植物总DNA的提取 化学生物学实验 中南民族大学 药学院 化学生物学教研室
1.实验目的 学习和掌握学习CTAB法提取植物总DNA的基本原理和实验技术。 1 学习和掌握紫外光吸收法鉴定DNA的纯度和浓度。 2
植物叶片经液氮研磨,可使细胞壁破裂,加入去污剂(如CTAB),可使核蛋白体解析,然后使蛋白和多糖杂质沉淀,DNA进入水相,再用酚、氯仿抽提纯化。本实验采用CTAB法,其主要作用是破膜。CTAB 是一种非离子去污剂,能溶解膜蛋白与脂肪,也可解聚核蛋白。植物材料在CTAB的处理下, 结合 65℃ 水浴使细胞裂解、蛋白质变性、DNA 被释放出来。CTAB与核酸形成复合物,此复合物在高盐(>0.7mM)浓度下可溶,并稳定存在,但在低盐浓度(0.1-0.5mM NaCl)下CTAB-核酸复合物就因溶解度降低而沉淀,而大部分的蛋白质及多糖等仍溶解于溶液中。经过氯仿 / 异戊醇 (24:1) 抽提去除蛋白质、多糖、色素等来纯化DNA,最后经异丙醇或乙醇等沉淀剂将DNA沉淀分离出来。 2.实验原理 由于核酸、蛋白质、多糖在特定的紫外波长都有特征吸收。核酸及其衍生物的紫外吸收高峰在260nm。纯的DNA样品A260/280≈1.8,纯的RNA样品A260/280≈2.0,并且1μg/ml DNA溶液A260=0.020。
3.实验器材与试剂 1、高压灭菌锅 2、冰箱 3、恒温水浴锅 4、高速冷冻离心机 5、紫外分光光度计 6、剪刀 7、陶瓷研钵和杵子 8、磨口锥形瓶(50ml) 9、滴管 10、细玻棒 11、小烧杯(50ml) 12、离心管(50ml) 13、植物材料
3.实验器材与试剂 1、3×CTAB buffer(pH8.0) 100mM Tris 25mM EDTA 1.5M NaCl 2% β-巯基乙醇 2、TE缓冲液(pH8.0) 10mmol/L Tris•HCl 1mmol/L EDTA 3、氯仿-异戊醇混合液(24:1,V/V) 4、95%乙醇 5、液氮
4.实验步骤 1、称取0.1g新鲜的植物叶片,用蒸馏水冲洗叶面,滤纸吸干水分。 2、将叶片剪成l cm长,置于预冷的研钵中,倒入液氮,尽快将叶片研磨成 粉末。 3、将液氮挥发完后,加入0.5 ml预热(60℃)的CTAB提取缓冲液,转入 一离心管中,置于65℃水浴保温0.5 h,不时地轻轻摇动混匀。 4、取出稍冷后,加等体积的氯仿:异戊醇混合液,轻轻颠倒混匀,室温下 7000 rpm离心10 min。 5、用一开口较大的滴管将上层水相吸入另一干净的离心管中,加2倍体积 的乙醇(95%乙醇),轻轻混匀,使核酸沉淀下来,室温下10000 rpm 离心10 min。 6、倒掉上清夜,向离心管中加1 ml洗涤缓冲液,轻轻转动离心管,使核酸 沉淀悬浮起来,洗涤2 min,在室温下5000 rpm离心5 min。 7、重复洗涤一次,并于室温下使DNA沉淀干燥,变为透明状。 8、将DNA沉淀溶于100μl TE溶液中,于-20℃保存备用。 9、用于后续浓度及纯度的检测,将DNA沉淀溶于1 ml TE溶液中,在分光 光度计上测定该溶液在260nm/280nm紫外光波长下的吸光度值。
5.注意事项 1. 液氮研磨时,小心操作,以免冻伤。 2. 所有操作均需温和,避免剧烈震荡。
6.思考题 1. CTAB、EDTA、巯基乙醇的作用分别是什么? 2. 液氮研磨的原理是什么?