Untypable NPEV 腸病毒 月份無明顯差異 266/1444=18% 1

Untypable NPEV 266 untypable NPEV 第一階段 傳統RT-PCR ? 個陽性 ? 個陰性 CODEHOP (EV + HPeV) ? 個陰性 ? 個陽性 2

Untypable NPEV 266 untypable NPEV RT-PCR 陽性 177 sample 62無IFA試劑 實驗室 CA12 ECHO25 ECHO3 ECHO33 ECHO7 HRV 總計 三總 6 8 14 中榮 1 5 7 台大 成大 林口長庚 高長 4 2 12 19 慈濟 彰基 10 40 62 RT-PCR 陽性 177 sample 62無IFA試劑 115有IFA試劑 實驗室 CA10 CA2 CA21 CA4 CA5 CA6 CA8 CB2 CB3 CB4 ECHO11 ECHO30 總計 三總 5 4 2 1 17 中榮 台大 成大 7 16 林口長庚 18 22 高長 10 慈濟 11 12 6 45 彰基 20 3 9 115 中榮CA4確實為untype 3 CA21, CA8抗血清是2013年分送

Untypable NPEV 266 untypable NPEV 陰性 RT-PCR 89 sample 陽性 CODEHOP (EV + HPeV) 177 sample 62無IFA試劑 115有IFA試劑 28 陰性 27無IFA試劑 34有IFA試劑 61 陽性 實驗室 CA10 CA16 CA21 CA2 CA4 CA6 CA6+HPeV1 CB2 ECHO30 ECHO3 EV68 HRV 陰性 總計 三總 1 5 3 14 26 中榮 2 4 成大 30 林口長庚 高長 10 13 慈濟 6 9 18 彰基 11 12 22 28 89 4

結論 Untypable NPEV (N=266)結果顯示： 56%有IFA試劑 (n=149) 腸病毒 結論 Untypable NPEV (N=266)結果顯示： 56%有IFA試劑 (n=149) 33%無IFA試劑(但可從分生檢驗得知) (n=89)，當中七成為HRV (n=62) 11%陰性 (n=28) 檢驗流程、病毒量 培養陰性/其他種類病原體 (ex: Saffold, Picornaviridae…) 5

基因定序進度報告 腸道及腹瀉病毒實驗室 2014.03.05 （一）流感病毒 （二）腸病毒 6

WHO公布北半球2014-2015疫苗株 2014-2015 WHO 建議的疫苗與2013-2014 相同 H3 (Victoria/361 Texas/50) 抗原性考量 2013-14 northern  It is recommended that A/Texas/50/2012 is used as the A(H3N2) vaccine component because of antigenic changes in earlier A/Victoria/361/2011-like vaccine viruses (such as IVR-165) resulting from adaptation to propagation in eggs. 7

流感病毒 2013.08.22 8 8

Oseltamivir susceptibility 流感病毒 H3目前主要流行型別 比對分型皆屬於Victoria/361 抗原性/基因性無特殊變化 Antigenicity and Drug resistance of Influenza viruses in Taiwan, 2013-2014 (according to tested date) Time (Week) Antigenicity Oseltamivir susceptibility pandemic H1N1 H3N2 Flu B (Vic) Flu B (Yam) pandemic H1N1 Flu B Tested No. LR* LR Resistant W9/2014 2 0　 3 1 W40/2013 ~ W09/2014 36 49 1　 12 11 4 7 5 製表日為2013/02/21 (依發病日製表) 9

Variation of Influenza A (H3N2) in Taiwan A/Victoria/361/2011-like : Merged on May 2011 Y94H N145S 10

Oseltamivir susceptibility 流感病毒 H1流行幅度不高 比對分型皆屬於Pandemic(H1N1) 抗原性無特殊變化 Antigenicity and Drug resistance of Influenza viruses in Taiwan, 2013-2014 (according to tested date) Time (Week) Antigenicity Oseltamivir susceptibility pandemic H1N1 H3N2 Flu B (Vic) Flu B (Yam) pandemic H1N1 Flu B Tested No. LR* LR Resistant W9/2014 2 0　 3 1 W40/2013 ~ W09/2014 36 49 1　 12 11 4 7 5 製表日為2013/02/21 (依發病日製表) 11

