PubMedplus PubMed分面检索与聚类分析系统

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PubMedplus PubMed分面检索与聚类分析系统 北京唯博赛科技有限公司 销售部经理 韩永龙

什么是分面检索与聚类分析 分面检索(Faceted Search):是指事物具有多个方面的属性。例如文献包括年代、出版语言、学科分类等分面。分面检索就是指通过事物的这些属性不断筛选、过滤搜索结果,让搜索结果更精确。 聚类分析(Cluster Analysis):是根据“物以类聚”的道理,对样品或指标进行分类,对象是大量的样品,没有任何模式可供参考或依循,即在没有参考的情况下进行。对文献进行聚类分析,揭示概念与概念之间的关系 可以拓展读者的思路

PubMedPlus与PubMed的关系 Pubmedplus是北京唯博赛科技有限公司利用自身技术优势在Pubmed文献检索系统基础上,利用文献计量学原理开发的大型文献搜索引擎。系统采用Pubmed官方授权的接口,提供与Pubmed同样的检索方式和检索结果。 对检索结果提供重新整合的功能,从期刊、国家、机构、作者、疾病、基因本体等三十多个不同层面对检索到的文献加以重新归类和分析,引导读者依据这些归类和分析结果快速找到自己需要的信息。

PubMed分面检索与聚类分析的意义 PubMed是世界公认的权威数据库,也是生物医学工作者使用最广泛的数据库。 通过文献分析能够帮助检索这发现创新点,如芝加哥大学Swanson教授通过文献分析,猜测出“鱼油可以治疗雷诺病”及“偏头痛与缺镁有关系”等。

Pubmedplus的原理:计量分析+语义 每个统计项后台都对应一个语义词表,保障聚类结果的全面、准确,如地址里只有wuhan,统计省会和国家时就对应到湖北省—中国;

专家评定pubmedplus: 为目前国内外最强大的医学信息检索与分析系统。该系统集资源整合、信息集成、技术融合、知识服务于一体,采用国际最先进的信息检索、本体语义、数据挖掘、知识发现的理念与技术,将文献数据、引证数据、循证数据、疾病数据、药物数据、基因数据等进行精炼过滤和聚类分析,实现了信息检索、数据分析、定量评价、数据挖掘、知识发现的多重功能。

Pubmedplus服务内容 1 辅助检索服务 2 课题辅助分析服务 3 期刊投稿指南 4 定制服务:馆藏整合与揭示和机构分析

一、Pubmedplus之辅助检索 帮助读者进行检索,使读者的检索准确并且全面 如:检索cancer,Pubmed是将检索式转化为自由词+主题词实现其检索,即"neoplasms"[MeSH Terms] OR "cancer"[All Fields] 优点:有主题词的文献(medline文献)查准率很高,

并不是所有文献都有主题词 通过利用Pubmedplus的聚类分析,读者可修正检索式,使其更为完善和全面,提高查全率。 只有Medline数据有主题词标引的数据; Medline加工中的数据:[PubMed - in process] 出版商提供的数据:[PubMed - as supplied by publisher] OLDMEDLINE:[ PubMed - OLDMEDLINE] PubMed :[PubMed] (都没有主题词) 通过利用Pubmedplus的聚类分析,读者可修正检索式,使其更为完善和全面,提高查全率。

Cancer的同义词tumor,cancers等都组配到检索式中,检索更全

实例演示说明: 检索目标:非小细胞肺癌对酪氨酸激酶治疗耐药后的进一步治疗方案。 常规检索策略: non-small cell lung cancer + tyrosine kinase inhibitor + resistance + treatment

非小细胞肺癌对酪氨酸激酶治疗耐药后的进一步治疗方案

非小细胞肺癌对酪氨酸激酶治疗耐药后的进一步治疗方案

非小细胞肺癌对酪氨酸激酶治疗耐药后的进一步治疗方案

非小细胞肺癌对酪氨酸激酶治疗耐药后的进一步治疗方案

非小细胞肺癌对酪氨酸激酶治疗耐药后的进一步治疗方案 各个关键词再组配上相应的主题,最后的检索式 ("carcinoma, non-small-cell lung"[MeSH Terms] OR "non small cell lung cancer"[tiab] OR "nsclc"[tiab] OR "adenocarcinoma"[tiab] OR "non small cell lung carcinoma"[tiab] OR "adenocarcinomas"[tiab] OR "non small cell lung cancers"[tiab] OR "squamous cell carcinomas"[tiab]) AND ("protein-tyrosine kinases"[MeSH Terms] OR "tyrosine kinase inhibitor"[tiab] OR "tyrosine kinase inhibitors"[tiab] OR "erlotinib"[tiab] OR "sorafenib"[tiab]) AND ("drug resistance"[mesh] OR "drug-resistant"[tiab]) AND ("therapy"[Subheading] OR "therapeutics"[MeSH Terms] OR therapy[tiab] OR "treatment"[tiab] OR "methods"[tiab]) 这样得出的结果既准确又全面

