Hybridization of Nucleic Acids

Slides:



Advertisements
Similar presentations
行政院原住民族委員會 法規暨訴願審議委員會 102 年度原住民身分法實例演練講習: 原住民身分認定及救濟程序.
Advertisements

雷一雪 周可然 徐超 杨光 社会学与社会工作 第一节 胎儿的发育过程  卵细胞期 从精卵的成功结合开始,卵细胞期大约持续 3 周,是胎儿发育的第一阶段,为胚胎阶段打下坚实 基础.
化疗知识讲座 台州博爱肿瘤医院 陈国卿. 一、化疗药物的抗癌机制 1 、抑制细胞增殖和肿瘤的生长是其主要作 用机理。 2 、对于新陈代谢旺盛的正常组织同样具有 毒性,如骨髓细胞,粘膜细胞。 3 、理想的药物 — 最大程度的抑制肿瘤细胞, 最小程度的影响正常细胞。 4 、基因药物是发展方向。
Chapter 16 The Molecular Basis of Inheritance. 探索遺傳物質 DNA  孟德爾 (Meselson) 發現遺傳因子。 1. 基因的不同等位基因解釋了諸多的遺傳性狀。 2. 對每一種性狀而言,一種生物體遺傳有兩個等位基因, 每一個等位基因得自於一方親代.
第二章:生物科學與食品 第三節:基因改造食品.
一、蛋白质通论 蛋白质存在于所有的生物细胞中,是构成生物体最基本的结构物质和功能物质。
第三章 现代教育与人的发展.
DR.CHIP BIOTECHNOLOG INCORPORATION 晶宇生物科技有限公司
神创造万物及人类.
第21课时 生物圈中的微生物 考 点 聚 焦 专 项 突 破 1.
國民中學 自然與生活科技 第二冊 第3章 生殖 3-1 細胞分裂 3-2 無性生殖 3-3 有性生殖.
生命科学发展趋势、优先发展领域与资助思考
学校核心发展力 上海市建平中学 程红兵.
必修二 生物 (人教版).
高二生物 绪论 制作人:李 绒.
想一想 议一议 P74 我们常吃的蘑菇有根、茎、叶吗? 它们的生长是否需要光? 为什么说它们是真菌而不是植物呢?
三次科技革命 学习目标: 1.知道三次科技革命的时间、标志、发源地、理论基础、主要成就、主要特点及影响。 2.培养归纳历史知识的能力
 蛋白质化学.
第5章 基因突变 本章重点: 1、基因突变的鉴定 2、基因突变的分子机制 本章难点: 1、移动遗传因子 2、突变的分子机制.
一轮复习 细胞的增值.
第十九章 氨基酸、蛋白质和核酸 一、氨基酸 结构、命名、制法、性质 二、多肽 分类、命名、结构测定、合成 三、蛋白质 四、核酸.
王永慶遺產分配 第三組民法報告 4970T011 劉昭妤 4970T037 吳品怡 4970T090 袁如意
台南在地美食文化介紹 台南市鳳凰城文史協會 理事長 歐財榮.
第二节 创造有价值的人生 一、人生价值的标准与评价 二、人生价值实现的条件 三、在实践中创造有价值的人生.
主讲人:孙 啸 制作人:刘志华 东南大学 吴健雄实验室
一、作者概說:    王壽來,民國三十八年生,山西省 五臺縣人,中興大學 法律系畢業,美國 喬治城大學碩士、臺灣師範大學 美術研究所碩博士。長期從事文化與外交工作,現任文建會 文化資產總管理處籌備處主任。   王壽來靈感多取自生活經驗,善用中外名言,描繪人生百態。著有《公務員快意人生》、《藝術‧收藏‧我》、《公務員DNA》、《和世界偉人面對面》等書。
分子医学概论 基础医学实验教学中心 分子医学实验教学平台.
第一章 蛋白质的结构与功能 Structure and Function of Protein.
绪 论 Introduction.
导入新课 波能绕过障碍物产生衍射。既然光也是一种波,为什么在日常生活中难以观察到光的衍射现象呢?.
高中生物学必修Ⅰ 分子与细胞 前 言.
13-14学年度生物学科教研室总结计划 2014年2月.
必修1 分子与细胞 第二章 第三节 细 细胞溶胶 内质网 胞 核糖体 质 高尔基体 线粒体 第一课时 浙江省定海第一中学 黄晓芬.