Oseltamivir susceptibility 流感病毒 Flu_B:Yamagata B流感流行幅度低 流行型別與抗原性出現變化 Antigenicity and Drug resistance of Influenza viruses in Taiwan, 2013-2014 (according to tested date) Time (Week) Antigenicity Oseltamivir susceptibility pandemic H1N1 H3N2 Flu B (Vic) Flu B (Yam) pandemic H1N1 Flu B Tested No. LR* LR Resistant W9/2014 2 0　 3 1 W40/2013 ~ W09/2014 36 49 1　 12 11 4 7 5 製表日為2013/02/21 (依發病日製表) 製表日為2013/02/21 (依發病日製表) B型流感的流行型別有變化 (變回WISCONSIN?) 12 12

Yamagata lineage 2011-2012 Taiwan 13 (2013-2014, 2014-2015) (2008-2009) (2012-2013) 13

Yamagata lineage 14

Oseltamivir susceptibility 流感病毒 Updated: 2014/02/28 病毒抗原及抗藥性監視 Antigenicity and Drug resistance of Influenza viruses in Taiwan, 2013-2014 (according to tested date) Time (Week) Antigenicity Oseltamivir susceptibility pandemic H1N1 H3N2 Flu B (Vic) Flu B (Yam) pandemic H1N1 Flu B Tested No. LR* LR Resistant W9/2014 2 0　 3 1 W40/2013 ~ W09/2014 36 49 1　 12 11 4 7 5 目前尚未偵測到抗藥性病毒株。 無檢測到克流感抗藥株 *LR: low reactor From W40/2013, the reference strains were updated to the components of the 2013-2014 influenza vaccine for the Northern Hemisphere (A/California/7/2009(H1N1), A/Victoria/361/2011(H3N2), B/Massachusetts/2/2012-like). B/Brisbane/60/2008 was used for the reference strain of influenza B Victoria lineage. All the severe cases of influenza, and some of the sporadic and outbreak cases will be selected for antigenicity and drug resistance tests. 15

流感病毒---結論 2014-2015年的北半球WHO建議疫苗株並無異動。 2014年的流行以H3 (A/Victoria/361/2011)為主，其次為H1及少數的B型流感 (B/Brisbane/60/2008 (Vic), B/Wisconsin/01/2010(B/Yam))。 流感病毒的抗藥性基因監測並沒有發現抗藥株。 2013年流感病毒基因序列比對： H1屬於A/California/7/2009 (H1N1)pdm09,此病毒已持續流行5年(2009-2014)，抗 原性與疫苗株A/California/7/2009相似。 H3屬於A/Victoria/361/2011, 此病毒自2011年5月後流行，至今累積有Y94H (site E) 、 N145S(site A)、N278K(site C)突變，但抗原仍未改變。 B型流感僅少數幾例，型別則包含B/Massachusetts/02/2012 (Yam)與 B/Wisconsin/01/2010(B/Yam)，以及B/Brisbane/60/2008 (Vic) 。 台灣流行株與疫苗株比較，H3與H1相符，而B型流感除了有B/Brisbane/60/2008 (Vic)與疫苗株不符外，2014年後流行Yamagata lineage 已轉換成 B/Wisconsin/01/2010-like，且抗原性偏離疫苗株，需密切注意。 16

已收到的腸病毒株型別與數量 同期數量 年度 目前流行幅度不大，今年以CA10占多數 2013年：CA6；2012年：EV71 通報型別 2012 2013 2014 CA10 8 1 25 CA2 27 2 6 CA5 4 CA4 9 3 CA16 NPEV 17 CA21 CA6 43 CB2 CB3 CB4 EV71 73 ECHO4 ECHO11 ECHO6 CB5 總計 129 87 42 目前流行幅度不大，今年以CA10占多數 2013年：CA6；2012年：EV71 CA10為主要流行型別之一，去年夏秋季出現較高幅度 2011 CA10 CA9 EV71 CA4 CB5 38.6% 14.6% 13.0% 8.7% 7.4% 2012 CA2 NPEV CA6 48.5% 21.7% 8.1% 5.4% 3.9% 2013 CB4 35.7% 18.4% 11.4% 5.5% 5.0% 2014 CA5 CA16 59.5% 14.3% 9.5% 7.1% 4.8%

