周公布的具有生物活性的新分子实体 上周具有重要里程碑变化的在研药物 上周最热点的基因研究 上周重要专利发布 上周临床试验快讯

研发机构名称 产品名称(代码) 适应症 备注信息 上周公布的具有生物活性的新分子实体 研发机构名称 产品名称(代码) 适应症 备注信息 NME,一种化合物,第一次在生物医药类文献或者行业会议或者公司通报中出现的,研究代码或者化学名称,NME的状态保持4个月。 Wnt是一类分泌型糖蛋白,通过自分泌或旁分泌发挥作用。

上周具有重要里程碑变化的在研药物 研究机构 产品 适应症 里程碑 国家 注释说明

基因名称 生物体来源 适应症 研究水平 研究模型 原始文献 上周最热点的基因研究 基因名称 生物体来源 适应症 研究水平 研究模型 原始文献 基因组学研究 分子水平研究 胃癌细胞株

研究名称 生物标志物 方案设计 例数 结论/结果 详细来源 上周临床试验快讯,来自Clinicalgov.com 研究名称 生物标志物 方案设计 例数 结论/结果 详细来源

Integrity解决如下问题(实战操作) 1.Thomson Reuters Integrity数据库基本简介 2.信息情报最前沿(新闻,专利,会议,新分子实体,基因研究,临床试验快讯) 3.如何深入研读一篇疾病综述?(多维度) 4.“药物检索”(多重检索条件限制,强大筛选功能) 4.1设置专属Email跟踪获取更新内容 4.2构效关系比较(IC-50等数据的排序和取平均值) 5.最新靶标跟踪及特定靶点研究进展剖析(关联在研药物给出评级;关联疾病适应症的分类整理) 6.结构式检索

如何检索一篇特定疾病综述? 1. “Disease Briefing”检索入口 1)编写检索式 2)根据疾病所属类别直接链接 2. 任何检索结果下的“Related Information”中的“Disease Briefing”链接

“Disease Briefing”检索入口

药物报告/靶点报告直接链接查看疾病综述 依曲康唑

研读疾病综述:一篇疾病综述里面到底有什么? 糖尿病的基本概况 1)分类:I型,II型,妊娠型,前驱型糖尿病和代谢综合征等。 2)病理学 3)危险因素 4)流行病学 5)发病率和死亡率 6)治疗费用 美国肺癌病人每个月的花费是USD6,520,从诊断到死亡或最多治疗2年的病人平均花费为USD45,897。(2005年)

二.诊断 三.预防 四.治疗 五.药物作用靶点(I型和II型糖尿病的靶点通路图) 六.最新头条 七.专业术语(动画)

专业术语的整合 动画解读机理过程

阅读大量文献,将靶点与疾病相关联,并且对靶点在研药物也做了关联。

一.糖尿病的基本概况 1)分类 2)病理学 3)危险因素 4)流行病学 5)发病率和死亡率 6)治疗费用 二.诊断 三.预防 四.治疗 五.药物作用靶点(I型和II型糖尿病的靶点通路图) 六.最新头条 七.专业术语(动画) 链接: 1)网站 2)出版物 3)指南 相关信息: 1)药物 2)文献

重要网站 重要出版物 疾病指南

一篇综述内容来自468篇文献

Integrity解决如下问题(实战操作) 1.Thomson Reuters Integrity数据库基本简介 2.信息情报最前沿(新闻,专利,会议,新分子实体,基因研究,临床试验快讯) 3.如何深入研读一篇疾病综述?(多维度) 4.“药物检索”(多重检索条件限制,强大筛选功能) 4.1设置专属Email跟踪获取更新内容 4.2构效关系比较(IC-50等数据的排序和取平均值) 5.最新靶标跟踪及特定靶点研究进展剖析(关联在研药物给出评级;关联疾病适应症的分类整理) 6.结构式检索

“药物检索”(多重检索条件限制,强大筛选功能) 系统编号 药物名称 化学名 CAS号 分子量 最高研发阶段 上市/注册时间 研究组织/相关研究组织 适应症 治疗领域 作用机制 产品概述 产品分类 天然产物来源 自XX时间段起

多种条件限制检索意味着,您可以从43万化合物中: 您可以了解某适应症/治疗领域的所有在研化合物 您可以了解某研发阶段全球在研pipeline? 您可以了解某类(生物药,中药,化学药)全球有多少种及在研情况? Filter 利用不同筛选结果界面的“Filter”过滤功能对检索结果进行精炼

举例:以thrombosis为适应症检索 该页面下需要学会三种操作方式

Integrity数据库所有模块里的界面从“功能”角度都是这三部分,请谨记!!! 保存检索式 邮件提醒 导出中心 Integrity报告 点击查看一篇完整的药物报告 过滤筛选 检索结果进行分析:药物技术类型;药物来源;治疗领域;作用机制;研发机构;研发阶段;药物靶标;给药途径等等

