科研必备技能 许忠平.

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科研必备技能 许忠平

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官网: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ 文献搜索 蛋白序列 使用方法: ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/pub/factsheets/HowTo_BLASTGuide.pdf 蛋白序列 核酸序列

查 文 献

找 序 列 通 过 基 因 名 字

找序列: 通过序列比对 blastn blastp

Fasta或fa格式

序列比对方式 输入fasta/fa序列 期望值 比对物种 比对算法 额外比对参数 当将期望选项值调小时,返回的数据库搜索结果将变少,匹配被搜索到的概率也会变小。增大E值将返回更多的结果。 比对物种 比对算法 额外比对参数

E value:这个指标与其他指标不同,它的数值越小相似程度越高,其他几个(如Totle score)都是数值越高相似度越高

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