CA10 不同地域CA10 親緣樹狀圖 lineage5 lineage4 lineage3 lineage2 lineage1 腸病毒 18 lineage1

CA10 1998~2014年 台灣地區CVA10 親緣樹狀圖 lineageC-1 lineageC-2 lineageB 腸病毒 1998~2014年 台灣地區CVA10 親緣樹狀圖 lineageC-1 lineageC-2 lineageB 台灣CA10可分為三大群 近年病毒株皆屬於同一群內 Endemic lineageA 19

EV-71 (2009-2013) 今年尚未監測到，但 EV-71於去年底仍有監測到，已有一年的低流行幅度，今年需密切注意 腸病毒 今年尚未監測到，但 EV-71於去年底仍有監測到，已有一年的低流行幅度，今年需密切注意 B5 (B5x), C4基因亞型 B5b 桃園/台中/彰化 1-2月，B5x 台中/彰化/嘉義/桃園/花蓮 5-12月，C4 桃園/台中 7/11月 B5b B5c B5x C5 C4 C2 20

腸病毒---結論 今年腸病毒的流行幅度不高，型別以CA10為最多，序列與近 年病毒株類似。 (2013年腸病毒以CA6 為最多，其次為NPEV, CB4, CA4) 今年尚未偵測到EV-71，需要留意。 (2013年亦僅少數幾例，屬於B5(B5cB5x)及C4基因亞型) 21

Thanks for your attention 22 22 22

未能分型腸病毒(28件) 腸病毒實驗室 第一階段PCR CODEHOP (-) Par-CODEHOP (-) Culture 27(-) 1.基因體 2.生材科 3.新與及HIV實驗室 第一階段PCR CODEHOP (-) Par-CODEHOP (-) Culture 27(-) 腸病毒實驗室 Culture Cell line RD MK2 HEP2-c MRC5 CPE 1 8 12 No CPE 3 2 Result: CA6(1件) Saffold-like virus(20件) CPE (-) : 7件

266：238 陽性，28陰性(11%) 89無IFA試劑(33%) 149有IFA試劑(56%) EV68 56% 69% 0% 40% 實驗室 CA10 CA16 CA2 CA21 CA4 CA5 CA6 CA6+HPeV1 CA8 CB2 CB3 CB4 ECHO11 ECHO30 CA12 ECHO25 ECHO3 ECHO33 ECHO7 EV68 HRV 陰性 總計 無IFA試劑+陰性 三總 6 5 1 4 2 11 14 57 56% 中榮 7 13 69% 台大 0% 成大 30 40% 林口長庚 19 8 35 31% 高長 22 42 74% 慈濟 12 18 3 9 70 20% 彰基 44% 16 23 28 62 266 2007 17 2008 3 2009 4 2010 18 2011 11 2012 2 2013 EV68

腸病毒 25

CB3 2百多bp 幾乎皆為GV-B(可使用自行開發的IFA試劑) CB4 2百多bp 沒有直接關聯 2003-00816染不到，但卻沒有和最下面的通報NPEV在一群?

CB2 280 bp 無法從序列判斷

HPeV Thirty-eight HPeV isolates were identified from 575 untypeable isolates, including 23 HPeV type1 (HPeV1), 13 HPeV3, and 2 HPeV6. hpev1與hpev3感染者年紀無差異 Characteristics of cases infected with human parechovirus (HPeV), 2007-2012. Type Gender Age Total Female Male   <1 1-5 >5 HPeV1 9 14 6 17 23 HPeV3 4 2 8 3 13 HPeV6 1 24 27 38 HPeV1, HPeV3, HPeV6 性別年紀無顯著差異

No. of patients with symptoms/no. of patients (%) HPeV HPeV1出現較多發燒與呼吸症狀 夏秋出現較多病例 Clinical symptoms of human parechovirus (HPeV) infection in Taiwan, 2007-2012. Characteristic No. of patients with symptoms/no. of patients (%) HPeV1 HPeV3 P Fever 23/23 (100) 10/13 (77) 0.04a Respiratory symptoms 19/23 (83) 3/13 (23) <0.001a Gastrointestinal symptoms 4/23 (17) 0/13 (0) 0.27 aStatistically significant. HPeV infections was observed in summer and autumn, with the highest peak in September

