circularRNA 孙雅静 10化基
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引言 2012年 物理学 “上帝粒子”希格斯玻色子的发现 CircularRNA
目录 circRNA简介 circRNA结构 circRNA功能 研究展望
circRNA简介 信使RNA(messengerRNA,mRNA) 转运RNA(transferRNA,tRNA) 核糖体RNA(ribosomalRNA,rRNA) 微小RNA(microRNA,miRNA)
circRNA简介 miRNA在细胞生长和凋亡,血细胞分化,同源异形盒基因调节,神经元的极性,胰岛素分泌,大脑形态形成,心脏发生,胚胎后期发育等过程中发挥重要作用。 miR-273和lys-6编码的miRNA,参与线虫的神经系统发育过程; miR-430参与斑马鱼的大脑发育; miR-181控制哺乳动物血细胞分化为B细胞; miR-375调节哺乳动物胰岛细胞发育和胰岛素分泌; miR-143在脂肪细胞分化起作用; miR-196参与了哺乳动物四肢形成, miR-1与心脏发育有关。 对miRNA基因的分析,可能发现新的参与器官形成、胚胎发育和生长的调节因子,促进对癌症等人类疾病发病机制的理解 miR-21在胶质母细胞瘤中表达增加。 比正常组织高5-100倍 反义核酸的研究发现这个miRNA通过抑制凋亡而并非影响细胞增殖控制细胞生长,这预示着这个miRNA具有癌基因的功能。 在乳腺癌样品中表达也有增加,这个基因可能在肿瘤发生中起到广泛的作用。 最近的研究发现,miRNA表达与多种癌症相关 大约50%得到注解的miRNAs在基因组上定位于与肿瘤相关的脆性位点(fragile site)。这说明miRNAs在肿瘤发生过程中起至关重要的作用, 这些miRNAs所起的作用类似于抑癌基因和癌基因的功能, 有研究人员将miRNA命名为“oncomirs”。
是偶然还是必然? circRNA简介 2010年前后: 证明环状RNA比链状RNA稳定,并且含量十分惊人 1992年: 90年代以来:人类加紧了对miRNA研究 1980年 1990年 2000年 2010年 1979年: 真核细胞中RNA可以以环状的形式存在 Nature280: 339–340 1991年: 人体的细胞质中发现非线性的RNA 2006年: 使用RNaseR来证明了环状RNA的结构 近两年来: 人们发现环状RNA在生物体内这么稳定、大量存在是有原因的!
circRNA简介 为什么人们不研究呢? 1、传统的筛选方式容易忽视小分子或是结构规整的(环状)分子
circRNA结构 circRNA的形成
circRNA结构 结构的发现以及证实: Canonical 正常的链状RNA Scramble 混乱的RNA结构 (circRNA) RNaseR:RNA剪切酶R Julia Salzman, Charles Gawad PLosone1.Feb 2012
circRNA功能 对miRNA的调控功能
circRNA功能 最新Nature上两项研究都将焦点放在了由大约1500个核苷酸构成的一个环状大RNA上,存在于哺乳动物的脑细胞中。这些环状RNA可以阻断miR-7的调节作用。类似的研究也有关小鼠性别决定基因等的研究。 ☆miR-7 is a key regulator of various cancer pathways ☆implication of miR-7 in Parkinson’s disease by direct targeting of α-synuclein protein expression ☆ciRS-7 probably serves as a crucial factor significantly engaged in the functioning of neurons as well as a responsible candidate in neurological disorders and brain tumour development. miRNA-7 Attenuation in Schwannoma Tumors Stimulates Growth by Upregulating Three Oncogenic Signaling Pathways December 13, 2010 Cancer Reach
circRNA功能 工作机制: 如ciRs-7与miR-7有超过71个结合位点。 Natural RNA circles function as efficient microRNA sponges Nature LETTER 2013.3
研究展望 1、人们传统认识的一大挑衅! RNA多是环状?!!! RNA不仅仅是DNA与编码蛋白之间的一个平凡信使。 2、对疾病的认识更进一步。 3、再一次督促人类修正中心法则,在生化界是一个创世纪的发现 Nature Vol.280 26 July 1979
原谅我抓住最后机会再说点废话 DNA RNA 蛋白质 中心法则
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