生物顯微影像快速分析-細胞核中異染色質之定量分析
簡介 電腦生物影像分析軟體分析生物體胞器、細胞、器官及組織中生命物質分怖及含量與功能的關係 定量分析優點-穩定、精確、快速
目的 以蝴蝶蘭細胞核異染色質之定量分析為例 運用影像處理軟體快速大量計算出異染色質在細胞核至所佔比例 不同種蝴蝶蘭有相同數目染色體但染色體大小差異很大 大染色體其異染色質區域明顯較大(重覆DNA含量多寡所造成) 運用影像處理軟體快速大量計算出異染色質在細胞核至所佔比例 快速提供細胞遺傳學的依據, 有助於育種
實驗與分析 取得9種有絲分裂蝴蝶蘭 1.初步處理 2.定量分析 問題1 :顯微鏡所取得細胞核是不規則的, 不易將細胞核分離出來 細胞核內較明亮地區其亮度和背景量度相同 SOL:調整明亮暗度, 取得高度對比度 將背景量度調為最亮 以區別背景與細胞核 2.定量分析
實驗與分析(續) 3.大量分析自動化 直方圖分析,得到異染色質在細胞核所佔比例 SOL: 取Threshold 游標指到圖像像素亮度的數值,較暗者為異染色質的信號 計算曲線下的面積就可以得到異染色質在細胞核所佔比例 取5個Threshod計算異染色質在細胞核所佔比例,以避免視覺上的誤差 線性相關係數R值均大於0.99表示所取範圍有相當高的線性相關性 3.大量分析自動化
實驗與分析(續) 影像面積及異染色質比率計算 Shell Script自動分析
結語 結合影像處理與電腦自動化 同方法可以分析多種物質的生物影像 共軛焦顯微鏡的三度空間立體結構的重構 結合多重免疫螢光和三度空間立體重構 例如:不同螢光表示不同生命物質 不同螢光的亮度及分佈情形分析 不同生命物資在細胞內的分佈情形 共軛焦顯微鏡的三度空間立體結構的重構 結合多重免疫螢光和三度空間立體重構 得到特定蛋白質在三度空間分佈的螢光顯微影像:(觀察多重蛋白質的機會)