HPeV

EV-71 (2013) B5a 外國 B5c after 2010, TW B5x 2009(?), 2013, TW B5b 2007-2010, TW B5a 外國 B5x 2009(?), 2013, TW 與中國近年來的同一群

EV-71 (2009-2013) B5b 桃園/台中/彰化 1-2月，B5x 台中/彰化/嘉義/桃園/花蓮 5-12月，C4 桃園/台中 7/11月 B5b B5c B5x C5 C4 C2

製表日為2014/02/21 (依發病日製表) 流感病毒 收件暨定序狀況(統計日期: 102/10/23~103/1/27) Pandemic(H1N1) INFAH3 INFB 總計 收件數 77 259 37 373 區域(北) 22 47 17 86 區域(中) 15 60 11 區域(南) 25 117 8 150 區域(東) 35 1 51 定序完成數 44 157 20 221 基因型(Vaccine Strains) A/California/07/2009(44) A/Victoria/361/2011(157) B/Brisbane/60/2008(Vic-9) B/Wisconsin/01/2010(Yam-9) B/Massachusetts/02/2012(Yam-2) 發病月份(2013/10) 2 7 9 發病月份(2013/11) 6 4 發病月份(2013/12) 27 104 13 144 發病月份(2014/1) 42 123 185 發病年齡(<4) 45 發病年齡(4~12) 81 109 發病年齡(13~18) 50 76 發病年齡(19~64) 38 124 發病年齡(>64) 16 19 其餘檢體狀況 直接入庫 PCR中 PCR失敗 製表日為2014/02/21 (依發病日製表)

Updated: 2014/03/02 國際間流感活動監測 中國大陸第8週全國流感陽性率20.9%(南方24.9%，北方14.4%)，流感活動呈下降趨勢，以H1N1型、B型病毒共同流行。 香港流感活躍度維持高水平，急診類流感就診率於2月初達高峰後持續下降，近期再度呈上升趨勢；流感病毒以H1N1型居多。 日本流感定點監測通報於第5週達高峰後呈下降趨勢，流感病毒以H1N1型為主。 歐洲流感活躍度維持高水平，今年第8週定點監測流感陽性率約33%；流感病毒以A型為主，其中H1N1型及H3N2型分佔58%、42%。 美國大部分地區流感活動持續減緩，今年第8週呼吸道檢體流感陽性率10.8%，陽性檢體中以H1N1型為主。 加拿大大部分地區流感活動持續減緩，今年第8週呼吸道檢體中流感陽性率14.3%，以H1N1型為主，B型病毒近期呈緩慢上升趨勢。 資料來源: 香港衛生防護中心、日本厚生勞働省、日本國立感染症研究所、 中國國家流感中心、ECDC、CDC，Public Health Agency of Canada

Updated: 2014/03/02 Summary for Influenza 上週新增121例流感併發症確定病例【40例H3N2、76例 H1N1、2例A未分型、3例B型】，新增10例經審查與流感相關死 亡病例【2例H3N2、7例H1N1、1例A未分型】；本流感季(自 2013/7/1起)累計共1189例流感併發症確定病例，其中381例需ICU 治療；經審查與流感相關死亡病例共60例(26例H3N2、32例H1N1 、 1例A未分型、1例B型)。 門急診類流感就診病例百分比連續兩週上升；第7週社區流感 病毒陽性率(38.4%)，較前一週(26.7%)上升，國內流感併發症個案 亦以H1N1感染為主，檢出之病毒型別為H3N2及H1N1均等(約各佔 4成)，B型流感有增加趨勢，近期鄰近國家流行病毒均以H1N1為 主，預期社區流行病毒將轉以H1N1為主。

附件二：疫情防治會議國際疫情簡報範例 Updated: 2014/03/02 H7N9流感疫情　 中國大陸廣東省、浙江省、湖南省、江蘇省共新增13例確診病例(其中1例死亡)，病例數以廣東省居多，其中11例(85%)具活禽接觸史、活禽市場暴露史。 入秋後(2013年10/1起)H7N9累計確認243例，其中浙江省92例、廣東省80例、福建省15例(其中1例浙江省移入)、江蘇省14例、上海市8例、湖南省15例、北京市2例、安徽省5例、廣西3例(其中1例廣東省移入)、貴州省1例(浙江省移入)、吉林省1例，香港5例(皆為廣東省移入)，馬來西亞1例(廣東省移入)，我國1例(江蘇省移入)。 全球自2013年迄今共378例確定病例，WHO於3/1公布115例死亡。 資料來源:廣東省衛生廳、湖南省衛生廳、浙江省衛生聽、江蘇省衛生廳 36 36