非小细胞肺癌对酪氨酸激酶治疗耐药后的进一步治疗方案: 精炼过滤临床文献 病例报告、I期临床试验、II期临床试验、III期临床试验、IV期临床试验、多中心研究、Meta分析、临床实验、随机对照实验

非小细胞肺癌对酪氨酸激酶治疗耐药后的进一步治疗方案: 过滤高质量文献

二、Pubmedplus之课题辅助分析 年份聚类: ---文献发表的年代分布 ---为分析趋势提供依据

机构聚类:发现高产出机构,利于机构合作 机构聚类: ---发现该领域高产出的研究机构 ---有利于机构间的合作 ---发现深造的研究机构

期刊聚类:查找该领域的核心期刊 期刊聚类: ---发现该领域的核心期刊 ---为文献投稿选择合适期刊提供依据

作者聚类:发现该领域的高产出研究人员 作者聚类: ---发现该领域的高产出研究人员 ---有利于机构的人才招聘 ---选择潜在的合作者

国家聚类:发现高产出地区 国家聚类: ---发现该领域的高产出国家 ---可进一步限定,深入分析

中国省份聚类:了解国内研究现状 中国省份聚类: ---发现该领域的高产出国内省份 ---选择潜在的国内合作机构

主题词间聚类:发现潜在的研究热点

年份:文献发表的年代分布 期刊:检索课题的核心期刊 机构:国内外重点机构分布 科室:哪些科室的人在研究 作者相关:核心作者及联系方式 主题词:主要研究领域 副主题词搭配:主题领域与研究方向 自由词:相关联的词与词组 国家:文献国家分布 中国省份:中国文献省市分布 城市:国内外城市分布

药物:聚类文献中的化学药品 疾病:聚类文献中的疾病 治疗:治疗方法 症状:临床症状 物种:研究的物种 解剖:解剖部位 食品:聚类食品 基因本体:本体聚类 基因蛋白:蛋白聚类

按基因本体聚类,发现关于 自闭症行为的文献较多。

中草药马兜铃致癌研究 国际文献分析

中草药马兜铃致癌研究 国际文献分析

对某一年的发文进行分析

三、Pubmedplus之期刊投稿指南 ---查看此期刊被哪些数据库收录 ---此期刊在该学科里的排名 ---标示出录用难易度和审稿周期

投稿指南 ---发现该期刊主要收录文献的研究方向 ---分析国内作者发表在该期刊的百分比

四、个性化定制之: 馆藏资源整合及全文揭示 馆藏过滤:读者检索文献后,把读者导向本馆购买的数据库,本馆IP内均可以查看全文。

1原版数据库馆藏揭示 本馆购买的或免费的原版数据库,可直接打开全文

2纸本刊的馆藏揭示 本馆购买的纸质期刊,可提示馆藏信息

3文献没有全文链接的通过doi进行馆藏揭示

文献评价:大量的引文数据 Pubmedplus收录了一亿四千万条引文与参考文献,可以帮助读者检索自己的课题。 对引文与参考文献进行聚类分析有很多有待挖掘的功能;如排查自引

四、定制服务之机构库文献分析 统计全 解决机构异名问题 机构库 分析 分析 按照作者,学科,年代分析 同行关注 与关注机构进行学科等比较

Pubmedplus对读者的用途 本机构及关注机构发表在Pubmed上的文献“实时在线分析”,可以按学科及年份对本机构和关注机构发文量作对比。本机构重要作者均翻译为中文,文献数量则动态显示。

医疗机构排名分析及实时在线跟踪 对医院在PubMed发表论文情况进行统计分析,能为机构领导者适时调整科研策略、发展政策等提供参考和依据, 也有助于对各学科发表论文的情况进行管理和评价。 实时在线跟踪了解相关医院论文情况,确定位置明确努力方向,便于调整好相关政策。

Pubmedplus个性化的定制服务

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对机构发表在SCI上的文献进行聚类分析 基于同样的工作原理及分面语义检索,可以对机构发表在SCI上文献进行分析; 直接展示机构的每个部门,每个作者发表的总文献;还可以与其他机构对比; 对SCI引用文献进行作者聚类分析,解决科研部门排查自引文献困难的问题。 对SCI文献作者名称汉化,解决作者名称不好区分的问题。 正在与解放军总医院图书馆合作开发SCI版本

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Pubmedpro与pubmedplus均不提供全文服务

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谢谢大家! 敬请批评指正! 韩永龙 18601241281 微信号:pubmedplus 反馈邮箱:pubmedplus@126.com