第三章 细胞生物学研究方法 第一节 细胞形态结构的观察方法 一、光学显微镜技术 = 显微镜和显微镜的分辨能力
关注生物技术的 伦理问题.
2015年高考历史质量分析报告 兰州市外国语高级中学 杨彩玲.
肝功能正常的小三阳注意事项.
突變 突變是指遺傳物質發生改變, 而影響到性狀的表現 例:白化症.
 DNA cloning Section 1: Gene manipulation (Basic concept & basic techniques) section 2: Cloning vectors (Compare various Cloning vectors) Section 3:
第5章 基因突变及其他变异 基因突变和基因重组.
第十四章 基因诊断和基因治疗 表型的改变是由基因异常造成的 表型的改变是由基因异常造成的.
第三章 核酸的结构与 功能 Nucleic Acid structure and Function
第十五章 氨基酸和蛋白质 第一节 氨基酸 第二节 肽 第三节 蛋白质.
Hybridization of Nucleic Acids
许晓风 南京师范大学生命科学学院 2011、8、in Xining
第二章 由DNA到蛋白質.
5、利用EST数据库发现新基因 EST (expressed sequence tags),是从基因表达的短的序列,携带着完整基因某些片断的信息,称为表达序列标签 获得一个EST的途径有三种:1 大规模测序;2 比较同源性;3 差异显示或基因芯片法获得与某一性状相关的EST 电脑克隆 第一步,找到与待克隆基因相关的EST;第二步.
系別:高分子材料系 班級:二A 學號:4990G046 姓名:蔡逸群
基本概念介紹 生命是什麼? 生命的密碼~DNA 解讀生命的執行者~RNA 生命舞台的主演者~蛋白質 DNA、RNA、蛋白質的三角關係
Fluorescent DNA-based enzyme sensors
Control Points of Gene Regulation
蛋白质的生物合成---翻译(translation)
生物芯片技术 刘超 李世燕 谢宏林
细胞分离和细胞培养 细胞生物学 张惠丹 细胞生物学 张惠丹.
ABC 型離子幫浦會排出藥物 ABC type (ATP-binding cassette) pump 是一大群細胞膜上的輸送幫浦,消耗能量以便主動運輸物質通過細胞膜。 其中的某些 pump 可以被癌細胞利用來輸出化學治療的藥物,因而產生抗藥性。 N3-17.
Drug Resistance Gene Transferred by Plasmid
万方数据助力 知识学习与创新 10:02 培训师:陈李婧.
Basic Structure of Nucleic Acids
第八章 DNA文库的构建和 目的基因的筛选 §1 基因组DNA文库的构建 §2 cDNA文库的构建 §3 基因克隆的筛选策略.
生物化学.
DNA, 核酸, 雙螺旋, 基因, 染色體 A T G C T C G A A T T G G C 組合單位 核苷酸
高三生物第一轮复习 基因突变和基因重组 郑州二中 生物组 党茹.
第3节 细胞核——系统的控制中心 本节聚集: 1.细胞核有什么功能? 2. 细胞核的形态结构是怎样的?
第二节 核酸与细胞核.
复习:蛋白质的形成 几条肽链盘曲折叠形成的蛋白质 氨基酸 …….
遗传信息的携带者——核酸 授课教师:王建友.
DNA RNA Protein Central Dogma 複 製 轉 錄 逆轉錄 轉 譯 Replication Reverse
台灣紅樹林生態 班級:二年五班 座號:7號 姓名:陳耀民 資料來源:
第14章 DNA的损伤与修复 主讲教师:卢涛.
课堂练习: 选择题: C、信使RNA上决定一个氨基酸的三个相邻的碱基 D、转运RNA上决定一个氨基酸的三个相邻的碱基.
Presentation transcript:

