PubMedplus PubMed分面检索与聚类分析系统

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1 PubMedplus PubMed分面检索与聚类分析系统
北京唯博赛科技有限公司 销售部经理 韩永龙

2 什么是分面检索与聚类分析 分面检索(Faceted Search)：是指事物具有多个方面的属性。例如文献包括年代、出版语言、学科分类等分面。分面检索就是指通过事物的这些属性不断筛选、过滤搜索结果，让搜索结果更精确。 聚类分析（Cluster Analysis）：是根据“物以类聚”的道理，对样品或指标进行分类，对象是大量的样品，没有任何模式可供参考或依循，即在没有参考的情况下进行。对文献进行聚类分析，揭示概念与概念之间的关系 可以拓展读者的思路

3 PubMedPlus与PubMed的关系
Pubmedplus是北京唯博赛科技有限公司利用自身技术优势在Pubmed文献检索系统基础上，利用文献计量学原理开发的大型文献搜索引擎。系统采用Pubmed官方授权的接口，提供与Pubmed同样的检索方式和检索结果。 对检索结果提供重新整合的功能，从期刊、国家、机构、作者、疾病、基因本体等三十多个不同层面对检索到的文献加以重新归类和分析，引导读者依据这些归类和分析结果快速找到自己需要的信息。

4 PubMed分面检索与聚类分析的意义 PubMed是世界公认的权威数据库，也是生物医学工作者使用最广泛的数据库。
通过文献分析能够帮助检索这发现创新点，如芝加哥大学Swanson教授通过文献分析，猜测出“鱼油可以治疗雷诺病”及“偏头痛与缺镁有关系”等。

5 Pubmedplus的原理：计量分析+语义
每个统计项后台都对应一个语义词表，保障聚类结果的全面、准确，如地址里只有wuhan，统计省会和国家时就对应到湖北省—中国；

6 专家评定pubmedplus： 为目前国内外最强大的医学信息检索与分析系统。该系统集资源整合、信息集成、技术融合、知识服务于一体，采用国际最先进的信息检索、本体语义、数据挖掘、知识发现的理念与技术，将文献数据、引证数据、循证数据、疾病数据、药物数据、基因数据等进行精炼过滤和聚类分析，实现了信息检索、数据分析、定量评价、数据挖掘、知识发现的多重功能。

7 Pubmedplus服务内容 1 辅助检索服务 2 课题辅助分析服务 3 期刊投稿指南 4 定制服务：馆藏整合与揭示和机构分析

8 一、Pubmedplus之辅助检索 帮助读者进行检索，使读者的检索准确并且全面
如：检索cancer，Pubmed是将检索式转化为自由词+主题词实现其检索，即"neoplasms"[MeSH Terms] OR "cancer"[All Fields] 优点：有主题词的文献(medline文献）查准率很高，

9 并不是所有文献都有主题词 通过利用Pubmedplus的聚类分析，读者可修正检索式，使其更为完善和全面，提高查全率。
只有Medline数据有主题词标引的数据； Medline加工中的数据：[PubMed - in process] 出版商提供的数据：[PubMed - as supplied by publisher] OLDMEDLINE：[ PubMed - OLDMEDLINE] PubMed ：[PubMed] （都没有主题词） 通过利用Pubmedplus的聚类分析，读者可修正检索式，使其更为完善和全面，提高查全率。

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11 Cancer的同义词tumor，cancers等都组配到检索式中，检索更全

12 实例演示说明： 检索目标：非小细胞肺癌对酪氨酸激酶治疗耐药后的进一步治疗方案。 常规检索策略：
non-small cell lung cancer + tyrosine kinase inhibitor + resistance + treatment

13 非小细胞肺癌对酪氨酸激酶治疗耐药后的进一步治疗方案

14 非小细胞肺癌对酪氨酸激酶治疗耐药后的进一步治疗方案

15 非小细胞肺癌对酪氨酸激酶治疗耐药后的进一步治疗方案

16 非小细胞肺癌对酪氨酸激酶治疗耐药后的进一步治疗方案

17 非小细胞肺癌对酪氨酸激酶治疗耐药后的进一步治疗方案
各个关键词再组配上相应的主题，最后的检索式 ("carcinoma, non-small-cell lung"[MeSH Terms] OR "non small cell lung cancer"[tiab] OR "nsclc"[tiab] OR "adenocarcinoma"[tiab] OR "non small cell lung carcinoma"[tiab] OR "adenocarcinomas"[tiab] OR "non small cell lung cancers"[tiab] OR "squamous cell carcinomas"[tiab]) AND ("protein-tyrosine kinases"[MeSH Terms] OR "tyrosine kinase inhibitor"[tiab] OR "tyrosine kinase inhibitors"[tiab] OR "erlotinib"[tiab] OR "sorafenib"[tiab]) AND ("drug resistance"[mesh] OR "drug-resistant"[tiab]) AND ("therapy"[Subheading] OR "therapeutics"[MeSH Terms] OR therapy[tiab] OR "treatment"[tiab] OR "methods"[tiab]) 这样得出的结果既准确又全面