过滤功能演示:研发阶段精炼

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Integrity数据库所有模块里的界面从“功能”角度都是这三部分,请谨记!!! 保存检索式 邮件提醒 导出中心 Integrity报告

Keep Me Posted:对选定的某条记录设置邮件提醒 对页面下的“检索式结果”设置提醒

Integrity数据库所有模块里的界面从“功能”角度都是这三部分,请谨记!!! 保存检索式 邮件提醒 导出中心 Integrity报告

Export Center:选择希望导出的内容,导出报告,格式一般为Excel,Word

Integrity Report:导出报告,类型和内容固定,在主页的Report里下载

Integrity数据库所有模块里的界面从“功能”角度都是这三部分,请谨记!!! 点击查看一篇完整的药物报告

Integrity解决如下问题(实战操作) 1.Thomson Reuters Integrity数据库基本简介 2.信息情报最前沿(新闻,专利,会议,新分子实体,基因研究,临床试验快讯) 3.如何深入研读一篇疾病综述?(多维度) 4.“药物检索”(多重检索条件限制,强大筛选功能) 4.1设置专属Email跟踪获取更新内容 4.2构效关系比较(IC-50等数据的排序和取平均值) 5.最新靶标跟踪及特定靶点研究进展剖析(关联在研药物给出评级;关联疾病适应症的分类整理) 6.结构式检索

构效关系比较(结构与IC-50;取平均值) 对系列化合物的构效关系比较:临床II期的90个药物

90个药物获得550条药理数据记录 找到统一的比较数据:IC-50 做出构效关系列表 对感兴趣的药物进行IC-50平均值计算

90个药物获得550条药理数据记录 找到统一的比较数据:IC-50 做出构效关系列表 对感兴趣的药物进行IC-50平均值计算

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进入检索中心-靶标检索

最新靶标跟踪

Validated:有活跃(UAD)的药物在临床前及之后的阶段。 Candidate:有活跃(UAD)的药物在临床前及之后的阶段,但目前处于不活跃阶段(NDR)。 Exploratory:药物都在活性测试阶段。

靶点报告: 1)靶点通路图 2)将靶点与在研适应症做关联 3)将适应症下的在研药物做关联 4)将该靶点在研的“后期”药物做关联

Integrity解决如下问题(实战操作) 信息情报最前沿(新闻,专利,会议,新分子实体,基因研究,临床试验快讯) 如何深入研读一篇疾病综述?(多维度) “药物检索”(多重检索条件限制,强大筛选功能) -----比较药理学活性(IC-50等数据的排序和取平均值) ------设置专属Email跟踪获取更新内容 最新靶标跟踪及特定靶点研究进展剖析(关联在研药物给出评级;关联疾病适应症的分类整理) 结构式检索

结构式检索:首先明确4个问题 安装JAVA运行,根据数据库提示 可以画图,也可以导入现有结构 可以设置相似度来检索结构相似的化合物 除了基因组和靶点模块之外,其他模块都可以进行结构式检索

Integrity结构式检索 这就是结构式检索页面,您可以输入您的检索策略 (CLICK) 点击 Guide to Structure Search,打开新窗口,您可以阅读Integrity结构式编辑器的帮助文档 (CLICK) 这是目前正在使用的的结构式编辑器,如果您点击“Click here to change to another structure editor”,您可以浏览Intehrity兼容的结构式编辑器

结构式检索指南 Integrity 兼容4种结构式编辑器: Symyx Draw, Symyx MDL ISIS Draw, ChemAxon Marvin Applet and CambridgeSoft CS ChemDraw 进行结构式检索. 点击相应的链接选择最适合您的结构式编辑器.另外,您可以在这里找到下载Chemdraw插件和订购SYMX 编辑器的链接.

2. 结构式检索插件切换及下载指南

导入电脑中保存的结构式 2. 自己画结构

结构式与其他条件同时限制检索

检索到感兴趣的药物可以保存结构式到结构式检索

可以将系统里的结构式贴回画图板

Integrity解决如下问题(实战操作) 1.Thomson Reuters Integrity数据库基本简介 2.信息情报最前沿(新闻,专利,会议,新分子实体,基因研究,临床试验快讯) 3.如何深入研读一篇疾病综述?(多维度) 4.“药物检索”(多重检索条件限制,强大筛选功能) 4.1设置专属Email跟踪获取更新内容 4.2构效关系比较(IC-50等数据的排序和取平均值) 5.最新靶标跟踪及特定靶点研究进展剖析(关联在研药物给出评级;关联疾病适应症的分类整理) 6.结构式检索

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每月药物快讯 http://science. thomsonreuters. com. cn/lscn/drug-news/201309 每月药物快讯 http://science.thomsonreuters.com.cn/lscn/drug-news/201309.shtml

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