Hybridization of Nucleic Acids DNA1 DNA2 RNA Probe 核酸 變性後可再黏合復性,回復原來的雙股核酸。若取兩種不同來源的核酸,經變性後混合在一起,假如兩種核酸的序列同質性高,則可能會雜合為混成的雙股核酸。 也可使用已知序列的核酸小片段,作為探針 (probe) 與 DNA 雜合;一般可先把樣本 DNA 經電泳分離後,轉印至尼龍膜上,再以放射性探針進行雜合,稱之為 Southern hybridization。 RNA 也可以在電泳後,與其互補的 DNA 序列雜合,則稱為 Northern hybridization。 Northern hybridization Southern hybridization Juang RH (2004) BCbasics

Preparation of Traditional Nucleic Acid Probe Amino acid sequence GLY-ASP-GLU-SER-SER-VAL-LEU----- GGG-GAC-GAG-TCC-TCC-GTT-CTC--- Nucleic acid sequence * * * * * * * * Codon degeneracy The nucleic acid sequence is Deduced from amino acid sequence Synthesizing oligonucleotide Chemical synthesis 探針 的來源有很多,上圖舉出一例,說明可以由已知蛋白質的一小段胺基酸序列,回推其核苷酸序列,並依此序列進行人工合成探針。注意對應同一種胺基酸的核酸密碼,可能有數種,例如 Ser 就有 UCU, UCC, UCA, UCG , AGU, AGC 等六種可能,稱為密碼的不確定性 (codon degeneracy)。 這樣合成人工探針就會比較麻煩,有幾個對應之道: (1) 把所有可能的密碼全部合成,也就是說變成是一種混合物,各種可能的序列都有,因此精確度降低;(2) 調查該種生物的密碼使用習慣,並選擇較常使用的密碼,(3) 參考不同生物來源的同一個基因序列,抄襲所用的密碼。 PROBE: GGGGACGAGTCCTCCGTTCT Juang RH (2004) BCbasics

DNA Target gene denaturation Single colony Lysed Probe is labeled with radioactive 32P Hybridization DNA denaturation Target gene Single colony 這段 探針經放射性磷酸標定後,可用在 Southern blotting 上,與未知樣本中的核酸進行雜合反應。目標基因若在細菌中,則必須先把細菌溶解,然後以化學反應使核酸變性露出單股 DNA,則可與探針進行雜合反應。 Lysed Juang RH (2004) BCbasics

Colony Is Screened by Hybridization with Probe Colony hybridization Cover with filter paper Transferring … Autoradiography Collect filter paper Dissolve cell DNA denatured Add probe 探針 雜合反應的做法實例。 菌落在培養皿長出來之後,先以濾紙複印得各菌落,利用氯仿把細菌溶並解釋出核酸,然後變性解開核酸的雙股後,再加入標有放射線的探針,進行雜合反應。 若某菌落中含有目標基因,便會與探針雜合成功,該菌落的位置便會出現放射線影像;然後再回去挑起原來培養皿上面的菌落,大量培養後可純化目標基因。 本圖可接續 N1-27 頁的分子群殖,在培養基生長的各個菌落,可以用探針經雜合反應挑出所要的目標菌落。 Juang RH (2004) BCbasics

Biochip Based on Hybridization Sample DNA Complementary DNA hybridize Biochip Each spot contains known DNA 核酸 晶片的基本原理,就是利用類似 Southern blotting 的核酸雜合反應。但是比起一般的毛細管轉印雜合,有幾點不同:(1) 以極細微的色點替代電泳色帶;(2) 一次可以處理上千萬個核酸色點,因此對同一樣本可有上千萬個測試;(3) 樣本所需的量極小;(4) 偵測方式簡便快速,也配合電腦比對分析。 因此晶片看起來很炫,也有其實質的效用。但晶片最重要的靈魂,還是在那一公分見方的小玻片,上面所點的到底是何種 DNA。也就是說,每一個點上的 DNA 是什麼,才是最重要的決定因素;若這些 DNA 能夠明確指示某種關鍵性疾病的有無,則這塊晶片便是無價之寶。這些重要的 DNA 要從哪裡來? 當然還是要經由無數的基礎研究,獲得對生物的深刻瞭解後,所得到的基本知識點滴。 因此,晶片製作過程是一種技術 (technology),而晶片上必須點上何種 DNA,便要靠基礎科學 (science) 來提供,兩者是不一樣的,但絕對相輔相成。 其他很多方面也有類似的情形,例如大學裡的教學與研究必須並進,不能偏廢,大家都知道。 然而,目前台灣有個很嚴重的問題,可能會影響國本。那就是在研究上,大家只重視可以馬上應用的技術,不太支持長期的基礎科學研究;在大學裡,教授又只重視如何發表大量論文 (不管有沒有用),不太花時間在教學的努力與改進上。 [Friend SH, Stoughton RB (2002 四月) 神奇的 DNA 晶片。科學人 2: 40~48] Signal appears Schena (2000) Microarray Biochip Technology, p. A31 Juang RH (2004) BCbasics