18 非小细胞肺癌对酪氨酸激酶治疗耐药后的进一步治疗方案：
精炼过滤临床文献 病例报告、I期临床试验、II期临床试验、III期临床试验、IV期临床试验、多中心研究、Meta分析、临床实验、随机对照实验

19 非小细胞肺癌对酪氨酸激酶治疗耐药后的进一步治疗方案：
过滤高质量文献

20 二、Pubmedplus之课题辅助分析 年份聚类： ---文献发表的年代分布 ---为分析趋势提供依据

21 机构聚类：发现高产出机构，利于机构合作 机构聚类： ---发现该领域高产出的研究机构 ---有利于机构间的合作 ---发现深造的研究机构

22 期刊聚类：查找该领域的核心期刊 期刊聚类： ---发现该领域的核心期刊 ---为文献投稿选择合适期刊提供依据

23 作者聚类：发现该领域的高产出研究人员 作者聚类： ---发现该领域的高产出研究人员 ---有利于机构的人才招聘 ---选择潜在的合作者

24 国家聚类：发现高产出地区 国家聚类： ---发现该领域的高产出国家 ---可进一步限定，深入分析

25 中国省份聚类：了解国内研究现状 中国省份聚类： ---发现该领域的高产出国内省份 ---选择潜在的国内合作机构

26 主题词间聚类：发现潜在的研究热点

27 年份：文献发表的年代分布 期刊：检索课题的核心期刊 机构：国内外重点机构分布 科室：哪些科室的人在研究 作者相关：核心作者及联系方式 主题词：主要研究领域 副主题词搭配：主题领域与研究方向 自由词：相关联的词与词组 国家：文献国家分布 中国省份：中国文献省市分布 城市：国内外城市分布

28 药物：聚类文献中的化学药品 疾病：聚类文献中的疾病 治疗：治疗方法 症状：临床症状 物种：研究的物种 解剖：解剖部位 食品：聚类食品 基因本体：本体聚类 基因蛋白：蛋白聚类

29 按基因本体聚类，发现关于 自闭症行为的文献较多。

30 中草药马兜铃致癌研究 国际文献分析

31 中草药马兜铃致癌研究 国际文献分析

32 对某一年的发文进行分析

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37 三、Pubmedplus之期刊投稿指南 ---查看此期刊被哪些数据库收录 ---此期刊在该学科里的排名 ---标示出录用难易度和审稿周期

38 投稿指南 ---发现该期刊主要收录文献的研究方向 ---分析国内作者发表在该期刊的百分比

39 四、个性化定制之： 馆藏资源整合及全文揭示
馆藏过滤：读者检索文献后，把读者导向本馆购买的数据库，本馆IP内均可以查看全文。

40 1原版数据库馆藏揭示 本馆购买的或免费的原版数据库，可直接打开全文

41 2纸本刊的馆藏揭示 本馆购买的纸质期刊，可提示馆藏信息

42 3文献没有全文链接的通过doi进行馆藏揭示

43 文献评价：大量的引文数据 Pubmedplus收录了一亿四千万条引文与参考文献，可以帮助读者检索自己的课题。 对引文与参考文献进行聚类分析有很多有待挖掘的功能;如排查自引

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47 四、定制服务之机构库文献分析 统计全 解决机构异名问题 机构库 分析 分析 按照作者，学科，年代分析 同行关注 与关注机构进行学科等比较

48 Pubmedplus对读者的用途 本机构及关注机构发表在Pubmed上的文献“实时在线分析”，可以按学科及年份对本机构和关注机构发文量作对比。本机构重要作者均翻译为中文，文献数量则动态显示。

49 医疗机构排名分析及实时在线跟踪 对医院在PubMed发表论文情况进行统计分析，能为机构领导者适时调整科研策略、发展政策等提供参考和依据， 也有助于对各学科发表论文的情况进行管理和评价。 实时在线跟踪了解相关医院论文情况，确定位置明确努力方向，便于调整好相关政策。

50 Pubmedplus个性化的定制服务

51 Pubmedplus个性化的服务

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53 Pubmedplus个性化的服务

54 Pubmedplus个性化的服务

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56 对机构发表在SCI上的文献进行聚类分析 基于同样的工作原理及分面语义检索，可以对机构发表在SCI上文献进行分析；
直接展示机构的每个部门，每个作者发表的总文献；还可以与其他机构对比； 对SCI引用文献进行作者聚类分析，解决科研部门排查自引文献困难的问题。 对SCI文献作者名称汉化，解决作者名称不好区分的问题。 正在与解放军总医院图书馆合作开发SCI版本

57 免费版本Pubmedpro.cn；任何人无需注册均可使用，还可以下载安卓手机版本。

58 Pubmedpro与pubmedplus均不提供全文服务

59 Pubmedpro与pubmedplu均不提供全文服务

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61 谢谢大家！ 敬请批评指正！ 韩永龙 18601241281 微信号：pubmedplus 反馈邮箱：pubmedplus@126.com