Updated: 2014/03/02 入秋後H7N9流感病例分布 全球自2013年迄今共378例確定病例

附件二：疫情防治會議國際疫情簡報範例 Updated: 2014/03/02 H7N9流感國內疫情　 國內疫情 上週國內新增9例H7N9流感通報病例，其中2例檢驗 中，餘H7N9均檢驗陰性(其中2例檢出H1N1流感、2 例檢出H3N2流感、餘陰性)。 國內自2013年4月3日起將「H7N9流感」列為第五類 傳染病，迄今累計共554例通報病例(其中56例為中國 大陸來台人士)，2例境外移入確定病例(含1例死亡病 例)，550例H7N9檢驗陰性(其中80例檢出H1N1流感、 56例檢出H3N2流感、13檢出B型流感)，2例檢驗中。 38 38 38

<4共 45位 通報 Gene_type Region Vaccination Inoculation year Number H1N1:INFAH3:INFB C7:A11:B60:BW:BM:N:P 北:中:南:東 1 100/10-101/09 2 0:1:1 0:0:0:1:0:0:0 1:1:0:0 101/10~ 7 0:7:0 0:7:0:0:0:0:0 4:1:2:0 0:2:0 0:0:0:0:0:0:2 1:0:1:0 Unvaccination 34 9:25:0 3:6:0:0:0:0:15 7:7:15:5 >64共 19位 0:1:0 0:0:0:0:0:0:1 0:0:1:0 18 2:15:1 2:10:1:0:0:0:5 6:3:8:1

其他參考資料 H3 H1 2013年底出現K180Q, I251V, A273T的第四個族群。 而203則是ATA 主要族群轉為 Y94H。 以及144,142小變異。 H1 1 in 2012 2 3 4 2013年底出現K180Q, I251V, A273T的第四個族群。 而203則是ATA

其他參考資料 Flu_B:Yamagata Flu_B:Victoria 數量太少看不出其他變化，只有A229V。 2013年初以Massachusetts(疫苗株)為主，2013-2014交界時以Wisconsin株為主。但數量太少看不出大變化。

合約實驗室檢驗結果-腸病毒 腸病毒 流行幅度低，以CA10為最多 簡化修改圖 加入CA10 分析結果 (herpangina較多)

附件二：疫情防治會議國際疫情簡報範例 Updated: 2013/12/20 國際間腸病毒疫情監測 香港今年手足口病活躍程度有所下降，急診就診千分比於6月達 高峰後持續下降，較前兩年低。今年截至10月定點監測共累計 972件手足口病檢體，以克沙奇病毒為主(佔56%)。 日本今年手足口病定醫平均報告數於第30週達高峰後持續下降 ；累計分析共1,639例手足口病患者病毒型別，以CA6型為主。 新加坡今年第49週通報628例手足口病，高於前5年同期平均 (331例)，已低於預警值(691例)，每週通報數緩慢下降。 44 資料來源：香港衛生防護中心、日本國立感染症研究所、新加坡衛生部

Updated: 2013/12/20 Summary for EV 第51週新增1例腸病毒71型重症確定病例，2013年截至目前共10例腸病毒重症確定病例(感染病毒型別6例為EV71、3例為CA6、1例Echo 30)，其中1例死亡(Echo 30)；腸病毒急診病例千分比(3.28‰)較前一週上升，仍高於預警值；目前社區主要流行病毒株為Coxsackie A (約占83%) ，於花蓮縣新增檢出1件EV71陽性檢體，持續監測疫情及流行病毒株變化。

CB2-2013 分析 157/282 amino acid of VP1 gene 20130910

Most recent CB2 isolates were reported as untypable NPEV. 2010-2013 Residue 110. Other mutations Prepare antiserum 分析 194/282 amino acid of VP1 gene